Skip to main content

Table 1 Spoligotypes of Mycobacterium tuberculosis strains in this study (n = 1017)

From: Characterization of Mycobacterium tuberculosis isolates from Hebei, China: genotypes and drug susceptibility phenotypes

No.

Spoligotype

SITa

Familyb

N(%)c

1

â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– â– â– 

1

Beijing

863(84.9)

2

â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â–¡â– â– â– 

190

Beijing

18(1.8)

3

â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â–¡â– â– â– â– 

255

Beijing

2(0.2)

4

â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â–¡â–¡â– â– â– â– â– 

260

Beijing

4(0.4)

5

â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â–¡â– â– â– â– â– â– 

265

Beijing

3(0.3)

6

â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– 

269

Beijing

6(0.6)

7

â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â–¡â– â– â– 

406

Beijing

1(0.1)

8

â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â–¡â–¡â– â– 

541

Beijing

2(0.2)

9

â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â– â–¡â– â– â– â– â– â– â– 

621

Beijing

4(0.4)

10

â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â–¡â– â– â– â– â– 

632

Beijing

2(0.2)

11

â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â–¡â– â– 

941

Beijing

2(0.2)

12

â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡

1311

Beijing

2(0.2)

13

â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â–¡â–¡â– â– â– â– 

1364

Beijing

1(0.1)

14

â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– â–¡â– 

1674

Beijing

1(0.1)

15

â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡

2101

Beijing

3(0.3)

16

â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡

2610

Beijing

2(0.2)

17

â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â–¡â–¡â–¡â– â– â– 

Orphan

Beijing

1(0.1)

18

â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â–¡â– â–¡â– â– â– 

Orphan

Beijing

1(0.1)

19

â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– 

53

T1

20(2.0)

20

â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– 

240

T1

1(0.1)

21

â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– 

956

T1

2(0.2)

22

â– â–¡â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– 

334

T1

2(0.2)

23

â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡

1793

T1

1(0.1)

24

â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– 

498

T1

1(0.1)

25

â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– 

131

T1

1(0.1)

26

â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– 

1688

T1

1(0.1)

27

â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– 

291

T1

1(0.1)

28

â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â– â– â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– 

1626

T1

1(0.1)

29

â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– 

462

T1

1(0.1)

30

â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– 

Orphan

T1

2(0.2)

31

â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â– â–¡â– â– â– â– â– 

520

T1

1(0.1)

32

â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â–¡

522

T1

3(0.3)

33

â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– 

280

T1-RUS2

1(0.1)

34

â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â–¡â– â– â– 

52

T2

9(0.9)

35

â– â– â– â–¡â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â–¡â– â– â– 

848

T2

1(0.1)

36

â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â–¡â– â– â– 

1613

T2

1(0.1)

37

â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â– â–¡â– â– â– 

Orphan

T2

1(0.1)

38

â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â–¡â– â– â– 

Orphan

T2

1(0.1)

39

â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â–¡â– â– â– 

233

T2

2(0.2)

40

â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– 

37

T3

2(0.2)

41

â– â–¡â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– 

Orphan

T3

3(0.3)

42

â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– 

40

T4

1(0.1)

43

â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– 

44

T5

1(0.1)

44

â– â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– 

961

LAM1

1(0.1)

45

â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– 

42

LAM9

1(0.1)

46

â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– 

803

LAM9

1(0.1)

47

â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â– â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– 

2191

LAM9

1(0.1)

48

â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡

2379

 

1(0.1)

49

â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– â– â– 

54

MANU2

4(0.4)

50

â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â– â– â–¡â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– â– â– 

1523

MANU2

1(0.1)

51

â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– â– â– 

1192

MANU2

2(0.2)

52

â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â– â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– 

50

H3

3(0.3)

53

â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â– â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– 

268

H3

2(0.2)

54

â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â– â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– 

791

H3

1(0.1)

55

â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â– â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– 

1908

H3

1(0.1)

56

â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– 

602

U

1(0.1)

57

â– â–¡â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â–¡â– â– â– 

Orphan

AMBIGOUS:T3T2

3(0.3)

58

â– â– â– â– â– â– â– â–¡â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â– â– â– â–¡â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– â– â– 

-

New

1(0.1)

59

â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– 

-

New

1(0.1)

60

â– â–¡â–¡â– â– â– â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â–¡â–¡â–¡â– â–¡â– â– 

-

New

1(0.1)

61

â– â– â– â– â–¡â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡

-

New

1(0.1)

62

â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â– â–¡â– â– â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– â– â– 

-

New

1(0.1)

63

â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â–¡â– â– â– 

-

New

1(0.1)

64

â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â–¡â– â– â– â– 

-

New

1(0.1)

65

â– â–¡â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â– â– â– â–¡â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– 

-

New

1(0.1)

66

â– â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– 

-

New

1(0.1)

67

â– â–¡â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â–¡â–¡â– â– â– 

-

New

1(0.1)

68

â– â–¡â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â– â– â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â– â– â– 

-

New

1(0.1)

69

â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â– â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– 

-

New

1(0.1)

70

â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â–¡

-

New

1(0.1)

71

â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â–¡â– â–¡â– 

-

New

1(0.1)

72

â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡

-

New

1(0.1)

  1. a SIT spoligotype international type
  2. bSpoligotype families as assigned in SpolDB4.0
  3. cThe number of the strains with a common SIT