Table 3 Genes showing SNPs and INDELs
Genes showing mutations | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
LIC10121 | LIC10339 | LIC10484 | LIC10580 | LIC10842 | LIC10874 | LIC12841 | LIC11070 | LIC11265 | LIC11311 | |
Sample | rsgA | clpC | thrC | msbA | dapA | RS04520 | dapL | dhaT | ||
1 | 623 | |||||||||
2 | 623 | |||||||||
3 | 623 | |||||||||
4 | 623 | |||||||||
8 | 623 | |||||||||
9 | 1123 | 629 | 623 | |||||||
10 | 623 | |||||||||
11 | 372 | 623 | ||||||||
12 | 623 | |||||||||
13 | 2207 | 293 | 220 | 623 | ||||||
14 | 623 | |||||||||
15 | 623 | |||||||||
16 | 930 | 107 | 623 | |||||||
17 | 902 | 623 | ||||||||
19 | 623 | |||||||||
20 | 623 | |||||||||
Genes showing mutations | ||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
LIC11335 | LIC11374 | LIC12764 | LIC11455 | LIC11604 | LIC11518 | LIC11570 | LIC11791 | LIC12870 | LIC12955 | LIC10974 | LIC13481 | |
Sample | groL | fliR | ilvB | mfd | pulD | recG | rplB | fruA | fadA | ycfH | ||
1 | 12 | 30 | 721 | |||||||||
2 | 666 | 30 | 721 | |||||||||
3 | 721 | |||||||||||
4 | 30 | 721 | ||||||||||
8 | 1373 | 30 | 721 | |||||||||
9 | 1819 | 30 | 721 | |||||||||
10 | 30 | 721 | ||||||||||
11 | 30 | 549 | 721 | |||||||||
12 | 1984 | 30 | 721 | |||||||||
13 | 1928 | 30 | 721 | |||||||||
14 | 30 | 721 | ||||||||||
15 | 704 | 30 | 721 | |||||||||
16 | 1586 | 30 | 721 | |||||||||
17 | 30 | 721 | ||||||||||
19 | 721 | |||||||||||
20 | 675 | 721 | ||||||||||