TY - JOUR AU - Helb, D. AU - Jones, M. AU - Story, E. AU - Boehme, C. AU - Wallace, E. AU - Ho, K. AU - Kop, J. AU - Owens, M. R. AU - Rodgers, R. AU - Banada, P. AU - Safi, H. AU - Blakemore, R. AU - Lan, N. T. AU - Jones-López, E. C. AU - Levi, M. AU - Burday, M. AU - Ayakaka, I. AU - Mugerwa, R. D. AU - McMillan, B. AU - Winn-Deen, E. AU - Christel, L. AU - Dailey, P. AU - Perkins, M. D. AU - Persing, D. H. AU - Alland, D. PY - 2010 DA - 2010// TI - Rapid detection of Mycobacterium tuberculosis and rifampin resistance by use of on-demand, near-patient technology JO - J Clin Microbiol VL - 48 UR - https://doi.org/10.1128/JCM.01463-09 DO - 10.1128/JCM.01463-09 ID - Helb2010 ER - TY - JOUR AU - Boehme, C. C. AU - Nabeta, P. AU - Hillemann, D. AU - Nicol, M. P. AU - Shenai, S. AU - Krapp, F. AU - Allen, J. AU - Tahirli, R. AU - Blakemore, R. AU - Rustomjee, R. AU - Milovic, A. AU - Jones, M. AU - O'Brien, S. M. AU - Persing, D. H. AU - Ruesch- Gerdes, S. AU - Gotuzzo, E. AU - Rodriques, C. AU - Alland, D. AU - Perkins, M. D. PY - 2010 DA - 2010// TI - Rapid molecular detection of tuberculosis and rifampin resistance JO - N Engl J Med VL - 363 UR - https://doi.org/10.1056/NEJMoa0907847 DO - 10.1056/NEJMoa0907847 ID - Boehme2010 ER - TY - JOUR AU - Ramaswamy, S. AU - Musser, J. M. PY - 1998 DA - 1998// TI - Molecular genetic basis of antimicrobial agent resistance in Mycobacterium tuberculosis JO - Tuberc Lung Dis VL - 79 UR - https://doi.org/10.1054/tuld.1998.0002 DO - 10.1054/tuld.1998.0002 ID - Ramaswamy1998 ER - TY - JOUR AU - Drobniewski, F. A. AU - Wilson, S. M. PY - 1998 DA - 1998// TI - The rapid diagnosis of isoniazid and rifampin resistance in Mycobacterium tuberculosis: a molecular story JO - J. Med. Microbiol VL - 47 UR - https://doi.org/10.1099/00222615-47-3-189 DO - 10.1099/00222615-47-3-189 ID - Drobniewski1998 ER - TY - STD TI - Global tuberculosis Report: 2013, https://extranet.who.int/sree/Reports?op=Replet&name=/WHO_HQ_Reports/G2/PROD/EXT/TBCountryProfile&ISO2=UG&outtype=html, UR - https://extranet.who.int/sree/Reports?op=Replet&name=/WHO_HQ_Reports/G2/PROD/EXT/TBCountryProfile&ISO2=UG&outtype=html ID - ref5 ER - TY - JOUR AU - Li, W. M. AU - Wang, S. M. AU - Li, C. Y. AU - Liu, Y. H. AU - Shen, G. M. AU - Zhang, X. X. AU - Niu, T. G. AU - Gao, Q. AU - van Soolingen, D. AU - Kremer, K. AU - Duanmu, H. J. PY - 2005 DA - 2005// TI - Molecular epidemiology of Mycobacterium tuberculosis in China: a nationwide random survey in 2000 JO - Int J Tuberc Lung Dis VL - 9 ID - Li2005 ER - TY - JOUR AU - Mokrousov, I. AU - Bhanu, N. V. AU - Suffys, P. N. AU - Kadival, G. V. AU - Yap, S. F. AU - Cho, S. N. AU - Jordaan, A. M. AU - Narvskaya, O. AU - Singh, U. B. AU - Gomes, H. M. AU - Lee, H. AU - Kulkarni, S. P. AU - Lim, K. C. AU - Khan, B. K. AU - van Soolingen, D. AU - Victor, T. C. AU - Schouls, L. M. PY - 2004 DA - 2004// TI - Multicenter evaluation 325 of reverse line blot assay for detection of drug resistance in Mycobacterium tuberculosis clinical isolates JO - J Microbiol Methods VL - 57 UR - https://doi.org/10.1016/j.mimet.2004.02.006 DO - 10.1016/j.mimet.2004.02.006 ID - Mokrousov2004 ER - TY - JOUR AU - Tsolaki, A. G. AU - Gagneux, S. AU - Pym, A. S. AU - de la Salmoniere YO, G. AU - Kreiswirth, B. N. AU - Van Soolingen, D. AU - Small, P. M. PY - 2005 DA - 2005// TI - Genomic deletions classify the Beijing/W strains as a distinct genetic lineage of Mycobacterium tuberculosis JO - J Clin Microbiol VL - 43 UR - https://doi.org/10.1128/JCM.43.7.3185-3191.2005 DO - 10.1128/JCM.43.7.3185-3191.2005 ID - Tsolaki2005 ER - TY - JOUR AU - van Soolingen, D. AU - Qian, L. AU - de Haas, P. E. AU - Douglas, J. T. AU - Traore, H. AU - Portaels, F. AU - Qing, H. Z. AU - Enkhsaikan, D. AU - Nymadawa, P. AU - van Embden, J. D. PY - 1995 DA - 1995// TI - Predominance of a single genotype of Mycobacterium tuberculosis in countries of East Asia JO - J Clin Microbiol VL - 33 ID - van Soolingen1995 ER - TY - JOUR AU - Brossier, F. AU - Veziris, N. AU - Truffot-Pernot, C. AU - Jarlier, V. AU - Sougakoff, W. PY - 2006 DA - 2006// TI - Performance of the genotype MTBDR line probe assay for detection of resistance to rifampin and isoniazid in strains of Mycobacterium tuberculosis with low- and high-level resistance JO - J Clin Microbiol VL - 44 UR - https://doi.org/10.1128/JCM.01054-06 DO - 10.1128/JCM.01054-06 ID - Brossier2006 ER - TY - JOUR AU - Ocheretina, O. AU - Escuyer, V. E. AU - Mabou, M. AU - Royal-Mardi, G. AU - Collins, S. AU - Vilbrun, S. C. AU - Pape, J. W. AU - Fitzgerald, D. W. PY - 2014 DA - 2014// TI - Correlation between Genotypic and Phenotypic Testing for Resistance to Rifampin in Mycobacterium tuberculosis Clinical Isolates in Haiti: Investigation of Cases with Discrepant Susceptibility Results JO - PLoS ONE VL - 9 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0090569 DO - 10.1371/journal.pone.0090569 ID - Ocheretina2014 ER - TY - JOUR AU - Jones-López, E. AU - Manabe, Y. C. AU - Palaci, M. AU - Kayiza, C. AU - Armstrong, D. AU - Nakiyingi, L. AU - Ssengooba, W. AU - Gaeddert, M. AU - Kubiak, R. AU - Almeida, J. P. AU - Alland, D. AU - Dietze, R. AU - Joloba, L. M. AU - Ellner, J. J. AU - Dorman, S. E. PY - 2014 DA - 2014// TI - Prospective cross-sectional evaluation of the small membrane filtration method for diagnosis of pulmonary tuberculosis JO - J Clin Microbiol VL - 52 UR - https://doi.org/10.1128/JCM.00642-14 DO - 10.1128/JCM.00642-14 ID - Jones-López2014 ER - TY - JOUR AU - Yue, J. AU - Shi, W. AU - Xie, J. AU - Li, Y. AU - Zeng, E. PY - 2003 DA - 2003// TI - Mutations in the rpoB Gene of Multidrug- Resistant Mycobacterium tuberculosis Isolates from China JO - J Clin Microbiol VL - 41 UR - https://doi.org/10.1128/JCM.41.5.2209-2212.2003 DO - 10.1128/JCM.41.5.2209-2212.2003 ID - Yue2003 ER - TY - JOUR AU - Moure, R. AU - Muñoz, L. AU - Torres, M. AU - Santin, M. AU - Martín, R. AU - Alcaide, F. PY - 2011 DA - 2011// TI - Rapid detection of Mycobacterium tuberculosis complex and rifampin resistance in smear-negative clinical samples by use of an integrated real time PCR method JO - J Clin Microbiol VL - 49 UR - https://doi.org/10.1128/JCM.01831-10 DO - 10.1128/JCM.01831-10 ID - Moure2011 ER - TY - JOUR AU - Boehme, C. C. AU - Nicol, M. P. AU - Nabeta, P. AU - Michael, J. S. AU - Gotuzzo, E. AU - Tahirli, R. AU - Gler, M. T. AU - Blakemore, R. AU - Worodria, W. AU - Gray, C. AU - Huang, L. AU - Caceres, T. AU - Mehdiyev, R. AU - Raymond, L. AU - Whitelaw, A. AU - Sagadevan, K. AU - Alexander, H. AU - Albert, H. AU - Cobelens, F. AU - Cox, H. AU - Alland, D. AU - Perkins, M. D. PY - 2011 DA - 2011// TI - Feasibility, diagnostic accuracy and effectiveness of decentralised use of the Xpert® MTB/RIF test for diagnosis of tuberculosis and multidrug resistance: a multicentre implementation study JO - Lancet VL - 377 UR - https://doi.org/10.1016/S0140-6736(11)60438-8 DO - 10.1016/S0140-6736(11)60438-8 ID - Boehme2011 ER - TY - JOUR AU - Lukoye, D. AU - Adatu, F. AU - Musisi, K. AU - Kasule, G. W. AU - Were, W. AU - Odeke, R. AU - Kalamya, J. N. AU - Awor, A. AU - Date, A. AU - Joloba, L. M. PY - 2013 DA - 2013// TI - Anti-Tuberculosis Drug Resistance among New and Previously Treated Sputum Smear-Positive Tuberculosis Patients in Uganda: Results of the First National Survey JO - PLoS ONE VL - 8 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0070763 DO - 10.1371/journal.pone.0070763 ID - Lukoye2013 ER - TY - STD TI - The pre-publication history for this paper can be accessed here:http://www.biomedcentral.com/1471-2334/14/481/prepub UR - http://www.biomedcentral.com/1471-2334/14/481/prepub ID - ref17 ER -