Skip to main content

Advertisement

Table 3 Hunter Gaston Discriminatory Index (HGDI) of each locus of Multiple Loci VNTR Analysis (MLVA) for the whole sample and for the two major families

From: A first assessment of the genetic diversity of Mycobacterium tuberculosis complex in Cambodia

  ETRA ETRB ETRC ETRD ETRE MIRU02 MIRU10 MIRU16 MIRU20 MIRU23 MIRU24 MIRU26
Total 0,67 0,68 0,14 0,79 0,40 0,04 0,62 0,57 0,06 0,27 0,49 0,52
EAI 0,73 0,56 0,23 0,73 0,38 0,03 0,24 0,18 0,06 0,38 0,03 0,03
Beijing 0,07 0,00 0,00 0,13 0,13 0,00 0,51 0,50 0,00 0,00 0,00 0,37
  MIRU27 MIRU39 MIRU40 Mtub04 Mtub21 Mtub29 Mtub30 Mtub34 Mtub39 Qub11b Qub26 Qub4156
Total 0,27 0,24 0,38 0,60 0,65 0,47 0,41 0,02 0,77 0,62 0,69 0,45
EAI 0,18 0,12 0,30 0,25 0,62 0,03 0,00 0,00 0,66 0,30 0,53 0,03
Beijing 0,33 0,30 0,34 0,47 0,45 0,00 0,00 0,00 0,13 0,40 0,59 0,28