Skip to main content

Table 1 Bacterial strains and reactivity in the RPA and PCR assays

From: Development of a rapid recombinase polymerase amplification assay for the detection of Streptococcus pneumoniae in whole blood

Organism

Strain IDa

RPA

PCR

S. pneumoniae

DSM 20566

+

+

S. pneumoniae

DSM 11865

+

+

S. pneumoniae

DSM 11866

+

+

S. pneumoniae

DSM 14377

+

+

S. pneumoniae

DSM 24048

+

+

S. pneumoniae

DSM 11868

+

+

S. pneumoniae

DSM 25971

+

+

S. pneumoniae

DSM 14378

+

+

Clinical Isolates

S. pneumoniae

Clinical Isolates (n = 19)

+

+

S. agalactiae

Clinical isolate (n = 1)

-

-

N. meningitidis

Clinical isolate (n = 1)

-

-

Non-S. pneumonia reference strains

S. agalactiae

BCCM 15081

-

-

S. agalactiae

BCCM 15082

-

-

S. agalactiae

BCCM 15083

-

-

S. agalactiae

BCCM 15084

-

-

S. agalactiae

BCCM 15085

-

-

S. agalactiae

BCCM 15086

-

-

S. agalactiae

BCCM 15087

-

-

S. agalactiae

BCCM 15094

-

-

S. agalactiae

BCCM 15095

-

-

S. anginosus

BCCM 20563

-

-

S. australis

BCCM 15627

-

-

S. bovis

BCCM 20480

-

-

S. canis

BCCM 20715

-

-

S. constellatus

BCCM 20575

-

-

S. cristatus

DSM 8249

-

-

S. downei

DSM 5365

-

-

S. dysgalactiae

DSM 6176

-

-

S. equi

DSM 20561

-

-

S. equinis

DSM 20554

-

-

S. gordonii

DSM 6777

-

-

S. infantis

DSM 12492

-

-

S. intermedius

DSM 20573

-

-

S. mitis

DSM 12643

-

-

S. mutans

DSM 20523

-

-

S. oralis

DSM 20066

-

-

S. parasanguinis

DSM 6778

-

-

S. perosis

DSM 12493

-

-

S. porcinus

DSM 20725

-

-

S. pseudopneumoniae

DSM 18670

-

-

S. pyogenes

DSM 2072

-

-

S. pyogenes

DSM 20565

-

-

S. salivarius

DSM 20560

-

-

S. salivarius

DSM 20617

-

-

S. sanguinis

DSM 20567

-

-

S. sinensis

DSM 14990

-

-

S. suis

DSM 9682

-

-

S. uberis

DSM 20569

-

-

S. vestibularis

DSM 5636

-

-

H. influenzae

DSM 4690

-

-

H. influenzae

DSM 11121

-

-

H. parainfluenzae

DSM 8978

-

-

H. haemolyticus

CCUG 15312

-

-

H. somnus

CCUG 12839

-

-

N. meningitidis

DSM 10036

-

-

K. pneumoniae

DSM 30184

-

-

P. aeruginosa

DSM 50071

-

-

E. coli

DSM 30083

-

-

E. faecalis

DSM 20317

-

-

C. albicans

CBS 2700

-

-

B. fragilis

DSM 2151

-

-

M. cattarhalis

DSM 11994

-

-

S. aureus

DSM 346

-

-

  1. aDSM Leibniz-Institut, DSMZ Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen GmbH, BCCM Belgian Coordinated Collections of Microorganisms, CCUG Culture Collection, University of Göteborg, Sweden
Back to article page

BMC Infectious Diseases

ISSN: 1471-2334

Contact us