Skip to main content

Table 5 Comparison of posterior estimates of model parameters

From: Using outbreak data to estimate the dynamic COVID-19 landscape in Eastern Africa

Model

Posterior estimates

01–14 Apr

15 Apr–03 May

04–17 May

18–31 May

01–30 Jun

\({R}_{0}\)

\(\beta\)

\(\gamma\)

\({R}_{0}\)

\(\beta\)

\(\gamma\)

\({R}_{0}\)

\(\beta\)

\(\gamma\)

\({R}_{0}\)

\(\beta\)

\(\gamma\)

\({R}_{0}\)

\(\beta\)

\(\gamma\)

1. Multinomial

 Burundi

0.01

0.08

0.05

0.70

0.08

0.17

1.92

0.19

0.75

2.11

0.20

0.79

2.65

0.30

0.44

 Ethiopia

3.00

0.34

0.29

1.72

0.19

0.32

2.59

0.30

0.26

2.95

0.34

0.23

2.55

0.29

0.35

 Kenya

0.52

0.06

0.18

1.50

0.16

0.40

2.00

0.21

0.55

2.58

0.27

0.43

2.18

0.23

0.45

 Rwanda

4.85

0.56

0.32

2.11

0.25

0.23

1.33

0.16

0.27

1.14

0.13

0.33

1.72

0.20

0.31

 South Sudan

0.65

0.07

0.17

1.48

0.15

0.33

4.64

0.48

0.45

3.97

0.40

0.53

2.19

0.22

0.55

 Tanzania

0.50

0.05

0.59

3.28

0.32

0.77

1.71

0.17

0.60

1.73

0.18

0.42

1.35

0.15

0.30

 Uganda

2.29

0.29

0.08

0.87

0.11

0.16

1.13

0.13

0.35

1.54

0.16

0.61

2.00

0.18

0.99

2. Poisson

 Burundi

7.92

0.94

0.20

6.31

0.75

0.20

4.9

0.59

0.19

3.30

0.39

0.23

1.66

0.20

0.19

 Ethiopia

8.90

0.95

0.19

6.56

0.70

0.21

5.10

0.54

0.21

3.67

0.39

0.25

1.82

0.19

0.20

 Kenya

8.30

0.96

0.20

6.72

0.78

0.20

4.93

0.57

0.18

3.35

0.38

0.22

1.75

0.20

0.19

 Rwanda

7.71

0.93

0.20

6.17

0.75

0.21

4.73

0.57

0.20

3.16

0.38

0.23

1.56

0.19

0.19

 South Sudan

8.95

0.95

0.21

6.95

0.74

0.22

5.23

0.56

0.20

3.62

0.38

0.24

1.82

0.19

0.19

 Tanzania

8.77

0.93

0.21

6.99

0.74

0.21

5.28

0.56

0.21

3.53

0.37

0.24

1.82

0.19

0.19

 Uganda

9.01

0.96

0.21

6.96

0.74

0.21

5.17

0.55

0.20

3.65

0.39

0.23

1.83

0.19

0.19

3. Binomial

 Burundi

7.99

0.95

0.21

6.26

0.75

0.21

4.78

0.57

0.20

3.23

0.38

0.23

1.61

0.19

0.19

 Ethiopia

8.91

0.95

0.21

7.01

0.74

0.20

5.28

0.56

0.20

3.54

0.37

0.25

1.81

0.19

0.19

 Kenya

7.99

0.93

0.20

6.68

0.77

0.20

5.02

0.58

0.19

3.34

0.38

0.23

1.71

0.20

0.20

 Rwanda

7.66

0.93

0.20

5.99

0.73

0.20

4.69

0.57

0.20

3.17

0.38

0.23

1.59

0.19

0.19

 South Sudan

8.93

0.95

0.21

6.99

0.74

0.20

5.22

0.55

0.20

3.72

0.39

0.23

1.83

0.19

0.19

 Tanzania

8.82

0.94

0.21

6.83

0.72

0.20

5.23

0.56

0.19

3.56

0.38

0.24

1.90

0.20

0.19

 Uganda

8.63

0.92

0.21

6.85

0.73

0.20

5.22

0.55

0.20

3.77

0.40

0.22

1.78

0.19

0.19

  1. \(\beta\) = rate of transmission of infection by false negative individuals
  2. \(\gamma\) = recovery rate
Back to article page

BMC Infectious Diseases

ISSN: 1471-2334

Contact us