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Table 2 Molecular characterisation of paediatric S. pneumoniae serotypes by MLST

From: Molecular epidemiology of pneumococci obtained from Gambian children aged 2–29 months with invasive pneumococcal disease during a trial of a 9-valent pneumococcal conjugate vaccine

   Allelic profile
Serotype ST aroE gdh gki recP spi xpt ddl
Serotype 1 618 13 8 4 1 7 19 14
  3336 13 8 4 1 7 19 161
Serotype 2 3314 2 13 4 1 6 6 6
Serotype 4 1469 8 88 103 18 46 142 161
  3304 1 5 1 1 15 1 14
Serotype 5 289 16 12 9 1 41 33 33
  3338 16 12 9 1 4 33 9
  3404 16 12 9 1 176 33 33
  3313 2 12 9 10 17 1 33
  3339 16 12 9 1 41 33 9
Serotype 6A 912 6 57 34 28 7 1 9
  913 6 57 83 28 7 19 9
  1737 6 57 34 28 6 1 9
  2157 1 8 1 5 42 60 14
  3324 7 8 1 5 42 60 14
Serotype 6B 385 7 6 1 2 6 1 14
  3342 60 82 4 5 42 122 28
  3323 7 6 1 35 6 1 14
Serotype 8 3325 7 9 15 11 93 58 70
  3406 7 9 15 11 178 58 70
Serotype 9L 1735 6 5 2 5 36 1 5
  3305 1 8 4 15 16 3 31
  3317 6 5 2 6 36 1 5
Serotype 9V 2179 15 17 4 4 6 1 17
  3337 15 17 4 16 6 20 161
  3409 15 17 4 4 179 20 17
Serotype 12F 989 12 5 89 8 6 112 14
Serotype 12B 3335 12 5 89 8 6 25 14
Serotype 14 63 2 5 36 12 17 21 14
  3320 6 60 1 5 27 20 6
  3312 2 5 89 12 27 21 14
  3321 6 60 4 5 27 20 6
  3333 10 60 4 12 15 112 6
  3310 2 5 36 12 27 21 14
  3318 6 9 4 5 27 20 6
  3322 6 60 4 5 27 38 6
  3309 2 5 36 12 17 38 14
  3311 2 5 89 12 17 21 14
Serotype 16F 3341 23 12 4 1 6 12 74
  3407 23 189 4 12 43 4 74
  3408 23 189 4 12 15 241 74
  3419 6 189 4 12 15 241 74
Serotype 18C 1233 10 11 34 16 15 1 145
Serotype 18F 2425 10 5 34 16 36 142 31
Serotype 19A 202 8 16 19 15 6 40 26
  847 7 11 4 1 6 112 14
  2174 7 16 8 8 6 142 14
  3327 7 11 4 10 6 112 14
  3326 7 11 4 1 6 112 15
  3330 7 16 4 1 6 112 14
  3315 5 6 1 2 6 1 5
  3331 7 16 8 8 4 142 14
Serotype 19F 3307 2 5 4 10 6 1 14
  3340 16 16 19 1 6 20 33
Serotype 20 1734 5 31 8 1 27 1 31
  3316 6 5 2 5 67 49 18
Serotype 21 1746 10 13 4 16 15 1 6
Serotype 22 910 5 5 6 5 9 17 19
  2214 5 5 4 4 11 19 18
Serotype 23F 802 10 13 53 1 72 38 31
  1526 7 13 8 6 25 1 8
  3343 7 13 53 1 72 38 14
  3410 118 8 4 12 72 19 5
Serotype 29 2942 12 111 34 84 19 83 6
Serotype 33 445 2 5 29 5 42 3 18
  3308 2 5 29 18 13 3 18
Serotype 35B 3329 7 13 4 8 6 20 18
  3328 7 13 4 8 6 1 18
Serotype 38 310 1 43 41 18 13 49 6
  3306 1 43 41 18 13 49 5
Serotype 45 3332 8 15 89 1 19 1 6
Serotype 46 3334 12 5 53 8 7 27 14