Table 3 The amino acid mutation of dihydrofolate reductase of trimethoprim-sulfamethoxazole-susceptible and –resistant isolates
Reference sequencea | Sequence types of SXT-susceptible isolates | Sequence types of SXT-resistant isolates | |||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
sites | Amino acid | S1 (6) | S2 (15) | S3 (55) | R1 (1) | R2 (1) | R3 (1) | R4 (1) | R5 (1) | R6 (1) | R7 (1) | R8 (1) | R9 (2) | R10 (2) | R11 (3) | R12 (4) | R13 (5) | R14 (6) | R15 (11) | R16 (12) | R17 (15) |
1 | Met | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | Ile | - | - |
6 | Val | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | Ile | - | - | - | - | - | - | Ile | - | - |
13 | Glu | - | - | Lys | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
14 | Glu | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | Asp | - |
20 | Glu | - | - | - | - | Asp | Asp | Asp | Asp | Asp | - | Asp | Asp | Asp | Asp | Asp | Asp | Asp | Asp | Asp | Asp |
26 | His | - | - | - | - | Tyr | - | - | Tyr | - | - | - | - | - | - | Tyr | Tyr | - | Tyr | - | Tyr |
32 | Gln | - | - | - | - | - | - | - | - | Lys | - | - | - | - | - | - | - | - | Arg | - | - |
53 | Met | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | Ile | - | - | - |
60 | Lys | - | - | - | - | - | - | - | - | Gly | - | Gln | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
70 | Pro | - | - | - | - | Leu | Ser | - | - | Val | Ser | Leu | Leu | Ser | Ser | Ser | Ser | Ser | Ser | Ser | Arg |
73 | Lys | - | - | - | - | - | - | - | - | Ser | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
74 | Ile | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | Leu | - |
75 | Asp | - | - | - | - | - | - | - | - | Glu | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
78 | Ala | - | - | - | - | Thr | Thr | Thr | Thr | Leu | - | - | - | - | - | Thr | - | - | Thr | - | Thr |
79 | Thr | - | - | - | - | - | - | - | - | Val | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
81 | Gln | - | - | - | - | - | Tyr | Tyr | Tyr | - | Tyr | His | His | Tyr | His | Tyr | His | His | Tyr | His | Tyr |
82 | Asp | - | - | - | - | - | - | - | - | Asn | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
83 | Val | - | - | - | - | Ile | - | - | - | - | - | - | - | - | Ile | - | Ile | - | - | - | - |
84 | Gln | - | - | - | - | - | - | - | - | Glu | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
85 | Ser | - | - | - | - | - | - | - | - | Asp | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
88 | Asp | - | - | - | - | - | - | Gly | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
91 | Gln | - | - | - | - | - | - | - | - | His | - | - | - | - | - | His | - | - | - | His | - |
92 | Asp | Ala | Ala | Ala | - | Gly | Ala | Ala | Ala | Asn | Ala | Ala | Ala | Ala | Ala | Ala | Ala | Val | Ala | Ala | Ala |
94 | Glu | - | - | - | - | Asp | Asp | - | Asp | Asp | Asp | - | - | Asp | Asp | Asp | Asp | - | Asp | Asp | Asp |
99 | Ile | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | Val | - | - | - | - | - | - |
100 | Ile | - | - | - | Leu | Leu | Leu | Leu | Leu | Leu | Leu | Leu | Leu | Leu | Leu | Leu | Leu | Leu | Leu | Leu | Leu |
105 | Ile | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | Val | - | - | - | - | - |
108 | Ala | - | - | - | - | - | - | - | - | Leu | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
110 | Glu | Gly | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
111 | Pro | - | Ala | Ala | - | - | Ser | - | - | - | - | Ser | - | - | - | - | - | Ser | Ser | - | Ser |
116 | Val | - | - | - | - | - | - | - | - | Ile | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
120 | His | - | - | - | - | Gln | - | Gln | - | Gln | - | - | - | - | - | Gln | - | - | Gln | - | Gln |
124 | Arg | - | - | - | - | - | - | - | - | Gln | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | Lys |
130 | Tyr | - | - | - | - | - | - | - | - | Phe | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
133 | Glu | - | - | Gly | Lys | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
134 | Glu | - | - | - | - | - | - | - | - | Asp | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
135 | Leu | - | - | - | - | - | Phe | Phe | Phe | Phe | Phe | Phe | Phe | Phe | Phe | Phe | Phe | Phe | Phe | Phe | Phe |
137 | Leu | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | S | - | - |
138 | Ser | - | - | - | - | - | - | - | - | Thr | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
139 | Leu | - | - | - | - | Ile | - | - | Ile | Val | Ile | - | - | Ile | - | - | - | - | - | - | - |
142 | Thr | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | Ile | Met | - | Pro |
144 | Ser | - | - | - | - | - | - | - | - | Ala | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
147 | Phe | - | - | - | - | - | - | Ser | Ser | Ser | Ser | Ser | Ser | Ser | - | Ser | Ser | Ser | - | Ser | Ser |
148 | Tyr | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | Phe | - | - | - | - | - |
149 | Ala | - | - | - | - | - | - | Thr | Thr | Thr | Thr | Thr | Thr | Thr | Val | Thr | Thr | Thr | - | Thr | Thr |
150 | Lys | - | - | - | - | - | - | - | - | Arg | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
155 | Pro | - | - | - | - | - | - | - | - | Ala | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
160 | Ile | - | - | - | - | - | - | - | - | - | Thr | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
161 | Gln | - | - | - | - | - | - | - | - | Glu | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
162 | Tyr | - | - | - | - | - | Cys | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |