Table 1 Oligonucleotide primers used in this study
Primer | Sequence (5′ → 3′) | Product size (bp) |
|---|---|---|
SCCmec I | F: GCTTTAAAGAGTGTCGTTACAGG R: GTTCTCTCATAGTATGACGTCC | 613 |
SCCmec II | F: CGTTGAAGATGATGAAGCG R: CGAAATCAATGGTTAATGGACC | 398 |
SCCmec III | F: CCATATTGTGTACGATGCG R: CCTTAGTTGTCGTAACAGATCG | 280 |
SCCmec IVa | F: GCCTTATTCGAAGAAACCG R: CTACTCTTCTGAAAAGCGTCG | 776 |
SCCmec IVb | F: TCTGGAATTACTTCAGCTGC R: AAACAATATTGCTCTCCCTC | 493 |
SCCmec IVc | F: ACAATATTTGTATTATCGGAGAGC R: TTGGTATGAGGTATTGCTGG | 200 |
SCCmec IVd | F: CTCAAAATACGGACCCCAATACA R: TGCTCCAGTAATTGCTAAAG | 881 |
SCCmec V | F: GAACATTGTTACTTAAATGAGCG R: TGAAAGTTGTACCCTTGACACC | 325 |
PanF | F: ATGCACATGGTGCACATGC | Â |
agr I | R: GTCACAAGTACTATAAGCTGCGAT | 441 |
agr II | R: TATTACTAATTGAAAAGTGGCCATAGC | 575 |
agr III | R: GTAATGTAATAGCTTGTATAATAATACCCAG | 323 |
agr IV | R: CGATAATGCCGTAATACCCG | 659 |