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Table 2 Diversity of clonal complexes (CCs) and sequence types (STs) of C. jejuni isolates from human clinical cases, dairy cattle and broiler products

From: MLST genotypes of Campylobacter jejuni isolated from broiler products, dairy cattle and human campylobacteriosis cases in Lithuania

CC

ST

Children

Adults

Dairy cattle

Broiler products

Total

aspA

glnA

gltA

glyA

pgm

tkt

uncA

CC21

19

5

1

1

1

8

2

1

5

3

2

1

5

21

2

 

14

2

18

2

1

1

3

2

1

5

44

 

1

  

1

8

1

6

3

2

1

1

50

11

  

3

14

2

1

12

3

2

1

5

251

   

1

1

2

1

5

2

2

1

5

376

1

  

3

4

2

2

1

3

2

1

5

1459

1

   

1

2

1

1

2

2

1

5

1943

1

   

1

2

1

1

3

2

226

5

6393

1

   

1

2

1

5

3

11

1

5

6436

   

1

1

2

1

12

3

2

1

386

7211

   

1

1

2

1

5

3

2

3

26

7216

  

1

 

1

2

1

209

3

2

1

5

Total

22

2

16

12

52

       

CC22

22

1

   

1

1

3

6

4

3

3

3

1947

1

   

1

1

94

6

4

3

3

3

Total

2

   

2

       

CC42

42

2

 

1

2

5

1

2

3

4

5

9

3

Total

2

 

1

2

5

       

CC45

45

1

   

1

4

7

10

4

1

7

1

137

 

3

 

1

4

4

7

10

4

42

7

1

233

   

2

2

2

7

10

4

1

7

1

583

1

   

1

4

7

10

4

42

51

1

7318

  

1

 

1

4

7

10

632

42

51

1

Total

2

3

1

3

9

       

CC48

38

  

3

 

3

2

4

2

2

6

1

5

429

5

  

1

6

7

4

5

2

11

1

5

475

   

1

1

2

4

1

4

19

62

5

918

2

3

 

1

6

2

4

1

4

19

1

5

Total

7

3

3

3

16

       

CC52

2066

3

  

1

4

9

10

5

10

22

3

6

Total

3

  

1

4

       

CC61

61

  

3

 

3

1

4

2

2

6

3

17

Total

  

3

 

3

       

CC179

2209

2

   

2

1

6

29

176

40

32

3

Total

2

   

2

       

CC206

122

1

   

1

6

4

5

2

2

1

5

227

5

2

 

2

9

2

4

5

2

2

1

5

572

 

1

2

 

3

62

4

5

2

2

1

5

Total

6

3

2

2

13

       

CC257

257

5

 

3

 

8

9

2

4

62

4

5

6

824

2

  

1

3

9

2

2

2

11

5

6

Total

7

 

3

1

11

       

CC283

6382

1

   

1

4

2

40

4

42

51

1

7210

   

1

1

2

7

40

4

2

51

5

Total

1

  

1

2

       

CC353

5

23

1

 

9

33

7

2

5

2

10

3

6

353

2

  

2

4

7

17

5

2

10

3

6

356

1

   

1

14

17

5

2

11

3

6

3285

1

   

1

7

2

5

2

10

3

1

5011

   

1

1

7

84

5

2

19

3

26

6413

   

1

1

7

17

2

15

2

3

6

6435

   

1

1

7

114

5

2

67

520

6

7212

   

1

1

7

84

5

2

19

67

6

Total

27

1

 

15

43

       

CC354

354

1

1

 

3

5

8

10

2

2

11

12

6

6381

 

1

  

1

73

17

2

2

11

12

6

6466

1

   

1

14

2

2

2

11

12

6

6784

   

1

1

8

10

2

2

11

5

6

7215

  

3

1

4

14

10

2

2

11

12

6

7309

   

1

1

1

71

2

2

11

67

6

Total

2

2

3

6

13

       

CC403

1775

  

1

 

1

10

27

59

19

10

5

7

933

  

2

 

2

10

1

59

19

10

5

7

Total

  

3

 

3

       

CC443

51

3

2

  

5

7

17

2

15

23

3

12

6391

1

  

4

5

4

17

2

15

2

3

12

7208

   

1

1

7

17

2

15

23

3

6

Total

4

2

 

5

11

       

CC446

446

1

   

1

47

55

5

10

11

68

8

6392

1

  

1

2

47

55

2

10

11

68

8

Total

2

  

1

3

       

CC460

670

1

   

1

77

30

2

2

89

59

6

6467

1

   

1

77

30

2

2

11

59

6

Total

2

   

2

       

CC464

464

2

  

15

17

24

2

2

2

10

3

1

Total

2

  

15

17

       

CC574

305

2

   

2

9

53

2

10

11

3

3

Total

2

   

2

       

CC607

607

1

  

2

3

8

2

5

53

11

3

1

Total

1

  

2

3

       

CC658

658

1

  

3

4

2

4

2

4

19

3

6

6468

1

   

1

2

4

12

93

11

3

6

Total

2

  

3

5

       

CC1034

6409

   

1

1

2

15

4

3

154

25

23

Total

   

1

1

       
 

436

  

1

 

1

7

21

5

62

4

61

44

495

1

   

1

67

2

42

4

4

25

8

1721

1

   

1

7

78

42

4

106

12

8

2217

  

1

 

1

19

24

42

246

300

259

57

2883

   

1

1

7

21

5

62

67

3

216

3098

  

5

 

5

19

24

23

20

397

16

15

3502

   

1

1

18

33

72

325

116

104

6

3546

1

   

1

9

17

5

10

350

335

3

3573

   

1

1

7

172

21

49

125

224

51

4800

   

2

2

275

84

5

10

119

178

26

5590

  

1

 

1

1

2

42

450

10

9

59

6410

   

12

12

7

112

5

15

119

67

6

6411

   

6

6

1

61

4

38

517

59

35

6412

   

1

1

7

112

5

1

13

1

26

7052

   

1

1

1

61

4

38

517

59

6

7207

   

1

1

9

61

2

2

517

5

35

7209

   

1

1

7

112

5

15

42

67

1

7213

   

1

1

7

112

5

15

119

12

6

7308

   

1

1

275

84

5

10

19

178

26

Total

3

 

8

29

40

       

Total

 

101

16

43

102

262

       
  1. (Novel STs and alleles are indicated in bold)
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BMC Infectious Diseases

ISSN: 1471-2334

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