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Table 4 Molecular characteristics of meningococcal carriage isolates in 4 kebeles in Arba Minch, Southern Ethiopia

From: Prevalence and epidemiology of meningococcal carriage in Southern Ethiopia prior to implementation of MenAfriVac, a conjugate vaccine

Sero-group

ST-complex

ST

PorA

FetA

n

Kebelea

A

B

C

D

B

35

35

P1.22-1,14

F4-1

1

   

1

10450

P1.22-1,14

F4-1

1

1

C

103

11592

P1.5-1,10-4

F3-9

5

  

2

3

 

35

35

P1.22-1,14

F4-1

1

   

1

 

175

8447

P1.5-1,2-2

F5-8

1

1

   

W

11

11

P1.5,2

F1-1

26

12

7

5

2

    

F1-7

1

 

1

  
  

2724

P1.5,2

F1-1

1

1

   
  

7849

P1.5,2

F1-1

1

1

   

X

181

181

P1.5-1,10-1

F3-22

4

  

4

 
   

P1.5-1,10-1

F1-7

2

  

2

 
   

P1.5-1,10-1

F4-23

1

 

1

  
  

11372

P1.5-1,10-1

F4-23

48

2

12

21

13

  

11591

P1.5-1,10-1

F4-23

6

  

1

5

 

41/44

207

P1.12-1,13-2

F5-169

3

 

1

2

 
    

F1-7

2

  

2

 
    

F1-21

1

  

1

 
    

F3-60

1

  

1

 
  

1053

P1.12-1,13-2

F5-169

1

  

1

 

Y

167

2880

P1.5-1,10-1

F1-3

8

3

3

1

1

  

767

P1.5-1,10-1

F1-3

1

  

1

 

NG

167

2880

P1.5-1,10-8

F1-3

9

1

2

5

1

 

175

175

P1.22-11,15-25

F5-1

1

 

1

  
   

P1.22-11,15-56

F5-1

3

  

3

 
  

8447

P1.5-1,2-2

F5-8

1

  

1

 
 

178

178

P1.19,15

F5-8

1

   

1

 

181

11372

P1.5-1,10-1

F4-23

1

   

1

 

192

192

P1.18-11,42-1

Neg

284

79

77

118

10

  

11598

P1.18-11,42-1

Neg

1

  

1

 
  

11642

P1.18-11,42-1

Neg

1

  

1

 
 

198

198

P1.18,25-11

F5-5

3

 

2

 

1

   

P1.25-11,38-1

F5-5

1

 

1

  
  

11741

P1.18,25-37

F1-7

1

   

1

   

P1.18,25-65

F1-7

2

 

1

 

1

 

35

35

P1.22-1,14

F4-1

4

  

1

3

 

53

53

P1.7,3

F1-7

2

  

2

 
   

P1.7,30

F1-3

2

  

2

 
    

F1-49

1

  

1

 
    

F1-7

7

 

2

5

 
    

F3-69

1

 

1

  
   

P1.7,30-2

F1-215

1

  

1

 
    

F1-7

4

 

1

3

 
    

F2-28

1

 

1

  
    

F5-9

1

  

1

 
   

P1.7,30-3

F1-31

1

 

1

  
    

F1-7

5

  

5

 
   

P1.7,30-4

F1-7

1

  

1

 
   

P1.7,30-4

F1-7

1

  

1

 
   

P1.7-11,30

F1-21

2

 

2

  
    

F3-69

1

  

1

 
    

F6-6

1

  

1

 
   

P1.7-11,30-2

F1-21

1

 

1

  
   

P1.7-11,30-3

F1-3

1

  

1

 
   

P1.7-2,30

F1-182

2

 

2

  
   

P1.7-2,30-3

F1-7

2

 

2

  
   

P1.7-2,30-6

F1-7

1

 

1

  
  

2075

P1.7,30

F1-113

1

  

1

 
   

P1.7-2,30

F1-153

2

2

   
    

F3-28

1

 

1

  
   

P1.7-2,30-3

F1-153

3

3

   
   

P1.7-2,30-5

F1-153

1

1

   
   

P1.7-54,30

F1-24

1

  

1

 
  

7389

P1.7-2,30

F1-7

1

 

1

  
  

11594

P1.7,30-2

F1-7

1

  

1

 
 

UAb

11587

P1.18-1,3-8

F4-72

1

   

1

  

P1.18-11,42-1

F5-102

1

  

1

 
 

11595

P1.18-1,3

F4-72

4

  

4

 
 

11597

P1.22-11,15-25

F1-36

2

  

2

 
 

11624

P1.18-1,3

F4-72

1

  

1

 
 

11638

P1.18-1,3-8

F4-72

1

  

1

 
 

UA

11593

P1.22-1,14

F5-19

1

   

1

  

11617

P1.22-11,15-57

F5-7

2

   

2

  1. ST sequence type, CC clonal complex, n number of isolates, NG non-groupable, UA unassigned to any clonal complex, Neg negative
  2. aKebele: Genta Mechie (A), Zigiti Mechie (B), Gatse (C) and Kolla Shelle (D)
  3. bUA cluster related to ST-11587