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Table 5 SCCmec- spa type combinations

From: Diversity of SCCmec elements and spa types in South African Staphylococcus aureus mecA-positive blood culture isolates

SCCmec type, n Spa type, n (%)
SCCmec type I isolates (n = 2) t015, t186 (n = 1, 50%, each).
SCCmec type II (n = 104) t012 (n = 71, 67.6%); t037 (n = 7, 6.7%); t021 (n = 4, 3.8%); t238 (n = 4, 3.8%); t1257 (n = 3, 2.9%); t018 (n = 2, 1.9%); t0121 (n = 1, 0.9%); t045 (n = 1, 0.9%); t064 (n = 1, 0.9%); t2526 (n = 1, 0.9%); t4864 (n = 1, 0.9%); t6330 (n = 1, 0.9%); t729 (n = 1, 0.9%); t840 (n = 1, 0.9%); t8636 (n = 1, 0.9%); t913 (n = 1, 0.9%); novel spa types: txAF, txAK, txAO, txAQ (n = 1, 0.9%, each).
SCCmec type III (n = 709) t037 (n = 656, 92.5%); t045 (n = 12, 1.7%); t1257 (n = 8, 1.1%); t012 (n = 8, 1.1%); t2029 (n = 4, 0.6%); t0421 (n = 2, 0.3%); t1476 (n = 2, 0.3%); t032 (n = 1, 0.1%); t127 (n = 1, 0.1%); t2293 (n = 1, 0.1%); t355 (n = 1, 0.1%); t932 (n = 1, 0.1%); t7962 (n = 1, 0.1%); t701 (n = 1, 0.1%); t1943 (n = 1, 0.1%); t4410 (n = 1, 0.1%); t5691 (n = 1, 0.1%); novel spa types: txAB, txAF, txAM, txAN, txAP, txAZ, txBD (n = 1, 0.1%, each).
SCCmec type IV (n = 451) IV-t1257 (n = 255, 56.5%); t064 (n = 47, 10.4%); t1973 (n = 23, 5.1%), t032 (n = 21, 4,7%); t1443 (n = 14, 3.1%); t037 (n = 12, 2.7%); t022 (n = 5, 1.1%); t1467 (n = 5, 1.1%), t118 (n = 4, 0.9%,); t294 (n = 4, 0.9%,); t4833 (n = 4, 0.9%); t451 (n = 3, 0.7%); t891 (n = 3, 0.7%); t012 (n = 2, 0.4%); t105 (n = 2, 0.4%); t2293 (n = 2, 0.4%); t304 (n = 2, 0.4%); t718 (n = 2, 0.4%); t008 (n = 1, 0.2%); t015 (n = 1, 0.2%); t018 (n = 1, 0.2%); t0379 (n = 1, 0.2%); t045 (n = 1, 0.2%); t059 (n = 1, 0.2%); t1555 (n = 1, 0.2%); t1774 (n = 1, 0.2%); t230 (n = 1, 0.2%); t272 (n = 1, 0.2%); t2724 (n = 1, 0.2%); t324 (n = 1, 0.2%); t379 (n = 1, 0.2%); t4268 (n = 1, 0.2%); t432 (n = 1, 0.2%); t4864 (n = 1, 0.2%); t5691 (n = 1, 0.2%); t578 (n = 1, 0.2%); t951 (n = 1, 0.2%); novel spa types: txAA (n = 5, 1.1%), txAC and txAI (n = 2, 0.4%), each), txAD, txAE, txAG, txAJ, txAL, txAM, txAN, txAS, txAO, txBA, txBB, txBC txBE (n = 1, 0.2%, each).
SCCmec type V (n = 3) t1476, t045, t037 (n = 1, 33.3%, each)
SCCmec type VI (n = 5) t1813 (n = 2, 80%); t174 (n = 1, 20%); t223 (n = 1, 20%); novel spa type txAD (n = 1, 20%).
Unknown SCCmec types (n = 190) t045 (n = 114, 60%); t037 (n = 22, 11.6%); t1476 (n = 9, 4.7%); t018 (n = 6, 3.2%); t148 (n = 5, 2.6%); t012 (n = 3, 1.6%); t1257 (n = 3, 1.6%); t13165 (n = 3, 1.6%);, t008 (n = 2, 1.1%,); t032 (n = 2, 1.1%,); t5691 (n = 2, 1.1%,); t891 (n = 2, 1.1%,); t021 (n = 1, 0.5%); t064 (n = 1, 0.5%); t10304 (n = 1, 0.5%); t1096 (n = 1, 0.5%); t1107 (n = 1, 0.5%); t11775 (n = 1, 0.5%); t2409 (n = 1, 0.5%); t463 (n = 1, 0.5%); t498 (n = 1, 0.5%); t5483 (n = 1, 0.5%); t6931 (n = 1, 0.5%); t9061 (n = 1, 0.5%); novel spa types: txAH (n = 2, 1.1%), txAD (n = 1, 0.5%), txAF (n = 1, 0.5%), txAL (n = 1, 0.5%).