Table 2 Species distribution of non-tuberculous mycobacteria isolated in 10 European Union countries
From: Inventory study of non-tuberculous mycobacteria in the European Union
Species* | Country | Total | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Croatia (2008-2010) | Denmark (2011) | Estonia (2004-2011) | Finland (1995-2011) | Germany (2011) | Greece (2005-2011) | Italy (2001-2010) | Luxembourg (2009-2011) | Netherlands (2006-2011) | Slovenia (2000-2010) | ||
M. avium | 33 | 86 | 308 | 1,568 | 176 | 101 | 350 | 23 | 1,274 | 349 | 4,268 |
M. gordonae | 377 | 9 | 96 | 1,286 | 176 | 31 | 253 | 26 | 623 | 365 | 3,242 |
M. xenopi | 122 | 7 | 12 | 13 | 9 | 687 | 13 | 77 | 615 | 1,555 | |
M. intracellulare | 23 | 15 | 52 | 636 | 272 | 49 | 104 | 3 | 359 | 156 | 1,669 |
M. fortuitum | 98 | 2 | 65 | 521 | 68 | 66 | 144 | 239 | 150 | 1,353 | |
M. kansasii | 8 | 5 | 11 | 53 | 58 | 22 | 39 | 6 | 283 | 181 | 666 |
M. chelonae | 31 | 3 | 20 | 179 | 56 | 37 | 55 | 4 | 173 | 32 | 590 |
M. abscessus | 25 | 10 | 17 | 94 | 37 | 17 | 111 | 11 | 228 | 24 | 574 |
M. malmoense | 12 | 14 | 184 | 10 | 7 | 11 | 6 | 108 | 22 | 374 | |
M. lentiflavum | 6 | 5 | 246 | 4 | 6 | 45 | 5 | 317 | |||
M. marinum | 7 | 3 | 50 | 29 | 5 | 15 | 4 | 115 | 6 | 234 | |
M. terrae | 52 | 151 | 16 | 6 | 225 | ||||||
M. peregrinum | 9 | 3 | 15 | 81 | 20 | 33 | 1 | 6 | 168 | ||
M. simiae | 3 | 69 | 5 | 21 | 3 | 64 | 165 | ||||
M. bohemicum | 106 | 1 | 4 | 3 | 10 | 124 | |||||
M. chimaera | 48 | 5 | 68 | 121 | |||||||
M. interjectum | 1 | 3 | 87 | 6 | 9 | 14 | 120 | ||||
M. nonchromogenicum | 18 | 38 | 1 | 41 | 1 | 21 | 120 | ||||
M. arupense | 7 | 83 | 3 | 8 | 101 | ||||||
M. celatum | 3 | 7 | 1 | 3 | 8 | 12 | 1 | 11 | 21 | 67 | |
M. mucogenicum | 3 | 6 | 38 | 15 | 62 | ||||||
M. scrofulaceum | 2 | 16 | 12 | 12 | 12 | 54 | |||||
M. szulgai | 2 | 3 | 13 | 11 | 17 | 6 | 52 | ||||
M. kumamotonense | 1 | 46 | 1 | 48 | |||||||
M. heraklionense | 46 | 46 | |||||||||
M. genavense | 8 | 5 | 18 | 31 | |||||||
M. phlei | 4 | 7 | 3 | 13 | 27 | ||||||
M. vulneris | 26 | 1 | 27 | ||||||||
M. haemophilum | 1 | 1 | 18 | 20 | |||||||
M. triviale | 15 | 2 | 17 | ||||||||
M. arosiense | 15 | 15 | |||||||||
M. florentinum | 1 | 6 | 5 | 12 | |||||||
M. nebraskense | 11 | 1 | 12 | ||||||||
M. neoaurum | 3 | 5 | 4 | 12 | |||||||
M. vaccae | 10 | 1 | 11 | ||||||||
M. elephantis | 10 | 10 | |||||||||
M. insubricum | 1 | 8 | 9 | ||||||||
M. parascrofulaceum | 4 | 5 | 9 | ||||||||
M. sherrisii | 9 | 9 | |||||||||
M. alvei | 2 | 6 | 8 | ||||||||
M. porcinum | 5 | 2 | 1 | 8 | |||||||
M. europaeum | 3 | 4 | 7 | ||||||||
M. flavescens | 6 | 1 | 7 | ||||||||
M. shimoidei | 4 | 3 | 7 | ||||||||
M. gilvum | 6 | 6 | |||||||||
M. longobardum | 6 | 6 | |||||||||
M. paraffinicum | 1 | 4 | 1 | 6 | |||||||
M. triplex | 6 | 6 | |||||||||
M. branderi | 1 | 1 | 3 | 5 | |||||||
M. goodii | 1 | 1 | 3 | 5 | |||||||
M. holsaticum | 2 | 2 | 1 | 5 | |||||||
M. smegmatis | 4 | 1 | 5 | ||||||||
M. thermoresistibile | 1 | 4 | 5 | ||||||||
M. cosmeticum | 1 | 3 | 4 | ||||||||
M. heckeshornense | 1 | 1 | 1 | 1 | 4 | ||||||
M. agri | 1 | 2 | 3 | ||||||||
M. brumae | 2 | 1 | 3 | ||||||||
M. flavescens/ M. novocastrense | 3 | 3 | |||||||||
M. frederiksbergense | 3 | 3 | |||||||||
M. hassiacum | 1 | 2 | 3 | ||||||||
M. heidelbergense | 1 | 2 | 3 | ||||||||
M. lepraemurium | 3 | 3 | |||||||||
M. mantenii | 2 | 1 | 3 | ||||||||
M. noviomagense | 1 | 2 | 3 | ||||||||
M. palustre | 3 | 3 | |||||||||
M. setense | 3 | 3 | |||||||||
M. wolinskyi | 1 | 2 | 3 | ||||||||
M. aichiense | 2 | 2 | |||||||||
M. engbaekii | 2 | 2 | |||||||||
M. gastri | 2 | 2 | |||||||||
M. immunogenum | 2 | 2 | |||||||||
M. intermedium | 2 | 2 | |||||||||
M. llatzerense | 2 | 2 | |||||||||
M. mageritense | 2 | 2 | |||||||||
M. monacense | 2 | 2 | |||||||||
M. novocastrense | 1 | 1 | 2 | ||||||||
M. phocaicum | 1 | 1 | 2 | ||||||||
M. pulveris | 2 | 2 | |||||||||
M. rhodesiae | 2 | 2 | |||||||||
M. riyadhense | 1 | 1 | 2 | ||||||||
M. asiaticum | 1 | 1 | |||||||||
M. aubagnense | 1 | 1 | |||||||||
M. chlorophenolicum | 1 | 1 | |||||||||
M. colombiense | 1 | 1 | |||||||||
M. conceptionense | 1 | 1 | |||||||||
M. conspicuum | 1 | 1 | |||||||||
M. duvalii | 1 | 1 | |||||||||
M. fluoroanthenivorans | 1 | 1 | |||||||||
M. gadium | 1 | 1 | |||||||||
M. hiberniae | 1 | 1 | |||||||||
M. kyorinense | 1 | 1 | |||||||||
M. massiliense | 1 | 1 | |||||||||
M. parmense | 1 | 1 | |||||||||
M. poriferae | 1 | 1 | |||||||||
M. senegalense | 1 | 1 | |||||||||
M. senuense | 1 | 1 | |||||||||
M. timonense | 1 | 1 | |||||||||
M. tokaiense | 1 | 1 | |||||||||
M. tusciae | 1 | 1 | |||||||||
Unknown | 8 | 57 | 429# | 41 | 48 | 96 | 2 | 186 | 279 | 717 | |
Total | 848 | 182 | 698 | 5,778 | 1,068 | 426 | 2,498 | 123 | 3,996 | 2,240 | 17,857 |