Table 2 Performance evaluation of BSI-HMGS in the detection of clinical blood culture samples
Pathogens | HMGS | Reference results | PPA | NPA | OPA | |
|---|---|---|---|---|---|---|
|  | + | − | ||||
K. pneumoniae | + | 63 | 0 | 0.984 | 1.000 | 0.998 |
|  | − | 1 | 462 |  |  |  |
B. cepacia | + | 1 | 0 | 1.000 | 1.000 | 1.000 |
|  | − | 0 | 525 |  |  |  |
P. mirabilis | + | 3 | 0 | 1.000 | 1.000 | 1.000 |
|  | − | 0 | 523 |  |  |  |
M. catarrhalis | + | 0 | 0 | NA | NA | NA |
|  | − | 0 | 526 |  |  |  |
S. marcescens | + | 13 | 0 | 1.000 | 1.000 | 1.000 |
|  | − | 0 | 513 |  |  |  |
H. influenzae | + | 1 | 0 | 1.000 | 1.000 | 1.000 |
|  | − | 0 | 525 |  |  |  |
P. aeruginosa | + | 16 | 0 | 1.000 | 1.000 | 1.000 |
|  | − | 0 | 510 |  |  |  |
E. cloacae complex | + | 9 | 0 | 1.000 | 1.000 | 1.000 |
− | 0 | 517 |  |  |  | |
E. coli | + | 56 | 0 | 1.000 | 1.000 | 1.000 |
|  | − | 0 | 470 |  |  |  |
A. baumannii | + | 14 | 0 | 0.933 | 1.000 | 0.998 |
|  | − | 1 | 511 |  |  |  |
S. maltophilia | + | 10 | 0 | 1.000 | 1.000 | 1.000 |
|  | − | 0 | 516 |  |  |  |
S. enterica | + | 2 | 0 | 1.000 | 1.000 | 1.000 |
|  | − | 0 | 524 |  |  |  |
Staphylococcus | + | 56 | 0 | 0.966 | 1.000 | 0.996 |
|  | − | 2 | 468 |  |  |  |
S. aureus | + | 36 | 0 | 1.000 | 1.000 | 1.000 |
|  | − | 0 | 490 |  |  |  |
Streptococcus | + | 7 | 0 | 0.875 | 1.000 | 0.998 |
|  | − | 1 | 516 |  |  |  |
S. pyogenes | + | 1 | 0 | 1.000 | 1.000 | 1.000 |
|  | − | 0 | 525 |  |  |  |
S. agalactiae | + | 4 | 0 | 1.000 | 1.000 | 1.000 |
|  | − | 0 | 522 |  |  |  |
S. pneumoniae | + | 2 | 0 | 1.000 | 1.000 | 1.000 |
|  | − | 0 | 524 |  |  |  |
E. faecalis | + | 15 | 0 | 1.000 | 1.000 | 1.000 |
|  | − | 0 | 511 |  |  |  |
E. faecium | + | 28 | 0 | 1.000 | 1.000 | 1.000 |
|  | − | 0 | 498 |  |  |  |
C.albicans | + | 40 | 0 | 0.976 | 1.000 | 0.998 |
|  | − | 1 | 485 |  |  |  |
C. tropicalis | + | 8 | 0 | 1.000 | 1.000 | 1.000 |
|  | − | 0 | 518 |  |  |  |
C. parapsilosis | + | 19 | 0 | 1.000 | 1.000 | 1.000 |
|  | − | 0 | 507 |  |  |  |
C. glabrata | + | 17 | 0 | 1.000 | 1.000 | 1.000 |
|  | − | 0 | 509 |  |  |  |