Table 3 Results of C. trachomatis typing using the hr-MLST-6 scheme based on six polymorphic genes in comparison with ompA-typing and sexgroup

3

10

6

1

2

6

2

2

VII

E (10)

Hetero (10)

11

3

1

5

19

7

2

10

D (3)

MSM (3)

16

1

6

7

19

14

2

1

VI

E (1)

Hetero (1)

27

1

9

10

6

10

1

6

G (1)

Hetero (1)

30

1

12

10

7

1

3

8

K (1)

MSM (1)

32

1

12

10

7

1

4

8

K (1)

Hetero (1)

33

6

8

10

8

5

3

6

II

G (6)

MSM (6)

35

3

2

10

8

1

4

17

D (3)

Hetero (3)

52

17

8

20

8

5

3

6

II

G (17)

MSM (17)

59

1

6

7

19

7

2

1

VI

E (1)

Hetero (1)

69

1

6

5

19

6

2

2

E (1)

Hetero (1)

74

1

30

8

8

1

7

18

B (1)

Hetero (1)

90

2

24

5

19

1

1

4

IV

F (2)

Hetero (1), MSM (1)

101

1

36

38

5

12

7

18

III

I (1)

Hetero (1)

109

18

1

5

20

5

2

34

V

D (18)

MSM (18)

110

1

24

1

2

7

2

4

IV

F (1)

Hetero (1)

137

1

8

10

8

22

4

6

G (1)

Hetero (1)

143

1

28

44

13

17

13

28

VIII

L2b (1)

MSM (1)

153

2

6

35

19

7

2

1

VI

E (2)

Hetero (2)

165

1

35

12

5

1

9

8

H (1)

Hetero (1)

171

2

6

49

19

7

2

1

VI

E (2)

Hetero (2)

172

1

6

1

2

7

2

2

VII

E (1)

Hetero (1)

194

3

1

5

6

5

2

34

V

D (3)

MSM (3)

232

2

20

5

19

1

4

18

J (2)

Hetero (2)

240

1

24

5

19

12

1

4

IV

F (1)

Hetero (1)

265

1

10

10

4

1

3

7

G (1)

Hetero (1)

270

1

8

10

5

12

3

8

G (1)

Hetero (1)

272

1

36

10

5

12

24

18

III

I (1)

Hetero (1)

288

1

8

10

8

22

7

57

G (1)

Hetero (1)

301

1

8

20

8

5

1

6

II

G (1)

MSM (1)

303

1

8

20

8

5

3

34

II

G (1)

MSM (1)

304

1

8

20

8

5

4

6

II

G (1)

MSM (1)

305

1

6

25

2

6

2

2

VII

E (1)

Hetero (1)

307

2

53

29

8

5

3

58

I

J (2)

MSM (2)

318

1

1

45

20

5

2

34

V

D (1)

MSM (1)

324

1

1

55

20

5

2

34

V

D (1)

MSM (1)

338

1

6

67

2

7

2

60

E (1)

Hetero (1)

341

1

6

70

57

7

2

1

E (1)

Hetero (1)

345

2

53

74

8

5

3

6

I

J (2)

MSM (2)

353

1

8

81

8

5

3

6

II

G (1)

MSM (1)

395

1

2

83

4

1

3

17

D (1)

Hetero (1)

435

1

9

8

6

10

1

6

G (1)

Hetero (1)

448

1

6

1

2

11

2

2

VII

E (1)

Hetero (1)

449

1

6

1

19

1

1

1

E (1)

Hetero (1)

450

1

24

1

19

7

2

4

IV

F (1)

Hetero (1)

453

1

6

1

19

7

21

1

VI

E (1)

Hetero (1)

459

1

6

5

19

6

21

2

E (1)

Hetero (1)

462

1

6

5

19

7

2

56

E (1)

Hetero (1)

465

1

6

5

19

7

14

2

E (1)

Hetero (1)

466

1

24

5

19

7

21

4

IV

F (1)

Hetero (1)

482

1

9

10

6

10

1

8

G (1)

Hetero (1)

484

1

37

10

7

1

3

5

I (1)

Hetero (1)

498

1

6

24

19

14

2

1

VI

E (1)

Hetero (1)

502

1

6

45

19

6

1

2

E (1)

Hetero (1)

504

1

6

47

19

7

2

1

VI

E (1)

Hetero (1)

509

1

6

71

2

1

2

2

VII

E (1)

Hetero (1)

510

1

6

71

2

6

2

2

VII

E (1)

Hetero (1)

513

2

6

71

19

7

2

1

VI

E (2)

Hetero (2)

516

1

6

5

19

5

2

2

E (1)

Hetero (1)

517

2

36

38

5

12

3

18

III

I (2)

Hetero (2)

100b

3

36

10

5

12

7

18

III

I (3)

Hetero (3)

100c

1

37

10

5

12

7

18

III

I (1)

Hetero (1)

108c

9

53

29

8

5

3

6

I

J (9)

MSM (9)

12d

13

24

5

19

7

1

4

IV

F (13)

Hetero (12), MSM (1)

135a

1

20

10

5

12

4

18

III

J (1)

Hetero (1)

135b

2

36

10

5

12

4

18

III

I (2)

Hetero (2)

13b

1

24

5

19

15

1

4

IV

F (1)

Hetero (1)

148a

2

24

5

19

7

2

4

IV

F (2)

Hetero (1), MSM (1)

205b

1

20

10

6

22

4

8

J (1)

Hetero (1)

20a

1

2

10

4

1

4

17

D (1)

Hetero (1)

220a

1

12

10

4

1

3

8

K (1)

Hetero (1)

281a

1

20

10

8

1

4

18

J (1)

Hetero (1)

281b

1

63

10

8

1

4

18

J (1)

Hetero (1)

56a

9

6

1

19

7

2

1

VI

E (9)

Hetero (7), MSM (2)

58a

1

22

27

13

17

13

28

VIII

L2 (1)

MSM (1)

58b

16

28

27

13

17

13

28

VIII

L2b (16)

MSM (16)

77b

1

31

5

19

7

2

37

D (1)

Hetero (1)

91a

1

24

5

19

5

2

4

IV

F (1)

MSM (1)

97b

1

35

12

5

11

9

8

H (1)

Hetero (1)