TY - JOUR AU - Reddington, K. AU - Tuite, N. AU - Barry, T. AU - O’Grady, J. AU - Zumla, A. PY - 2013 DA - 2013// TI - Advances in multiparametric molecular diagnostics technologies for respiratory tract infections JO - Curr Opin Pulm Med VL - 19 UR - https://doi.org/10.1097/MCP.0b013e32835f1b32 DO - 10.1097/MCP.0b013e32835f1b32 ID - Reddington2013 ER - TY - JOUR AU - Gray, J. AU - Coupland, L. J. PY - 2014 DA - 2014// TI - The increasing application of multiplex nucleic acid detection tests to the diagnosis of syndromic infections JO - Epidemiol Infect VL - 142 UR - https://doi.org/10.1017/S0950268813002367 DO - 10.1017/S0950268813002367 ID - Gray2014 ER - TY - STD TI - Infectious Diseases Society of A. An unmet medical need: rapid molecular diagnostics tests for respiratory tract infections. Clin Infect Dis. 2011;52 Suppl 4:S384–95. https://doi.org/10.1093/cid/cir055. ID - ref3 ER - TY - JOUR AU - Jansen, R. R. AU - Wieringa, J. AU - Koekkoek, S. M. AU - Visser, C. E. AU - Pajkrt, D. AU - Molenkamp, R. PY - 2011 DA - 2011// TI - Frequent detection of respiratory viruses without symptoms: toward defining clinically relevant cutoff values JO - J Clin Microbiol VL - 49 UR - https://doi.org/10.1128/JCM.02094-10 DO - 10.1128/JCM.02094-10 ID - Jansen2011 ER - TY - JOUR AU - Levy, J. W. AU - Bhoomiboonchoo, P. AU - Simasathien, S. AU - Salje, H. AU - Huang, A. AU - Rangsin, R. PY - 2015 DA - 2015// TI - Elevated transmission of upper respiratory illness among new recruits in military barracks in Thailand JO - Influenza Other Respir Viruses VL - 9 UR - https://doi.org/10.1111/irv.12345 DO - 10.1111/irv.12345 ID - Levy2015 ER - TY - JOUR AU - Korzeniewski, K. AU - Nitsch-Osuch, A. AU - Konior, M. AU - Lass, A. PY - 2015 DA - 2015// TI - Respiratory tract infections in the military environment JO - Respir Physiol Neurobiol VL - 209 UR - https://doi.org/10.1016/j.resp.2014.09.016 DO - 10.1016/j.resp.2014.09.016 ID - Korzeniewski2015 ER - TY - JOUR AU - Korzeniewski, K. AU - Nitsch-Osuch, A. AU - Chciałowski, A. AU - Korsak, J. PY - 2013 DA - 2013// TI - Environmental factors, immune changes and respiratory diseases in troops during military activities JO - Respir Physiol Neurobiol VL - 187 UR - https://doi.org/10.1016/j.resp.2013.02.003 DO - 10.1016/j.resp.2013.02.003 ID - Korzeniewski2013 ER - TY - JOUR AU - Aligne, C. A. PY - 2016 DA - 2016// TI - Overcrowding and mortality during the influenza pandemic of 1918 JO - Am J Public Health VL - 106 UR - https://doi.org/10.2105/AJPH.2015.303018 DO - 10.2105/AJPH.2015.303018 ID - Aligne2016 ER - TY - JOUR AU - Wang, Z. AU - Malanoski, A. P. AU - Lin, B. AU - Long, N. C. AU - Leski, T. A. AU - Blaney, K. M. PY - 2010 DA - 2010// TI - Broad spectrum respiratory pathogen analysis of throat swabs from military recruits reveals interference between rhinoviruses and adenoviruses JO - Microb Ecol VL - 59 UR - https://doi.org/10.1007/s00248-010-9636-3 DO - 10.1007/s00248-010-9636-3 ID - Wang2010 ER - TY - JOUR AU - Gray, G. C. AU - Callahan, J. D. AU - Hawksworth, A. W. AU - Fisher, C. A. AU - Gaydos, J. C. PY - 1999 DA - 1999// TI - Respiratory diseases among U.S. military personnel: countering emerging threats JO - Emerg Infect Dis VL - 5 UR - https://doi.org/10.3201/eid0503.990308 DO - 10.3201/eid0503.990308 ID - Gray1999 ER - TY - JOUR AU - Eick, A. A. AU - Faix, D. J. AU - Tobler, S. K. AU - Nevin, R. L. AU - Lindler, L. E. AU - Hu, Z. PY - 2011 DA - 2011// TI - Serosurvey of bacterial and viral respiratory pathogens among deployed U.S. service members JO - Am J Prev Med VL - 41 UR - https://doi.org/10.1016/j.amepre.2011.08.006 DO - 10.1016/j.amepre.2011.08.006 ID - Eick2011 ER - TY - JOUR AU - McGeer, A. AU - Green, K. A. AU - Plevneshi, A. AU - Shigayeva, A. AU - Siddiqi, N. AU - Raboud, J. PY - 2007 DA - 2007// TI - Antiviral therapy and outcomes of influenza requiring hospitalization in Ontario JO - Canada Clin Infect Dis VL - 45 UR - https://doi.org/10.1086/523584 DO - 10.1086/523584 ID - McGeer2007 ER - TY - JOUR AU - Brittain-Long, R. AU - Westin, J. AU - Olofsson, S. AU - Lindh, M. AU - Andersson, L. -. M. PY - 2011 DA - 2011// TI - Access to a polymerase chain reaction assay method targeting 13 respiratory viruses can reduce antibiotics: a randomised, controlled trial JO - BMC Med VL - 9 UR - https://doi.org/10.1186/1741-7015-9-44 DO - 10.1186/1741-7015-9-44 ID - Brittain-Long2011 ER - TY - JOUR AU - Oosterheert, J. J. AU - van Loon, A. M. AU - Schuurman, R. AU - Hoepelman, A. I. AU - Hak, E. AU - Thijsen, S. PY - 2005 DA - 2005// TI - Impact of rapid detection of viral and atypical bacterial pathogens by real-time polymerase chain reaction for patients with lower respiratory tract infection JO - Clin Infect Dis VL - 41 UR - https://doi.org/10.1086/497134 DO - 10.1086/497134 ID - Oosterheert2005 ER - TY - JOUR AU - Wishaupt, J. O. AU - Russcher, A. AU - Smeets, L. C. AU - Versteegh, F. G. A. AU - Hartwig, N. G. PY - 2011 DA - 2011// TI - Clinical impact of RT-PCR for pediatric acute respiratory infections: a controlled clinical trial JO - Pediatrics VL - 128 UR - https://doi.org/10.1542/peds.2010-2779 DO - 10.1542/peds.2010-2779 ID - Wishaupt2011 ER - TY - JOUR AU - Murdoch, D. R. PY - 2005 DA - 2005// TI - Impact of rapid microbiological testing on the Management of Lower Respiratory Tract Infection JO - Clin Infect Dis VL - 41 UR - https://doi.org/10.1086/497145 DO - 10.1086/497145 ID - Murdoch2005 ER - TY - JOUR AU - Binnicker, M. J. PY - 2015 DA - 2015// TI - Multiplex molecular panels for diagnosis of gastrointestinal infection: performance, result interpretation, and cost-effectiveness JO - J Clin Microbiol VL - 53 UR - https://doi.org/10.1128/JCM.02103-15 DO - 10.1128/JCM.02103-15 ID - Binnicker2015 ER - TY - JOUR AU - Rand, K. H. AU - Tremblay, E. E. AU - Hoidal, M. AU - Fisher, L. B. AU - Grau, K. R. AU - Karst, S. M. PY - 2015 DA - 2015// TI - Multiplex gastrointestinal pathogen panels: implications for infection control JO - Diagn Microbiol Infect Dis VL - 82 UR - https://doi.org/10.1016/j.diagmicrobio.2015.01.007 DO - 10.1016/j.diagmicrobio.2015.01.007 ID - Rand2015 ER - TY - JOUR AU - Phillips, G. AU - Lopman, B. AU - Tam, C. C. AU - Iturriza-Gomara, M. AU - Brown, D. AU - Gray, J. PY - 2009 DA - 2009// TI - Diagnosing norovirus-associated infectious intestinal disease using viral load JO - BMC Infect Dis VL - 9 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2334-9-63 DO - 10.1186/1471-2334-9-63 ID - Phillips2009 ER - TY - JOUR AU - Kang, G. AU - Iturriza-Gomara, M. AU - Wheeler, J. G. AU - Crystal, P. AU - Monica, B. AU - Ramani, S. PY - 2004 DA - 2004// TI - Quantitation of group a rotavirus by real-time reverse-transcription-polymerase chain reaction: correlation with clinical severity in children in South India JO - J Med Virol VL - 73 UR - https://doi.org/10.1002/jmv.20053 DO - 10.1002/jmv.20053 ID - Kang2004 ER - TY - JOUR AU - Barletta, F. AU - Ochoa, T. J. AU - Mercado, E. AU - Ruiz, J. AU - Ecker, L. AU - Lopez, G. PY - 2011 DA - 2011// TI - Quantitative real-time polymerase chain reaction for enteropathogenic Escherichia coli: a tool for investigation of asymptomatic versus symptomatic infections JO - Clin Infect Dis VL - 53 UR - https://doi.org/10.1093/cid/cir730 DO - 10.1093/cid/cir730 ID - Barletta2011 ER - TY - JOUR AU - Feikin, D. a. n. i. e. l. R. AU - Fu, W. e. i. AU - Park, D. a. n. i. e. l. E. AU - Shi, Q. i. y. u. a. n. AU - Higdon, M. e. l. i. s. s. a. M. AU - Baggett, H. e. n. r. y. C. AU - Brooks, W. A. b. d. u. l. l. a. h. AU - Deloria Knoll, M. a. r. i. a. AU - Hammitt, L. a. u. r. a. L. AU - Howie, S. t. e. p. h. e. n. R. C. AU - Kotloff, K. a. r. e. n. L. AU - Levine, O. r. i. n. S. AU - Madhi, S. h. a. b. i. r. A. AU - Scott, J. A. n. t. h. o. n. y. G. AU - Thea, D. o. n. a. l. d. M. AU - Adrian, P. e. t. e. r. V. AU - Antonio, M. a. r. t. i. n. AU - Awori, J. u. l. i. e. t. O. AU - Baillie, V. i. c. k. y. L. AU - DeLuca, A. n. d. r. e. a. N. AU - Driscoll, A. m. a. n. d. a. J. AU - Ebruke, B. e. r. n. a. r. d. E. AU - Goswami, D. o. l. i. AU - Karron, R. u. t. h. A. AU - Li, M. e. n. g. y. i. n. g. AU - Morpeth, S. u. s. a. n. C. AU - Mwaba, J. o. h. n. AU - Mwansa, J. a. m. e. s. AU - Prosperi, C. h. r. i. s. t. i. n. e. AU - Sawatwong, P. o. n. g. p. u. n. AU - Sow, S. a. m. b. a. O. AU - Tapia, M. i. l. a. g. r. i. t. o. s. D. AU - Whistler, T. o. n. i. AU - Zaman, K. h. a. l. e. q. u. AU - Zeger, S. c. o. t. t. L. AU - O’ Brien, K. a. t. h. e. r. i. n. e. L. AU - Murdoch, D. a. v. i. d. R. AU - O’Brien, K. a. t. h. e. r. i. n. e. L. AU - Levine, O. r. i. n. S. AU - Knoll, M. a. r. i. a. D. e. l. o. r. i. a. AU - Feikin, D. a. n. i. e. l. R. AU - DeLuca, A. n. d. r. e. a. N. AU - Driscoll, A. m. a. n. d. a. J. AU - Fancourt, N. i. c. h. o. l. a. s. AU - Fu, W. e. i. AU - Hammitt, L. a. u. r. a. L. AU - Higdon, M. e. l. i. s. s. a. M. AU - Kagucia, E. W. a. n. g. e. c. i. AU - Karron, R. u. t. h. A. AU - Li, M. e. n. g. y. i. n. g. AU - Park, D. a. n. i. e. l. E. AU - Prosperi, C. h. r. i. s. t. i. n. e. AU - Wu, Z. h. e. n. k. e. AU - Zeger, S. c. o. t. t. L. AU - Watson, N. o. r. a. L. AU - Crawley, J. a. n. e. AU - Murdoch, D. a. v. i. d. R. AU - Brooks, W. A. b. d. u. l. l. a. h. AU - Endtz, H. u. b. e. r. t. P. AU - Zaman, K. h. a. l. e. q. u. AU - Goswami, D. o. l. i. AU - Hossain, L. o. k. m. a. n. AU - Jahan, Y. a. s. m. i. n. AU - Ashraf, H. a. s. a. n. AU - Howie, S. t. e. p. h. e. n. R. C. AU - Ebruke, B. e. r. n. a. r. d. E. AU - Antonio, M. a. r. t. i. n. AU - McLellan, J. e. s. s. i. c. a. AU - Machuka, E. u. n. i. c. e. AU - Shamsul, A. r. i. f. i. n. AU - Zaman, S. y. e. d. M. A. AU - Mackenzie, G. r. a. n. t. AU - Scott, J. A. n. t. h. o. n. y. G. AU - Awori, J. u. l. i. e. t. O. AU - Morpeth, S. u. s. a. n. C. AU - Kamau, A. l. i. c. e. AU - Kazungu, S. i. d. i. AU - Ominde, M. i. c. a. h. S. i. l. a. b. a. AU - Kotloff, K. a. r. e. n. L. AU - Tapia, M. i. l. a. g. r. i. t. o. s. D. AU - Sow, S. a. m. b. a. O. AU - Sylla, M. a. m. a. d. o. u. AU - Tamboura, B. o. u. b. o. u. AU - Onwuchekwa, U. m. a. AU - Kourouma, N. a. n. a. AU - Toure, A. l. i. o. u. AU - Madhi, S. h. a. b. i. r. A. AU - Moore, D. a. v. i. d. P. AU - Adrian, P. e. t. e. r. V. AU - Baillie, V. i. c. k. y. L. AU - Kuwanda, L. o. c. a. d. i. a. h. AU - Mudau, A. z. w. i. f. a. r. w. i. AU - Groome, M. i. c. h. e. l. l. e. J. AU - Mahomed, N. a. s. r. e. e. n. AU - Baggett, H. e. n. r. y. C. AU - Thamthitiwat, S. o. m. s. a. k. AU - Maloney, S. u. s. a. n. A. AU - Bunthi, C. h. a. r. a. t. d. a. o. AU - Rhodes, J. u. l. i. a. AU - Sawatwong, P. o. n. g. p. u. n. AU - Akarasewi, P. a. s. a. k. o. r. n. AU - Thea, D. o. n. a. l. d. M. AU - Mwananyanda, L. a. w. r. e. n. c. e. AU - Chipeta, J. a. m. e. s. AU - Seidenberg, P. h. i. l. AU - Mwansa, J. a. m. e. s. AU - wa Somwe, S. o. m. w. e. AU - Kwenda, G. e. o. f. f. r. e. y. AU - Anderson, T. r. e. v. o. r. P. AU - Mitchell, J. o. a. n. n. e. PY - 2017 DA - 2017// TI - Is Higher Viral Load in the Upper Respiratory Tract Associated With Severe Pneumonia? Findings From the PERCH Study JO - Clinical Infectious Diseases VL - 64 UR - https://doi.org/10.1093/cid/cix148 DO - 10.1093/cid/cix148 ID - Feikin2017 ER - TY - JOUR AU - Utokaparch, S. AU - Marchant, D. AU - Gosselink, J. V. AU - McDonough, J. E. AU - Thomas, E. E. AU - Hogg, J. C. PY - 2011 DA - 2011// TI - The relationship between respiratory viral loads and diagnosis in children presenting to a pediatric hospital emergency department JO - Pediatr Infect Dis J VL - 30 UR - https://doi.org/10.1097/INF.0b013e3181ff2fac DO - 10.1097/INF.0b013e3181ff2fac ID - Utokaparch2011 ER - TY - JOUR AU - Gerna, G. AU - Piralla, A. AU - Rovida, F. AU - Rognoni, V. AU - Marchi, A. AU - Locatelli, F. PY - 2009 DA - 2009// TI - Correlation of rhinovirus load in the respiratory tract and clinical symptoms in hospitalized immunocompetent and immunocompromised patients JO - J Med Virol VL - 81 UR - https://doi.org/10.1002/jmv.21548 DO - 10.1002/jmv.21548 ID - Gerna2009 ER - TY - JOUR AU - Gerna, G. AU - Campanini, G. AU - Rognoni, V. AU - Marchi, A. AU - Rovida, F. AU - Piralla, A. PY - 2008 DA - 2008// TI - Correlation of viral load as determined by real-time RT-PCR and clinical characteristics of respiratory syncytial virus lower respiratory tract infections in early infancy JO - J Clin Virol VL - 41 UR - https://doi.org/10.1016/j.jcv.2007.10.018 DO - 10.1016/j.jcv.2007.10.018 ID - Gerna2008 ER - TY - JOUR AU - Jiang, W. AU - Yin, F. AU - Zhou, W. AU - Yan, Y. AU - Ji, W. PY - 2016 DA - 2016// TI - Clinical significance of different virus load of human bocavirus in patients with lower respiratory tract infection JO - Sci Rep VL - 6 UR - https://doi.org/10.1038/srep20246 DO - 10.1038/srep20246 ID - Jiang2016 ER - TY - JOUR AU - Bosis, S. AU - Esposito, S. AU - Osterhaus, A. D. M. E. AU - Tremolati, E. AU - Begliatti, E. AU - Tagliabue, C. PY - 2008 DA - 2008// TI - Association between high nasopharyngeal viral load and disease severity in children with human metapneumovirus infection JO - J Clin Virol VL - 42 UR - https://doi.org/10.1016/j.jcv.2008.03.029 DO - 10.1016/j.jcv.2008.03.029 ID - Bosis2008 ER - TY - JOUR AU - Martin, E. T. AU - Kuypers, J. AU - Heugel, J. AU - Englund, J. A. PY - 2008 DA - 2008// TI - Clinical disease and viral load in children infected with respiratory syncytial virus or human metapneumovirus JO - Diagn Microbiol Infect Dis VL - 62 UR - https://doi.org/10.1016/j.diagmicrobio.2008.08.002 DO - 10.1016/j.diagmicrobio.2008.08.002 ID - Martin2008 ER - TY - JOUR AU - Yan, X. -. L. AU - Li, Y. -. N. AU - Tang, Y. -. J. AU - Xie, Z. -. P. AU - Gao, H. -. C. AU - Yang, X. -. M. PY - 2017 DA - 2017// TI - Clinical characteristics and viral load of respiratory syncytial virus and human metapneumovirus in children hospitaled for acute lower respiratory tract infection JO - J Med Virol VL - 89 UR - https://doi.org/10.1002/jmv.24687 DO - 10.1002/jmv.24687 ID - Yan2017 ER - TY - JOUR AU - Peng, D. AU - Zhao, X. AU - Liu, E. AU - Huang, Y. AU - Yang, X. AU - Zhao, Y. PY - 2010 DA - 2010// TI - Analysis of viral load in children infected with human metapneumovirus JO - Iran J Pediatr VL - 20 ID - Peng2010 ER - TY - JOUR AU - Christensen, A. AU - Nordbo, S. A. AU - Krokstad, S. AU - Rognlien, A. G. AU - Dollner, H. PY - 2010 DA - 2010// TI - Human bocavirus in children: mono-detection, high viral load and viraemia are associated with respiratory tract infection JO - J Clin Virol VL - 49 UR - https://doi.org/10.1016/j.jcv.2010.07.016 DO - 10.1016/j.jcv.2010.07.016 ID - Christensen2010 ER - TY - JOUR AU - Vu, H. T. T. AU - Yoshida, L. M. AU - Suzuki, M. AU - Nguyen, H. A. T. AU - Nguyen, C. D. L. AU - Nguyen, A. T. T. PY - 2011 DA - 2011// TI - Association between nasopharyngeal load of Streptococcus pneumoniae, viral coinfection, and radiologically confirmed pneumonia in Vietnamese children JO - Pediatr Infect Dis J VL - 30 UR - https://doi.org/10.1097/INF.0b013e3181f111a2 DO - 10.1097/INF.0b013e3181f111a2 ID - Vu2011 ER - TY - JOUR AU - Fan, R. R. AU - Howard, L. M. AU - Griffin, M. R. AU - Edwards, K. M. AU - Zhu, Y. AU - Williams, J. V. PY - 2016 DA - 2016// TI - Nasopharyngeal pneumococcal density and evolution of acute respiratory illnesses in young children, Peru, 2009-2011 JO - Emerg Infect Dis VL - 22 UR - https://doi.org/10.3201/eid2211.160902 DO - 10.3201/eid2211.160902 ID - Fan2016 ER - TY - JOUR AU - Esposito, S. AU - Marchese, A. AU - Tozzi, A. E. AU - Rossi, G. A. AU - Da Dalt, L. AU - Bona, G. PY - 2013 DA - 2013// TI - DNA bacterial load in children with bacteremic pneumococcal community-acquired pneumonia JO - Eur J Clin Microbiol Infect Dis VL - 32 UR - https://doi.org/10.1007/s10096-013-1821-0 DO - 10.1007/s10096-013-1821-0 ID - Esposito2013 ER - TY - JOUR AU - Muñoz-Almagro, C. AU - Gala, S. AU - Selva, L. AU - Jordan, I. AU - Tarragó, D. AU - Pallares, R. PY - 2011 DA - 2011// TI - DNA bacterial load in children and adolescents with pneumococcal pneumonia and empyema JO - Eur J Clin Microbiol Infect Dis VL - 30 UR - https://doi.org/10.1007/s10096-010-1086-9 DO - 10.1007/s10096-010-1086-9 ID - Muñoz-Almagro2011 ER - TY - JOUR AU - Gadsby, N. J. AU - Russell, C. D. AU - McHugh, M. P. AU - Mark, H. AU - Conway Morris, A. AU - Laurenson, I. F. PY - 2016 DA - 2016// TI - Comprehensive molecular testing for respiratory pathogens in community-acquired pneumonia JO - Clin Infect Dis VL - 62 UR - https://doi.org/10.1093/cid/civ1214 DO - 10.1093/cid/civ1214 ID - Gadsby2016 ER - TY - JOUR AU - Platts-Mills, J. A. AU - Liu, J. AU - Houpt, E. R. PY - 2013 DA - 2013// TI - New concepts in diagnostics for infectious diarrhea JO - Mucosal Immunol VL - 6 UR - https://doi.org/10.1038/mi.2013.50 DO - 10.1038/mi.2013.50 ID - Platts-Mills2013 ER - TY - JOUR AU - Wolter, N. AU - Tempia, S. AU - Cohen, C. AU - Madhi, S. A. AU - Venter, M. AU - Moyes, J. PY - 2014 DA - 2014// TI - High nasopharyngeal pneumococcal density, increased by viral coinfection, is associated with invasive pneumococcal pneumonia JO - J Infect Dis VL - 210 UR - https://doi.org/10.1093/infdis/jiu326 DO - 10.1093/infdis/jiu326 ID - Wolter2014 ER - TY - JOUR AU - Tenenbaum, T. AU - Franz, A. AU - Neuhausen, N. AU - Willems, R. AU - Brade, J. AU - Schweitzer-Krantz, S. PY - 2012 DA - 2012// TI - Clinical characteristics of children with lower respiratory tract infections are dependent on the carriage of specific pathogens in the nasopharynx JO - Eur J Clin Microbiol Infect Dis VL - 31 UR - https://doi.org/10.1007/s10096-012-1682-y DO - 10.1007/s10096-012-1682-y ID - Tenenbaum2012 ER - TY - JOUR AU - Gadsby, N. J. AU - McHugh, M. P. AU - Russell, C. D. AU - Mark, H. AU - Conway Morris, A. AU - Laurenson, I. F. AU - Hill, A. T. AU - Templeton, K. E. PY - 2015 DA - 2015// TI - Development of two real-time multiplex PCR assays for the detection and quantification of eight key bacterial pathogens in lower respiratory tract infections JO - Clinical Microbiology and Infection VL - 21 UR - https://doi.org/10.1016/j.cmi.2015.05.004 DO - 10.1016/j.cmi.2015.05.004 ID - Gadsby2015 ER -