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Table 2 Diversity of clonal complexes (CCs) and sequence types (STs) of C. jejuni isolates from human clinical cases, dairy cattle and broiler products

From: MLST genotypes of Campylobacter jejuni isolated from broiler products, dairy cattle and human campylobacteriosis cases in Lithuania

CC ST Children Adults Dairy cattle Broiler products Total aspA glnA gltA glyA pgm tkt uncA
CC21 19 5 1 1 1 8 2 1 5 3 2 1 5
21 2   14 2 18 2 1 1 3 2 1 5
44   1    1 8 1 6 3 2 1 1
50 11    3 14 2 1 12 3 2 1 5
251     1 1 2 1 5 2 2 1 5
376 1    3 4 2 2 1 3 2 1 5
1459 1     1 2 1 1 2 2 1 5
1943 1     1 2 1 1 3 2 226 5
6393 1     1 2 1 5 3 11 1 5
6436     1 1 2 1 12 3 2 1 386
7211     1 1 2 1 5 3 2 3 26
7216    1   1 2 1 209 3 2 1 5
Total 22 2 16 12 52        
CC22 22 1     1 1 3 6 4 3 3 3
1947 1     1 1 94 6 4 3 3 3
Total 2     2        
CC42 42 2   1 2 5 1 2 3 4 5 9 3
Total 2   1 2 5        
CC45 45 1     1 4 7 10 4 1 7 1
137   3   1 4 4 7 10 4 42 7 1
233     2 2 2 7 10 4 1 7 1
583 1     1 4 7 10 4 42 51 1
7318    1   1 4 7 10 632 42 51 1
Total 2 3 1 3 9        
CC48 38    3   3 2 4 2 2 6 1 5
429 5    1 6 7 4 5 2 11 1 5
475     1 1 2 4 1 4 19 62 5
918 2 3   1 6 2 4 1 4 19 1 5
Total 7 3 3 3 16        
CC52 2066 3    1 4 9 10 5 10 22 3 6
Total 3    1 4        
CC61 61    3   3 1 4 2 2 6 3 17
Total    3   3        
CC179 2209 2     2 1 6 29 176 40 32 3
Total 2     2        
CC206 122 1     1 6 4 5 2 2 1 5
227 5 2   2 9 2 4 5 2 2 1 5
572   1 2   3 62 4 5 2 2 1 5
Total 6 3 2 2 13        
CC257 257 5   3   8 9 2 4 62 4 5 6
824 2    1 3 9 2 2 2 11 5 6
Total 7   3 1 11        
CC283 6382 1     1 4 2 40 4 42 51 1
7210     1 1 2 7 40 4 2 51 5
Total 1    1 2        
CC353 5 23 1   9 33 7 2 5 2 10 3 6
353 2    2 4 7 17 5 2 10 3 6
356 1     1 14 17 5 2 11 3 6
3285 1     1 7 2 5 2 10 3 1
5011     1 1 7 84 5 2 19 3 26
6413     1 1 7 17 2 15 2 3 6
6435     1 1 7 114 5 2 67 520 6
7212     1 1 7 84 5 2 19 67 6
Total 27 1   15 43        
CC354 354 1 1   3 5 8 10 2 2 11 12 6
6381   1    1 73 17 2 2 11 12 6
6466 1     1 14 2 2 2 11 12 6
6784     1 1 8 10 2 2 11 5 6
7215    3 1 4 14 10 2 2 11 12 6
7309     1 1 1 71 2 2 11 67 6
Total 2 2 3 6 13        
CC403 1775    1   1 10 27 59 19 10 5 7
933    2   2 10 1 59 19 10 5 7
Total    3   3        
CC443 51 3 2    5 7 17 2 15 23 3 12
6391 1    4 5 4 17 2 15 2 3 12
7208     1 1 7 17 2 15 23 3 6
Total 4 2   5 11        
CC446 446 1     1 47 55 5 10 11 68 8
6392 1    1 2 47 55 2 10 11 68 8
Total 2    1 3        
CC460 670 1     1 77 30 2 2 89 59 6
6467 1     1 77 30 2 2 11 59 6
Total 2     2        
CC464 464 2    15 17 24 2 2 2 10 3 1
Total 2    15 17        
CC574 305 2     2 9 53 2 10 11 3 3
Total 2     2        
CC607 607 1    2 3 8 2 5 53 11 3 1
Total 1    2 3        
CC658 658 1    3 4 2 4 2 4 19 3 6
6468 1     1 2 4 12 93 11 3 6
Total 2    3 5        
CC1034 6409     1 1 2 15 4 3 154 25 23
Total     1 1        
  436    1   1 7 21 5 62 4 61 44
495 1     1 67 2 42 4 4 25 8
1721 1     1 7 78 42 4 106 12 8
2217    1   1 19 24 42 246 300 259 57
2883     1 1 7 21 5 62 67 3 216
3098    5   5 19 24 23 20 397 16 15
3502     1 1 18 33 72 325 116 104 6
3546 1     1 9 17 5 10 350 335 3
3573     1 1 7 172 21 49 125 224 51
4800     2 2 275 84 5 10 119 178 26
5590    1   1 1 2 42 450 10 9 59
6410     12 12 7 112 5 15 119 67 6
6411     6 6 1 61 4 38 517 59 35
6412     1 1 7 112 5 1 13 1 26
7052     1 1 1 61 4 38 517 59 6
7207     1 1 9 61 2 2 517 5 35
7209     1 1 7 112 5 15 42 67 1
7213     1 1 7 112 5 15 119 12 6
7308     1 1 275 84 5 10 19 178 26
Total 3   8 29 40        
Total   101 16 43 102 262        
  1. (Novel STs and alleles are indicated in bold)