CC (no.) | 2013–2014 (91 isolates) | 2018–2019 (136 isolates) | ||||||||
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MLST(no.) | spa(no.) | MRSA(no.) | MSSA(no.) | SCCmec(no.) | MLST(no.) | spa(no.) | MRSA(no.) | MSSA(no.) | SCCmec(no.) | |
CC398(32) | ST398(5) | t011(3) | Â | 3 | Â | ST398(27) | t011(12) | Â | 12 | Â |
 | t034(2) |  | 2 |  |  | t034(9) | 2 | 7 | V(2) | |
 |  |  |  |  |  | t1451(3) |  | 3 |  | |
 |  |  |  |  |  | t571(1) |  | 1 |  | |
 |  |  |  |  |  | t1580 (1) |  | 1 |  | |
 |  |  |  |  |  | NT(1) |  | 1 |  | |
CC59(30) | ST59(8) | t437(4) | 1 | 3 | IVa(1) | ST59(14) | t437(12) | 9 | Â | IVa(5), V(4) |
 | t441(1) | 1 |  | V(1) |  | t3385(1) | 1 |  | IVa(1) | |
 | t1212(1) |  | 1 |  |  | t5795(1) | 1 |  | IVa(1) | |
 | t2356(1) | 1 |  | IVa(1) | ST338(3) | t437(1) |  | 1 |  | |
 | t3592(1) | 1 |  | V(1) |  | t1751(2) | 2 |  | V(1),NT(1) | |
ST338(2) | t1751(2) | Â | 2 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | |
ST1778(2) | t437(1) | Â | 1 | Â | ST2041(1) | t13874(1) | Â | 1 | Â | |
 | t2365(1) | 1 |  | IVa(1) |  |  |  |  |  | |
CC188(30) | ST188(13) | t189(12) | Â | 12 | Â | ST188(17) | t189(16) | 1 | 15 | IVa(1) |
 | t4950(1) |  | 1 |  |  | t2174(1) |  | 1 |  | |
CC45(25) | ST45(13) | t116(10) | 8 | 2 | IVa(8) | ST45(10) | t116(7) | 6 | 1 | IVa(6) |
 | t015(1) | 1 |  | IVa(1) |  | t026(1) | 1 |  | IVa(1) | |
 | t2131(1) | 1 |  | IVa(1) |  | t157(1) | 1 |  | IVa(1) | |
 | NT(1) | 1 |  | IVa(1) |  | t3349(1) | 1 |  | IVa(1) | |
 |  |  |  |  | ST508(2) | t1203(1) | 1 |  | NT(1) | |
 |  |  |  |  |  | t908(1) | 1 |  | IVa(1) | |
CC5(17) | ST5(6) | t002(3) | Â | 3 | Â | ST5(8) | t2358(2) | 2 | Â | IVa(2) |
 | t954(1) |  | 1 |  |  | t548(1) |  | 1 |  | |
 | t6212(1) |  | 1 |  |  | t777(1) |  | 1 |  | |
 | t2358(1) | 1 |  | IVa(1) |  | t1265(1) |  | 1 |  | |
ST965(1) | t062(1) | 1 | Â | IVa(1) | Â | t179(1) | Â | 1 | Â | |
 |  |  |  |  |  | t2980(1) |  | 1 |  | |
 |  |  |  |  |  | t9987(1) |  | 1 |  | |
 |  |  |  |  | ST764(1) | t1084(1) | 1 |  | II(1) | |
 |  |  |  |  | ST2633(1) | t010(1) |  | 1 |  | |
CC7(17) | ST7(4) | t091(4) | Â | 4 | Â | ST7(10) | t091(7) | Â | 7 | Â |
 |  |  |  |  |  | t867(1) |  | 1 |  | |
 |  |  |  |  |  | t2874(1) |  | 1 |  | |
 |  |  |  |  |  | t3932(1) |  | 1 |  | |
ST5489(1) | t091(1) | Â | 1 | Â | ST789(1) | t2453(1) | Â | 1 | Â | |
ST4457(1) | t796(1) | Â | 1 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | |
CC88(16) | ST88(8) | t1376(4) | 1 | 3 | II(1) | ST88(8) | t1376(3) | 1 | 2 | IVa(1) |
 | t2592(1) | 1 |  | IVa(1) |  | t4333(2) |  | 2 |  | |
 | t3622(1) |  | 1 |  |  | NT(3) |  | 3 |  | |
 | t15796(1) |  | 1 |  |  |  |  |  |  | |
 | NT(1) |  | 1 |  |  |  |  |  |  | |
CC1(14) | ST1(4) | t127(1) | Â | 1 | Â | ST1(8) | t127(5) | 1 | 4 | NT(1) |
 | t2207(3) | 3 |  | NT(3) |  | t2207(2) | 2 |  | NT(2) | |
ST610(1) | t2207(1) | 1 | Â | II(1) | Â | t114(1) | Â | 1 | Â | |
 |  |  |  |  | ST2583(1) | t1381(1) | 1 |  | IVa(1) | |
CC8(9) | ST239(3) | t030(2) | 2 | Â | III(2) | ST239(3) | t030(2) | 2 | Â | III(2) |
 | t037(1) | 1 |  | III(1) |  | t037(1) | 1 |  | III(1) | |
 |  |  |  |  | ST630(2) | t377(1) |  | 1 |  | |
 |  |  |  |  |  | t4549(1) |  | 1 |  | |
 |  |  |  |  | ST5492(1) | t1987(1) |  | 1 |  | |
CC2580(6) | ST2580(5) | t3351(4) | 4 | Â | IVa(1), IVc(3) | ST2580(1) | t3351(1) | 1 | Â | IVc(1) |
 | t4875(1) | 1 |  | IVc(1) |  |  |  |  |  | |
CC72(6) | ST72(2) | t148(2) | Â | 2 | Â | ST72(4) | t148(3) | Â | 3 | Â |
 |  |  |  |  |  | t3092(1) |  | 1 |  | |
CC121(5) | ST121(4) | t269(1) | Â | 1 | Â | ST120(1) | t2613(1) | 1 | Â | NT(1) |
 | t162(2) |  | 2 |  |  |  |  |  |  | |
 | t159(1) |  | 1 |  |  |  |  |  |  | |
CC15(4) | ST15(1) | t1492(1) | Â | 1 | Â | ST15(1) | t085(1) | Â | 1 | Â |
ST4438(2) | t084(2) | Â | 2 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | |
CC97(3) | ST464(1) | t3992(1) | Â | 1 | Â | ST97(1) | t267(1) | Â | 1 | Â |
 |  |  |  |  | ST464(1) | t3904(1) |  | 1 |  | |
CC2196(3) | ST4435(1) | t037(1) | 1 | Â | IVa(1) | ST2196(2) | NT(2) | Â | 2 | Â |
CC9(2) | ST9(1) | t899(1) | Â | 1 | Â | ST9(1) | t899(1) | 1 | Â | I(1) |
CC509(2) | Â | Â | Â | Â | Â | ST509(2) | t375(2) | 1 | 1 | IVa(1) |
CC1281(2) | Â | Â | Â | Â | Â | ST1281(2) | t164(2) | Â | 2 | Â |
CC25(2) | ST5493(1) | t12584(1) | Â | 1 | Â | ST25(1) | t280(1) | Â | 1 | Â |
Singletons(2) | ST6(1) | t304(1) | 1 | Â | IVa(1) | Â | Â | Â | Â | Â |
ST944(1) | t616(1) | Â | 1 | Â | Â | Â | Â | Â | Â |