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Table 1 MIC values (mg/L) of antimicrobial agents for the 21 MDR E. coli from DRC isolates were deemed as Susceptible, Intermediate or Resistant to antibiotics based on breakpoints values provided by EUCAST. Abbreviations are the same as for Fig. 2, with the additional abbreviations CAZ + CLAV: ceftazidime-clavulanic acid; CTX + CLAV: cefotaxime-clavulanic acid

From: Whole-genome sequences of multidrug-resistant Escherichia coli in South-Kivu Province, Democratic Republic of Congo: characterization of phylogenomic changes, virulence and resistance genes

 

AKN

AMX

AMC

AMP

CAZ

CAZ + CLAV

CRO

CTX

CTX + CLAV

FEP

CTX

CEFUR

CHL

CIP

IMP

SXT

TET

DRC_BKV_01

4

> 256

16

> 256

6

0.094

12

> 16

0.094

6

12

> 256

8

> 32

0.125

> 32

> 256

DRC_BKV_02

4

> 256

8

> 256

4

0.064

16

> 16

0.032

6

8

> 256

> 256

> 32

0.064

> 32

> 256

DRC_BKV_03

2

> 256

8

> 256

> 32

0.064

> 256

> 16

0.125

> 256

> 32

> 256

0.75

8

0.125

0.032

0.38

DRC_BKV_04

16

> 256

12

> 256

12

0.125

> 256

> 16

0.094

12

> 32

> 256

> 256

> 32

0.094

> 32

> 256

DRC_BKV_05

12

> 256

16

> 256

16

0.25

> 256

> 16

0.094

12

> 32

> 256

> 256

> 32

0.125

> 32

> 256

DRC_BKV_06

3

> 256

12

> 256

> 32

0.25

> 256

> 16

0.38

48

> 32

> 256

> 256

> 32

0.125

0.25

> 256

DRC_BKV_08

2

> 256

8

> 256

8

0.064

8

8

0.032

0.064

1

64

> 256

> 32

0.125

> 32

> 256

DRC_BKV_07

1.5

> 256

12

> 256

> 32

0.25

> 256

> 16

0.5

48

> 32

> 256

> 256

> 32

0.125

0.125

> 256

DRC_BKV_09

2

> 256

12

> 256

> 32

0.125

> 256

> 16

0.125

48

> 32

> 256

> 256

> 32

0.064

0.125

> 256

DRC_BKV_10

1.5

> 256

12

> 256

> 32

0.25

> 256

> 16

0.25

64

> 32

> 256

> 256

> 32

0.125

0.125

> 256

DRC_BKV_11

3

> 256

12

> 256

8

0.064

> 256

> 16

0.047

6

> 32

> 256

> 256

16

0.125

> 32

128

DRC_BKV_12

4

> 256

8

> 256

> 32

0.19

> 256

> 16

0.19

> 256

> 32

> 256

4

> 32

0.125

> 32

> 256

DRC_BKV_13

6

> 256

16

> 256

> 32

0.125

> 256

> 16

0.094

64

> 32

> 256

4

> 32

0.125

> 32

> 256

DRC_BKV_14

4

> 256

16

> 256

> 32

0.125

> 256

> 16

0.094

64

> 32

> 256

3

> 32

0.125

> 32

96

DRC_BKV_15

2

> 256

16

> 256

32

0.19

> 256

> 16

0.094

24

> 32

> 256

> 256

> 32

0.125

> 32

> 256

DRC_BKV_16

3

> 256

12

> 256

12

0.125

> 256

> 16

0.064

24

> 32

> 256

4

> 32

0.125

> 32

3

DRC_BKV_17

6

0.5

8

> 256

> 32

> 4

> 256

> 16

> 1

> 256

> 32

> 256

> 256

> 32

0.125

> 32

> 256

DRC_BKV_18

2

> 256

12

> 256

> 16

0.19

> 256

> 32

0.125

192

> 32

> 256

> 256

> 32

0.125

> 32

> 256

DRC_BKV_19

4

> 256

12

> 256

8

0.064

> 256

> 16

0.032

16

> 32

> 256

> 256

12

0.125

> 32

64

DRC_BKV_20

6

> 256

12

> 256

> 32

0.125

> 256

> 16

0.032

64

> 32

> 256

> 256

> 32

0.125

> 32

> 256

DRC_BKV_21

4

> 256

16

> 256

32

0.125

> 256

12

0.125

24

> 32

> 256

> 256

> 32

0.125

> 32

> 256