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Table 1 Spoligotypes of Mycobacterium tuberculosis strains in this study (n = 1017)

From: Characterization of Mycobacterium tuberculosis isolates from Hebei, China: genotypes and drug susceptibility phenotypes

No. Spoligotype SITa Familyb N(%)c
1 □□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□■■■■■■■■■ 1 Beijing 863(84.9)
2 □□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□■■■■■□■■■ 190 Beijing 18(1.8)
3 □□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□■■■■□■■■■ 255 Beijing 2(0.2)
4 □□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□■■□□■■■■■ 260 Beijing 4(0.4)
5 □□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□■■□■■■■■■ 265 Beijing 3(0.3)
6 □□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□■■■■■■■ 269 Beijing 6(0.6)
7 □□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□■■■□■■■ 406 Beijing 1(0.1)
8 □□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□■■■■■□□■■ 541 Beijing 2(0.2)
9 □□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□■□■■■■■■■ 621 Beijing 4(0.4)
10 □□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□■■■□■■■■■ 632 Beijing 2(0.2)
11 □□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□■■■■■■□■■ 941 Beijing 2(0.2)
12 □□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□■■■■■□□□□ 1311 Beijing 2(0.2)
13 □□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□■■■□□■■■■ 1364 Beijing 1(0.1)
14 □□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□■■■■■■■□■ 1674 Beijing 1(0.1)
15 □□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□■■□□□□□□□ 2101 Beijing 3(0.3)
16 □□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□■■■■■■■■□ 2610 Beijing 2(0.2)
17 □□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□■■■□□□■■■ Orphan Beijing 1(0.1)
18 □□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□■■■□■□■■■ Orphan Beijing 1(0.1)
19 ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■■■■■ 53 T1 20(2.0)
20 ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□□■■■■■■ 240 T1 1(0.1)
21 ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□□□□□□■■ 956 T1 2(0.2)
22 ■□■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■■■■■ 334 T1 2(0.2)
23 ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□□□□□□□□ 1793 T1 1(0.1)
24 ■■■■■■■■■■■□■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■■■■■ 498 T1 1(0.1)
25 ■■■■■■■■■■■■□□■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■■■■■ 131 T1 1(0.1)
26 ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□□□■■■■■■■□□□□■■■■■■■ 1688 T1 1(0.1)
27 ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□■■■■■■■■■■■□□□□■■■■■■■ 291 T1 1(0.1)
28 ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□■■■■■□□□□■■■■■■■ 1626 T1 1(0.1)
29 ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□■■■□□□□■■■■■■■ 462 T1 1(0.1)
30 ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□■■□□□□□□□■■■■ Orphan T1 2(0.2)
31 ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□■□■■■■■ 520 T1 1(0.1)
32 ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■■■■□ 522 T1 3(0.3)
33 ■■■■■■□□□□□□□□□□□□■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■■■■■ 280 T1-RUS2 1(0.1)
34 ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■□■■■ 52 T2 9(0.9)
35 ■■■□■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■□■■■ 848 T2 1(0.1)
36 □□■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■□■■■ 1613 T2 1(0.1)
37 ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□□□■□■■■ Orphan T2 1(0.1)
38 ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□■■■■■■■■□□□□■■■□■■■ Orphan T2 1(0.1)
39 ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□□□■■□□□□■■■□■■■ 233 T2 2(0.2)
40 ■■■■■■■■■■■■□■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■■■■■ 37 T3 2(0.2)
41 ■□■■■■■■■■■■□■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■■■■■ Orphan T3 3(0.3)
42 ■■■■■■■■■■■■■■■■■■□■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■■■■■ 40 T4 1(0.1)
43 ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□■■■■■■■■■□□□□■■■■■■■ 44 T5 1(0.1)
44 ■□□□□□■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■■■■■■□□□□■■■■■■■ 961 LAM1 1(0.1)
45 ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■■■■■■□□□□■■■■■■■ 42 LAM9 1(0.1)
46 ■■■■■■■■■■■■■□□□□□□□□□□□■■■■■■■■□□□□■■■■■■■ 803 LAM9 1(0.1)
47 ■■■■■■■■■■■■■□□□□■□□□□□□■■■■■■■■□□□□■■■■■■■ 2191 LAM9 1(0.1)
48 ■■■■■■■■■■■□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□ 2379   1(0.1)
49 ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□■■■■■■■■■ 54 MANU2 4(0.4)
50 ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□■■□■■■■■■■■□□■■■■■■■■■ 1523 MANU2 1(0.1)
51 ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□■■■■■■■■■■■□□■■■■■■■■■ 1192 MANU2 2(0.2)
52 ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□■□□□□■■■■■■■ 50 H3 3(0.3)
53 ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□■■■■■■■■■□■□□□□■■■■■■■ 268 H3 2(0.2)
54 ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□□□□□■□□□□■■■■■■■ 791 H3 1(0.1)
55 ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□□■□□□□■■■■■■■ 1908 H3 1(0.1)
56 ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□□□□□□□□□■■■■■■■ 602 U 1(0.1)
57 ■□■■■■■■■■■■□■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■□■■■ Orphan AMBIGOUS:T3T2 3(0.3)
58 ■■■■■■■□■■■■■■■■□■■■□■■■■■■■■■■■□□■■■■■■■■■ - New 1(0.1)
59 ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□■■■■■■□□□□□□■■■■■ - New 1(0.1)
60 ■□□■■■□□■■■■■■■■■■■■■■■□□■■■□□□□□□■■□□□■□■■ - New 1(0.1)
61 ■■■■□■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□□□□□□□□□□□□ - New 1(0.1)
62 ■■■■■■■■■■■■□□■■■■■■■■■■■■■□■□■■□□■■■■■■■■■ - New 1(0.1)
63 □□□□■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□□■■■□■■■ - New 1(0.1)
64 ■■■■■■■■■■■■□■■■■■■■■■■■■■■■■□■■□□□□■■□■■■■ - New 1(0.1)
65 ■□■■■■■■■■■■□■■■□■■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■■■■■ - New 1(0.1)
66 ■□□□□□□■■■■□□■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■■■■■ - New 1(0.1)
67 ■□■■■■■■■■■■□□□□■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■□□■■■ - New 1(0.1)
68 ■□■■■■■■■■■■■■■■■■□■■□□□■■■■■■■■■■■■■■■□■■■ - New 1(0.1)
69 ■■■■■■□□□■■■■■■■■■■■■■□□□□□□□□□■□□□□■■■■■■■ - New 1(0.1)
70 ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□■■■□□□□□□□□■■■□ - New 1(0.1)
71 □□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□■■■■■□■□■ - New 1(0.1)
72 □□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□■■■□□□□□□ - New 1(0.1)
  1. a SIT spoligotype international type
  2. bSpoligotype families as assigned in SpolDB4.0
  3. cThe number of the strains with a common SIT