Skip to main content

Table 1 The most likely contact probabilities under the limited mixing between dormitories (w = 25 %)

From: Construction of the influenza A virus transmission tree in a college-based population: co-transmission and interactions between influenza A viruses

Infectee i

Infector j

p ij

Infectee i

Infector j

p ij

1 (1)

--

 

35 (1)

16 (0)

1.0

2 (0)

1 (1)*

1.0

36 (1)

19 (1)

1.0

3 (1)

1 (1)

1.0

37 (2)

2 (0)

0.001602

4 (1)

1 (1)

1.0

37 (2)

5 (0)

0.001602

5 (0)

1 (1)*

1.0

37 (2)

11 (2)

0.08588

6 (1)

2 (0)

1.0

37 (2)

12 (2)

0.08588

7 (1)

2 (0)

1.0

37 (2)

13 (2)

0.08588

8 (1)

4 (1)

1.0

37 (2)

14 (2)

0.08588

9 (1)

5 (0)

1.0

37 (2)

15 (0)

0.08588

10 (1)

5 (0)

1.0

37 (2)

16 (0)

0.08588

11 (2)

2 (0)

0.5

37 (2)

21 (0)

0.08588

11 (2)

5 (0)

0.5

37 (2)

23 (2)

0.08588

12 (2)

2 (0)

0.5

37 (2)

24 (2)

0.08588

12 (2)

5 (0)

0.5

37 (2)

25 (2)

0.074625

13 (2)

2 (0)

0.5

37 (2)

26 (2)

0.074625

13 (2)

5 (0)

0.5

37 (2)

27 (0)

0.074625

14 (2)

2 (0)

0.5

38 (1)

1 (1)

3.67E-11

14 (2)

5 (0)

0.5

38 (1)

2 (0)

2.53E-05

15 (0)

1 (1)*

1.0

38 (1)

3 (1)

2.53E-05

16 (0)

2 (0)

1.0

38 (1)

4 (1)

2.53E-05

17 (1)

3 (1)

1.0

38 (1)

5 (0)

2.53E-05

18 (1)

3 (1)

1.0

38 (1)

6 (1)

0.001691

19 (1)

4 (1)

1.0

38 (1)

7 (1)

0.001691

20 (1)

5 (0)

1.0

38 (1)

8 (1)

0.001691

21 (0)

5 (0)

1.0

38 (1)

9 (1)

0.001691

22 (1)

1 (1)

1.0

38 (1)

10 (1)

0.001691

23 (2)

2 (0)

0.5

38 (1)

15 (0)

0.024945

23 (2)

5 (0)

0.5

38 (1)

16 (0)

0.024945

24 (2)

2 (0)

0.5

38 (1)

17 (1)

0.024945

24 (2)

5 (0)

0.5

38 (1)

18 (1)

0.024945

25 (2)

2 (0)

0.011463

38 (1)

19 (1)

0.024945

25 (2)

5 (0)

0.011463

38 (1)

20 (1)

0.024945

25 (2)

11 (2)

0.144752

38 (1)

21 (0)

0.024945

25 (2)

12 (2)

0.144752

38 (1)

22 (1)

0.024945

25 (2)

13 (2)

0.144752

38 (1)

27 (0)

0.090627

25 (2)

14 (2)

0.144752

38 (1)

28 (1)

0.090627

25 (2)

15 (0)

0.036188

38 (1)

29 (1)

0.090627

25 (2)

16 (0)

0.036188

38 (1)

30 (1)

0.090627

25 (2)

21 (0)

0.036188

38 (1)

31 (1)

0.090627

25 (2)

23 (2)

0.144752

38 (1)

32 (1)

0.090627

25 (2)

24 (2)

0.144752

38 (1)

33 (1)

0.090627

26 (2)

2 (0)

0.011463

38 (1)

35 (1)

0.07875

26 (2)

5 (0)

0.011463

38 (1)

36 (1)

0.07875

26 (2)

11 (2)

0.144752

39 (2)

2 (0)

1.70E-10

26 (2)

12 (2)

0.144752

39 (2)

5 (0)

1.70E-10

26 (2)

13 (2)

0.144752

39 (2)

11 (2)

0.00047

26 (2)

14 (2)

0.144752

39 (2)

12 (2)

0.00047

26 (2)

15 (0)

0.036188

39 (2)

13 (2)

0.00047

26 (2)

16 (0)

0.036188

39 (2)

14 (2)

0.00047

26 (2)

21 (0)

0.036188

39 (2)

15 (0)

0.000118

26 (2)

23 (2)

0.144752

39 (2)

16 (0)

0.000118

26 (2)

24 (2)

0.144752

39 (2)

21 (0)

0.000118

27 (0)

15 (0)

1.0

39 (2)

23 (2)

0.00047

28 (1)

15 (0)

0.5

39 (2)

24 (2)

0.00047

28 (1)

16 (0)

0.5

39 (2)

25 (2)

0.031389

29 (1)

16 (0)

0.5

39 (2)

26 (2)

0.031389

29 (1)

16 (0)

0.5

39 (2)

27 (2)

0.007847

30 (1)

19 (1)

1.0

39 (2)

34 (2)

0.4631

31 (1)

19 (1)

0.5

39 (2)

37 (2)

0.4631

31 (1)

20 (1)

0.5

40 (2)

2 (0)

8.39E-15

32 (1)

21 (0)

1.0

40 (2)

5 (0)

8.39E-15

33 (1)

21 (0)

1.0

40 (2)

11 (2)

8.98E-07

34 (2)

2 (0)

0.000535

40 (2)

12 (2)

8.98E-07

34 (2)

5 (0)

0.000535

40 (2)

13 (2)

8.98E-07

34 (2)

11 (2)

0.114752

40 (2)

14 (2)

8.98E-07

34 (2)

12 (2)

0.114752

40 (2)

15 (0)

2.24E-07

34 (2)

13 (2)

0.114752

40 (2)

16 (0)

2.24E-07

34 (2)

14 (2)

0.114752

40 (2)

21 (0)

2.24E-07

34 (2)

15 (0)

0.028688

40 (2)

23 (2)

8.98E-07

34 (2)

16 (0)

0.028688

40 (2)

24 (2)

8.98E-07

34 (2)

21 (0)

0.028688

40 (2)

25 (2)

0.000308

34 (2)

23 (2)

0.114752

40 (2)

26 (2)

0.000308

34 (2)

24 (2)

0.114752

40 (2)

27 (0)

7.71E-05

34 (2)

25 (2)

0.099713

40 (2)

34 (2)

0.020572

34 (2)

26 (2)

0.099713

40 (2)

37 (2)

0.020572

34 (2)

27 (0)

0.024928

40 (2)

39 (2)

0.958157

  1. The numbers in the brackets are the type of infection: 0, 1, 2 representing co-infection, infection with pandemic A/H1N1 virus alone and infection with seasonal A/H3N2 virus alone, respectively. The three effective contacts from the index pandemic A/H1N1 to co-infection that are marked with asterisk are as given by Liu et al. [12]. The maximum likelihood estimates of Weibull distribution parameters for the generation time are scale =1.93 and shape = 2.49
Back to article page

BMC Infectious Diseases

ISSN: 1471-2334

Contact us