Table 1 Sequences of amplification primers for 27 pathogens
Pathogen | Forward Primer (5 → 3) | Reverse primer (5 → 3) |
|---|---|---|
M.catarrhalis | ACGTTGGATGTAGCAGGCGGTGTTGGTGTT | ACGTTGGATGTTGTAGCTTGCTTCAACGCC |
HRV | ACGTTGGATGAACAGTGGTCCAGCCTGCGT | ACGTTGGATGAACACGGACACCCAAAGTAG |
MP | ACGTTGGATGCCCGAACAAAATAATGATTCC | ACGTTGGATGGTTTGACAAAGTCCGTGAAG |
HCoV | ACGTTGGATGGGGAGTAATGAACCCGGTAA | ACGTTGGATGGAGCTAATAACACGGCTCTG |
Flu-A | ACGTTGGATGAAGACCAATCCTGTCACCTC | ACGTTGGATGAAAGCGTCTACGCTGCAGTC |
CP | ACGTTGGATGCGGAAGGGTTAGTAGTACAT | ACGTTGGATGCGCATAAACTCTTCCTCAAC |
Flu-B | ACGTTGGATGACGGTGGATTAAACAAAAGC | ACGTTGGATGGCAATAGCTCCGAAGAAACC |
HMPV | ACGTTGGATGAGCTTCAGTCAGTTCAACAG | ACGTTGGATGCCTGCAGATGTTGGCATGTA |
B. pertussis | ACGTTGGATGTGGGAGTTCTGGTAGGTGTG | ACGTTGGATGATCAAGCACCGCTTTACCC |
H. influenzae | ACGTTGGATGTTGGCCCAGGTTGGTATATG | ACGTTGGATGTTACGCACGGTAAGGATG |
H5 | ACGTTGGATGTGACTATCCACAATACTCAG | ACGTTGGATGGACCAGCTATCATGATTGCC |
S.pyogenes | ACGTTGGATGAGCAACAAGTAGTACAGCAG | ACGTTGGATGTTAGCTACTAGTGTAGCTG |
S.pneumoniae | ACGTTGGATGTCGTGCGTTTTAATTCCAGC | ACGTTGGATGACGCAATCTAGCAGATGAAG |
PIV4 | ACGTTGGATGGATCCACAGCAAAGATTCAC | ACGTTGGATGCCTGCAAGGAAAGCAGAGAT |
H1N1 | ACGTTGGATGGTTAACATCAGCAACACCAAC | ACGTTGGATGAGAGAGGAATTGCCCGC |
S.agalactiae | ACGTTGGATGGAAACATTGATTGCCCAGC | ACGTTGGATGAGGAAGATTTATCGCACCTG |
PIV3 | ACGTTGGATGACTCTATCCACTCTCAGACC | ACGTTGGATGATGGGATCTGAGGATAC |
PIV2 | ACGTTGGATGCTGCAGCTATGAGTAATCAC | ACGTTGGATGGATCGAGCATCTGGAATAAC |
ADV | ACGTTGGATGGACGCCTCGGAGTACCTGA | ACGTTGGATGAGCCACCGTGGGGTTTCTAA |
RSV | ACGTTGGATGCACAGAAGATGCTAATCAT | ACGTTGGATGGGTCTTCTCTTCCTAATC |
H3 | ACGTTGGATGCAGTACAGGGAATCTAATTG | ACGTTGGATGGCATTCAGAATTGCATTTG |
L.pneumophila | ACGTTGGATGTGGTGACTGCAGCTGTTATG | ACGTTGGATGTCCGGATTAACATCTATGCC |
PIV1 | ACGTTGGATGATTACCTGGACCAAGTCTAC | ACGTTGGATGCACATCCTTGAGTGATTAAG |
HEV | ACGTTGGATGCTGAATGCGGCTAATCCCAA | ACGTTGGATGGATTGTCACCATAAGCAGCC |
H7 | ACGTTGGATGCAGCATACAATTGATCTGGC | ACGTTGGATGCCATCTTCTTCAGCATTCTC |
H3N2 seasonal | ACGTTGGATGACCACCCGGGTACGGACAA | ACGTTGGATGGGCTTCTTTTGGTAGATACTG |
HBoV | ACGTTGGATGAAATCTCTTCTGGCTACACG | ACGTTGGATGCCTCTGCGATCTCTATATTG |
GAPDH | ACGTTGGATG CTGCTCACATATTCTGGAGGAG | ACGTTGGATG AAAAGCAGCCCTGGTGACC |