Skip to main content

Table 3 Identification of fungi isolated from indoor air by the array and by sequence analysis of the ITS and D1/D2 domain

From: Rapid identification of allergenic and pathogenic molds in environmental air by an oligonucleotide array

Strain no.a

Species identification by

 

Array hybridization

ITS sequence (%)a

D1/D2 sequence (%)a

Best match

1

Cladosporium cladosporioides

Cladosporium cladosporioides (99.4)

Cladosporium cladosporioides (99.6)

Cladosporium cladosporioides

3

Aspergillus versicolor

Aspergillus versicolor (100)

Aspergillus versicolor (99.0)

Aspergillus versicolor

5

Aspergillus niger

Aspergillus niger (100)

Aspergillus niger (100)

Aspergillus niger

12

Acremonium strictum b

Acremonium implicatum (100)

Acremonium sp. (97.8)

Acremonium implicatum

13

Cladosporium cladosporioides

Cladosporium cladosporioides (100)

Cladosporium cladosporioides (100)

Cladosporium cladosporioides

28

Alternaria alternata

Alternaria alternata (100)

Alternaria alternata (98.6)

Alternaria alternata

33

Aureobasidium pullulans

Aureobasidium pullulans (100)

Aureobasidium pullulans (98.2)

Aureobasidium pullulans

35

Aspergillus flavus

Aspergillus flavus (100)

Aspergillus flavus (100)

Aspergillus flavus

38

Aspergillus flavus

Aspergillus flavus (99.8)

Aspergillus flavus (99.8)

Aspergillus flavus

41

Cladosporium cladosporioides

Cladosporium cladosporioides (100)

Cladosporium cladosporioides (99.6)

Cladosporium cladosporioides

42

Cladosporium cladosporioides

Cladosporium cladosporioides (99.8)

Cladosporium cladosporioides (99.8)

Cladosporium cladosporioides

43

Cladosporium cladosporioides

Cladosporium cladosporioides (100)

Cladosporium cladosporioides (99.8)

Cladosporium cladosporioides

44

Cladosporium cladosporioides

Cladosporium cladosporioides (100)

Cladosporium cladosporioides (100)

Cladosporium cladosporioides

45

Cladosporium cladosporioides

Cladosporium cladosporioides (100)

Cladosporium cladosporioides (99.6)

Cladosporium cladosporioides

47

Cladosporium cladosporioides

Cladosporium cladosporioides (100)

Cladosporium cladosporioides (99.6)

Cladosporium cladosporioides

48

Cladosporium cladosporioides

Cladosporium cladosporioides (100)

Cladosporium cladosporioides (99.6)

Cladosporium cladosporioides

49

Aspergillus versicolor

Aspergillus versicolor (99.8)

Aspergillus versicolor (99.3)

Aspergillus versicolor

50

Aspergillus versicolor

Aspergillus versicolor (100)

Aspergillus versicolor (99.3)

Aspergillus versicolor

52

Aspergillus versicolor

Aspergillus versicolor (99.8)

Aspergillus versicolor (99.1)

Aspergillus versicolor

55

Aspergillus versicolor

Aspergillus versicolor (100)

Aspergillus versicolor (99.8)

Aspergillus versicolor

56

Aspergillus versicolor

Aspergillus versicolor (100)

Aspergillus versicolor (98.6)

Aspergillus versicolor

58

Aspergillus versicolor

Aspergillus versicolor (100)

Aspergillus versicolor (99.1)

Aspergillus versicolor

59

Aspergillus versicolor

Aspergillus versicolor (100)

Aspergillus versicolor (99.3)

Aspergillus versicolor

60

Aspergillus versicolor

Aspergillus versicolor (100)

Aspergillus versicolor (99.1)

Aspergillus versicolor

64

Aspergillus niger

Aspergillus niger (99.8)

Aspergillus niger (99.1)

Aspergillus niger

67

Aspergillus niger

Aspergillus niger (99.8)

Aspergillus niger (99.6)

Aspergillus niger

68

Aspergillus niger

Aspergillus niger (99.8)

Aspergillus niger (100)

Aspergillus niger

  1. aValues in parentheses are percentages of sequence similarities of the test isolates with the best-scoring sequences in the GenBank database.
  2. bThe strain was misidentified by array hybridization.