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Table 1 Oligonucleotide primers

From: Characterization of extensively drug-resistant Mycobacterium tuberculosis isolates circulating in Siberia

Primer

Nucleotide structure

ETRA1

5′-GATTGAGGGGATCGTGATTGG-3′

ETRA2

5′-AAATCGGTCCCATCACCTTCTTAT-3′

ETRB1

5′-GCGAACACCAGGACAGCATCATG-3′

ETRB2

5′-GGCATGCCGGTGATCGAGTGG-3′

ETRC1

5′-GTGAGTCGCTGCAGAACCTGCAG-3′

ETRC2

5′-GGCGTCTTGACCTCCACGAGTG-3′

MIRU02U

5′-CAGGACACGGGTTCTACTG-3′

MIRU02R

5′-GGACTAGGTCGAGGTTGTGTC-3′

MIRU04U

5′-CAGGTCACAACGAGAGGAAGAGC-3′

MIRU04R

5′-GCGGATCGGCCAGCGACTCCTC-3′

MIRU10U

5′-GACTTCCAACAGCACCGTCTTATC-3′

MIRU10R

5′-TCGCACCGATCACGCTACG-3′

MIRU16U

5′-GTTGGAAACGGCGGTTATTGAC-3′

MIRU16R

5′-CGGAGTCGTCCAGCAAGACC-3′

MIRU20U

5′-TCGGAGAGATGCCCTTCGAGTTAG -3′

MIRU20R

5′-TCACGGTCTCCGCACTAACG-3′

MIRU23U

5′-CTCACCAGGATCGCCAAACC-3′

MIRU23R

5′-TCTGACTCATGGTGTCCAACC-3′

MIRU24U

5′-GCTTGTGCGGGAAGGCTA-3′

MIRU24R

5′-CGATCGCGGATCTTTGCT-3′

MIRU26U

5′-CCAGCAGTTGAGCACAGTTCG-3′

MIRU26R

5′-GGATAGGTCCGAGTTCGATTTCC-3′

MIRU27U

5′-CGGTGACCAACGTCAGATTC-3′

MIRU27R

5′-GCGATGTGAGCGTGCCACTCAA-3′

MIRU31U

5′-CTTCGGCGTCGAAGAGAGCCTC-3′

MIRU31R

5′-CGGAACGCTGGTCACCACCTAAG-3′

MIRU39U

5′-CATCGACAAACTGGAGCCAAAC-3′

MIRU39R

5′-GAAACGTCTACGCCCCACAC-3′

MIRU40U

5′-GCAAGAGCAAGAGCACCAAGC-3′

MIRU40R

5′-TGTCTAATCAGGTCTTTCTCTCACGC-3′

MTUB30U

5′-CTTGAAGCCCCGGTCTCATCTGT-3′

MTUB30R

5′-ACTTGAACCCCCACGCCCATTAGTA-3′

MTUB39U

5′-CGGTGGAGGCGATGAACGTCTTC -3′

MTUB39R

5′-TAGAGCGGCACGGGGGAAAGCTTAG-3′

QUB4156U

5′-TGACCACGGATTGCTCTAGT-3′

QUB4156R

5′-GCCGGCGTCCATGTT-3′

V11U

5′- CGCTAGACGTCAGATCCCAG -3′

V11R

5′- GTCTGTTCCGACGCCAATAG -3′

RD105U

5′-GCTGTTTTGCTGTGGATTGTG-3′

RD105R

5′-TCACGTAGCCGCTCAAGAG-3′

RD207U

5′-GAGGATCTTCAGCAGTTGTTCTGG-3′

RD207R

5′-CTTGAAGTACTCGGAAGGTTCG-3′

RD150-1

5′-GTGCTTCGGGGATCAAGG-3′

RD150-2

5′-GGTCTATCCGCTATGTTGTGG-3′

RD181-1

5′-CTGCCGCACAACCAATG-3′

RD181-2

5′-GTGGCGACCAGATCCTTG-3′

RD150-4

5′-GTGCTTCGGGGATCAAGG-3′

RD150-3

5′-GGTCTATCCGCTATGTTGTGG-3′

RD142-U

5′-CGAGTTCAAGGCGATGTTC-3′

RD142-R

5′-GATGTGGTCGTGGTCTCC-3′

RD149-1

5′-GTAGAGGGTTTCCAGTTCCAG-3′

RD149-2

5′- GACGCCGTTGACTTGTTG -3′

RD152-3

5′-GCAGCAACCACCAGGACTC-3′

RD152-4

5′-ACATCAACGCAGCCATCG-3′

RD174-U

5′-CAAGAATCCAAGGCAGAG-3′

RD174-R

5′-CTAACAGCACAAGGTCAC-3′

RD239-1

5′-GACCAACCCTGCTCTTTCTAC-3′

RD239-2

5′-TTGGCGAGGTCTCTTGTC-3′

RD702-U

5′-GGTTGGGTGATGTCGGATTGG-3′

RD702-R

5′-CAGGCGGTCGGTGAATGC-3′

RD711-U

5′-TATCCCGATGACCAATGC-3′

RD711-R

5′-TGCGAGTGATAGATGACG-3′

RD724-U

5′-TCGTAGGGATGACTTGAC-3′

RD724-R

5′-AAGCGTGTAAAGAGGAAC-3′

RD750-1

5′-TCCACGCCAATTTCAAGG-3′

RD750-2

5′-CTCATAGATCACTCGCACAGG-3′