Table 1 Sequences of the PCR primers
Target gene | Primer sequence (5′-3′) | Annealing temp (°C) | Amplicon size (bp) | Reference |
|---|---|---|---|---|
speA | FW-5΄-TAA GAA CCA AGA GAT GG-3΄ RV-5΄-ATT CTT GAG CAG TTA CC-3΄ | 44 | 248 | Vlaminckx et al., [31] |
speB | FW-5΄-AAG AAG CAA AAG ATA GC-3΄ RV-5΄-TGG TAG AAG TTA CGT CC-3΄ | 42 | 955 | |
spec | FW-5΄- GAT TTC TAC TTA TTT CAC C-3΄ RV-5΄-AAA TAT CTG ATC TAG TCC C-3΄ | 42 | 584 | |
speF | FW-5΄- TAC TTG GAT CAA GAC G-3΄ RV-5΄-GTA ATT AAT GGT GTA GCC-3΄ | 42 | 782 | |
fbp-54 | FW-5΄-CTT CAG AAT CTG TTT CTT TG-3΄ RV-5΄-AGT TCA CAG GTT GTC TAT TG-3΄ | 48 | 595 |