TY - JOUR AU - Palella, F. J. AU - Delaney, K. M. AU - Moorman, A. C. AU - Loveless, M. O. AU - Fuhrer, J. AU - Satten, G. A. AU - Aschman, D. J. AU - Holmberg, S. D. PY - 1998 DA - 1998// TI - Declining morbidity and mortality among patients with advanced human immunodeficiency virus infection. HIV Outpatient Study Investigators JO - N Engl J Med VL - 338 UR - https://doi.org/10.1056/NEJM199803263381301 DO - 10.1056/NEJM199803263381301 ID - Palella1998 ER - TY - JOUR AU - Vercauteren, J. AU - Wensing, A. M. AU - van de Vijver, D. A. AU - Albert, J. AU - Balotta, C. AU - Hamouda, O. AU - Kucherer, C. AU - Struck, D. AU - Schmit, J. C. AU - Asjo, B. AU - Bruckova, M. AU - Camacho, R. J. AU - Clotet, B. AU - Coughlan, S. AU - Grossman, Z. AU - Horban, A. AU - Korn, K. AU - Kostrikis, L. AU - Nielsen, C. AU - Paraskevis, D. AU - Poljak, M. AU - Puchhammer-Stockl, E. AU - Riva, C. AU - Ruiz, L. AU - Salminen, M. AU - Schuurman, R. AU - Sonnerborg, A. AU - Stanekova, D. AU - Stanojevic, M. AU - Vandamme, A. M. PY - 2009 DA - 2009// TI - Transmission of drug-resistant HIV-1 is stabilizing in Europe JO - J Infect Dis VL - 200 UR - https://doi.org/10.1086/644505 DO - 10.1086/644505 ID - Vercauteren2009 ER - TY - JOUR AU - Bannister, W. P. AU - Cozzi-Lepri, A. AU - Clotet, B. AU - Mocroft, A. AU - Kjaer, J. AU - Reiss, P. AU - von Wyl, V. AU - Lazzarin, A. AU - Katlama, C. AU - Phillips, A. N. AU - Ruiz, L. AU - Lundgren, J. D. AU - Euro, S. PY - 2008 DA - 2008// TI - Transmitted drug resistant HIV-1 and association with virologic and CD4 cell count response to combination antiretroviral therapy in the EuroSIDA study JO - J Acquir Immune Defic Syndr VL - 48 UR - https://doi.org/10.1097/QAI.0b013e31817ae5c0 DO - 10.1097/QAI.0b013e31817ae5c0 ID - Bannister2008 ER - TY - JOUR AU - Booth, C. L. AU - Garcia-Diaz, A. M. AU - Youle, M. S. AU - Johnson, M. A. AU - Phillips, A. AU - Geretti, A. M. PY - 2007 DA - 2007// TI - Prevalence and predictors of antiretroviral drug resistance in newly diagnosed HIV-1 infection JO - J Antimicrob Chemother VL - 59 UR - https://doi.org/10.1093/jac/dkl501 DO - 10.1093/jac/dkl501 ID - Booth2007 ER - TY - JOUR AU - Yerly, S. AU - von Wyl, V. AU - Ledergerber, B. AU - Boni, J. AU - Schupbach, J. AU - Burgisser, P. AU - Klimkait, T. AU - Rickenbach, M. AU - Kaiser, L. AU - Gunthard, H. F. AU - Perrin, L. PY - 2007 DA - 2007// TI - Transmission of HIV-1 drug resistance in Switzerland: a 10-year molecular epidemiology survey JO - AIDS VL - 21 UR - https://doi.org/10.1097/QAD.0b013e3282f0b685 DO - 10.1097/QAD.0b013e3282f0b685 ID - Yerly2007 ER - TY - JOUR AU - Wheeler, W. H. AU - Ziebell, R. A. AU - Zabina, H. AU - Pieniazek, D. AU - Prejean, J. AU - Bodnar, U. R. AU - Mahle, K. C. AU - Heneine, W. AU - Johnson, J. A. AU - Hall, H. I. AU - Variant, A. AU - Resistant, H. I. V. S. G. PY - 2010 DA - 2010// TI - Prevalence of transmitted drug resistance associated mutations and HIV-1 subtypes in new HIV-1 diagnoses, U.S.-2006 JO - AIDS VL - 24 UR - https://doi.org/10.1097/QAD.0b013e3283388742 DO - 10.1097/QAD.0b013e3283388742 ID - Wheeler2010 ER - TY - JOUR AU - Hurt, C. B. AU - McCoy, S. I. AU - Kuruc, J. AU - Nelson, J. A. AU - Kerkau, M. AU - Fiscus, S. AU - McGee, K. AU - Sebastian, J. AU - Leone, P. AU - Pilcher, C. AU - Hicks, C. AU - Eron, J. PY - 2009 DA - 2009// TI - Transmitted antiretroviral drug resistance among acute and recent HIV infections in North Carolina from 1998 to 2007 JO - Antivir Ther VL - 14 ID - Hurt2009 ER - TY - JOUR AU - Wittkop, L. AU - Gunthard, H. F. AU - de Wolf, F. AU - Dunn, D. AU - Cozzi-Lepri, A. AU - de Luca, A. AU - Kucherer, C. AU - Obel, N. AU - von Wyl, V. AU - Masquelier, B. AU - Stephan, C. AU - Torti, C. AU - Antinori, A. AU - Garcia, F. AU - Judd, A. AU - Porter, K. AU - Thiebaut, R. AU - Castro, H. AU - van Sighem, A. I. AU - Colin, C. AU - Kjaer, J. AU - Lundgren, J. D. AU - Paredes, R. AU - Pozniak, A. AU - Clotet, B. AU - Phillips, A. AU - Pillay, D. AU - Chene, G. AU - EuroCoord, C. PY - 2011 DA - 2011// TI - Effect of transmitted drug resistance on virological and immunological response to initial combination antiretroviral therapy for HIV (EuroCoord-CHAIN joint project): a European multicohort study JO - Lancet Infect Dis VL - 11 UR - https://doi.org/10.1016/S1473-3099(11)70032-9 DO - 10.1016/S1473-3099(11)70032-9 ID - Wittkop2011 ER - TY - JOUR AU - Programme, S. P. R. E. A. D. PY - 2008 DA - 2008// TI - Transmission of drug-resistant HIV-1 in Europe remains limited to single classes JO - AIDS VL - 22 UR - https://doi.org/10.1097/QAD.0b013e3282f5e062 DO - 10.1097/QAD.0b013e3282f5e062 ID - Programme2008 ER - TY - STD TI - Countries in the WHO European Region. [http://www.who.int/about/regions/euro/en/index.html] UR - http://www.who.int/about/regions/euro/en/index.html ID - ref10 ER - TY - JOUR AU - Bennett, D. E. AU - Camacho, R. J. AU - Otelea, D. AU - Kuritzkes, D. R. AU - Fleury, H. AU - Kiuchi, M. AU - Heneine, W. AU - Kantor, R. AU - Jordan, M. R. AU - Schapiro, J. M. AU - Vandamme, A. M. AU - Sandstrom, P. AU - Boucher, C. A. AU - van de Vijver, D. AU - Rhee, S. Y. AU - Liu, T. F. AU - Pillay, D. AU - Shafer, R. W. PY - 2009 DA - 2009// TI - Drug resistance mutations for surveillance of transmitted HIV-1 drug-resistance: 2009 update JO - PLoS ONE VL - 4 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0004724 DO - 10.1371/journal.pone.0004724 ID - Bennett2009 ER - TY - JOUR AU - Frentz, D. AU - Wensing, A. M. AU - Albert, J. AU - Paraskevis, D. AU - Abecasis, A. B. AU - Hamouda, O. AU - Jorgensen, L. B. AU - Kucherer, C. AU - Struck, D. AU - Schmit, J. C. AU - Asjo, B. AU - Balotta, C. AU - Beshkov, D. AU - Camacho, R. J. AU - Clotet, B. AU - Coughlan, S. AU - De Wit, S. AU - Griskevicius, A. AU - Grossman, Z. AU - Horban, A. AU - Kolupajeva, T. AU - Korn, K. AU - Kostrikis, L. G. AU - Liitsola, K. AU - Linka, M. AU - Nielsen, C. AU - Otelea, D. AU - Paredes, R. AU - Poljak, M. AU - Puchhammer-Stockl, E. PY - 2013 DA - 2013// TI - Limited cross-border infections in patients newly diagnosed with HIV in Europe JO - Retrovirology VL - 10 UR - https://doi.org/10.1186/1742-4690-10-36 DO - 10.1186/1742-4690-10-36 ID - Frentz2013 ER - TY - JOUR AU - de Oliveira, T. AU - Deforche, K. AU - Cassol, S. AU - Salminen, M. AU - Paraskevis, D. AU - Seebregts, C. AU - Snoeck, J. AU - van Rensburg, E. J. AU - Wensing, A. M. AU - van de Vijver, D. A. AU - Boucher, C. A. AU - Camacho, R. AU - Vandamme, A. M. PY - 2005 DA - 2005// TI - An automated genotyping system for analysis of HIV-1 and other microbial sequences JO - Bioinformatics VL - 21 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bti607 DO - 10.1093/bioinformatics/bti607 ID - de Oliveira2005 ER - TY - JOUR AU - Posada, D. AU - Crandall, K. A. PY - 1998 DA - 1998// TI - MODELTEST: testing the model of DNA substitution JO - Bioinformatics VL - 14 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/14.9.817 DO - 10.1093/bioinformatics/14.9.817 ID - Posada1998 ER - TY - JOUR AU - Hillis, D. M. AU - Bull, J. J. PY - 1993 DA - 1993// TI - An emperical test of bootstrapping as a method for assessing confidence in phylogenetic analysis JO - Syst Biol VL - 42 UR - https://doi.org/10.1093/sysbio/42.2.182 DO - 10.1093/sysbio/42.2.182 ID - Hillis1993 ER - TY - JOUR AU - Gifford, R. J. AU - de Oliveira, T. AU - Rambaut, A. AU - Pybus, O. G. AU - Dunn, D. AU - Vandamme, A. M. AU - Kellam, P. AU - Pillay, D. PY - 2007 DA - 2007// TI - Phylogenetic surveillance of viral genetic diversity and the evolving molecular epidemiology of human immunodeficiency virus type 1 JO - J Virol VL - 81 UR - https://doi.org/10.1128/JVI.00889-07 DO - 10.1128/JVI.00889-07 ID - Gifford2007 ER - TY - JOUR AU - Yeni, P. G. AU - Hammer, S. M. AU - Carpenter, C. C. AU - Cooper, D. A. AU - Fischl, M. A. AU - Gatell, J. M. AU - Gazzard, B. G. AU - Hirsch, M. S. AU - Jacobsen, D. M. AU - Katzenstein, D. A. AU - Montaner, J. S. AU - Richman, D. D. AU - Saag, M. S. AU - Schechter, M. AU - Schooley, R. T. AU - Thompson, M. A. AU - Vella, S. AU - Volberding, P. A. PY - 2002 DA - 2002// TI - Antiretroviral treatment for adult HIV infection in 2002: updated recommendations of the International AIDS Society-USA Panel JO - JAMA VL - 288 UR - https://doi.org/10.1001/jama.288.2.222 DO - 10.1001/jama.288.2.222 ID - Yeni2002 ER - TY - JOUR AU - Yeni, P. G. AU - Hammer, S. M. AU - Hirsch, M. S. AU - Saag, M. S. AU - Schechter, M. AU - Carpenter, C. C. AU - Fischl, M. A. AU - Gatell, J. M. AU - Gazzard, B. G. AU - Jacobsen, D. M. AU - Katzenstein, D. A. AU - Montaner, J. S. AU - Richman, D. D. AU - Schooley, R. T. AU - Thompson, M. A. AU - Vella, S. AU - Volberding, P. A. PY - 2004 DA - 2004// TI - Treatment for adult HIV infection: 2004 recommendations of the International AIDS Society-USA panel JO - JAMA VL - 292 UR - https://doi.org/10.1001/jama.292.2.251 DO - 10.1001/jama.292.2.251 ID - Yeni2004 ER - TY - JOUR AU - Hammer, S. M. AU - Saag, M. S. AU - Schechter, M. AU - Montaner, J. S. AU - Schooley, R. T. AU - Jacobsen, D. M. AU - Thompson, M. A. AU - Carpenter, C. C. AU - Fischl, M. A. AU - Gazzard, B. G. AU - Gatell, J. M. AU - Hirsch, M. S. AU - Katzenstein, D. A. AU - Richman, D. D. AU - Vella, S. AU - Yeni, P. G. AU - Volberding, P. A. PY - 2006 DA - 2006// TI - Treatment for adult HIV infection: 2006 recommendations of the International AIDS Society-USA panel JO - JAMA VL - 296 UR - https://doi.org/10.1001/jama.296.7.827 DO - 10.1001/jama.296.7.827 ID - Hammer2006 ER - TY - JOUR AU - Hammer, S. M. AU - Eron, J. J. AU - Reiss, P. AU - Schooley, R. T. AU - Thompson, M. A. AU - Walmsley, S. AU - Cahn, P. AU - Fischl, M. A. AU - Gatell, J. M. AU - Hirsch, M. S. AU - Jacobsen, D. M. AU - Montaner, J. S. AU - Richman, D. D. AU - Yeni, P. G. AU - Volberding, P. A. PY - 2008 DA - 2008// TI - Antiretroviral treatment of adult HIV infection: 2008 recommendations of the International AIDS Society-USA panel JO - JAMA VL - 300 UR - https://doi.org/10.1001/jama.300.5.555 DO - 10.1001/jama.300.5.555 ID - Hammer2008 ER - TY - JOUR AU - Cane, P. AU - Chrystie, I. AU - Dunn, D. AU - Evans, B. AU - Geretti, A. M. AU - Green, H. AU - Phillips, A. AU - Pillay, D. AU - Porter, K. AU - Pozniak, A. AU - Sabin, C. AU - Smit, E. AU - Weber, J. AU - Zuckerman, M. PY - 2005 DA - 2005// TI - Time trends in primary resistance to HIV drugs in the United Kingdom: multicentre observational study JO - BMJ VL - 331 UR - https://doi.org/10.1136/bmj.38665.534595.55 DO - 10.1136/bmj.38665.534595.55 ID - Cane2005 ER - TY - JOUR AU - Vercauteren, J. AU - Derdelinckx, I. AU - Sasse, A. AU - Bogaert, M. AU - Ceunen, H. AU - De Roo, A. AU - De Wit, S. AU - Deforche, K. AU - Echahidi, F. AU - Fransen, K. AU - Goffard, J. C. AU - Goubau, P. AU - Goudeseune, E. AU - Yombi, J. C. AU - Lacor, P. AU - Liesnard, C. AU - Moutschen, M. AU - Pierard, D. AU - Rens, R. AU - Schrooten, Y. AU - Vaira, D. AU - den HA, V. AU - der GB, V. AU - van Ranst, M. AU - van Wijngaerden, E. AU - Vandercam, B. AU - Vekemans, M. AU - Verhofstede, C. AU - Clumeck, N. AU - Vandamme, A. M. PY - 2008 DA - 2008// TI - Prevalence and epidemiology of HIV type 1 drug resistance among newly diagnosed therapy-naive patients in Belgium from 2003 to 2006 JO - AIDS ResHumRetroviruses VL - 24 UR - https://doi.org/10.1089/aid.2007.0212 DO - 10.1089/aid.2007.0212 ID - Vercauteren2008 ER - TY - JOUR AU - Bracciale, L. AU - Colafigli, M. AU - Zazzi, M. AU - Corsi, P. AU - Meraviglia, P. AU - Micheli, V. AU - Maserati, R. AU - Gianotti, N. AU - Penco, G. AU - Setti, M. AU - Di Giambenedetto, S. AU - Butini, L. AU - Vivarelli, A. AU - Trezzi, M. AU - De Luca, A. PY - 2009 DA - 2009// TI - Prevalence of transmitted HIV-1 drug resistance in HIV-1-infected patients in Italy: evolution over 12 years and predictors JO - J Antimicrob Chemother VL - 64 UR - https://doi.org/10.1093/jac/dkp246 DO - 10.1093/jac/dkp246 ID - Bracciale2009 ER - TY - JOUR AU - Bartmeyer, B. AU - Kuecherer, C. AU - Houareau, C. AU - Werning, J. AU - Keeren, K. AU - Somogyi, S. AU - Kollan, C. AU - Jessen, H. AU - Dupke, S. AU - Hamouda, O. AU - German, H. I. V. S. S. G. PY - 2010 DA - 2010// TI - Prevalence of transmitted drug resistance and impact of transmitted resistance on treatment success in the German HIV-1 seroconverter cohort JO - PLoS ONE VL - 5 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0012718 DO - 10.1371/journal.pone.0012718 ID - Bartmeyer2010 ER - TY - JOUR AU - Karlsson, A. AU - Bjorkman, P. AU - Bratt, G. AU - Ekvall, H. AU - Gisslen, M. AU - Sonnerborg, A. AU - Mild, M. AU - Albert, J. PY - 2012 DA - 2012// TI - Low prevalence of transmitted drug resistance in patients newly diagnosed with HIV-1 infection in Sweden 2003–2010 JO - PLoS ONE VL - 7 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0033484 DO - 10.1371/journal.pone.0033484 ID - Karlsson2012 ER - TY - JOUR PY - 2012 DA - 2012// TI - Time trends in drug resistant HIV-1 infections in the United Kingdom up to 2009: multicentre observational study JO - BMJ VL - 345 UR - https://doi.org/10.1136/bmj.e5253 DO - 10.1136/bmj.e5253 ID - ref26 ER - TY - JOUR AU - Jain, V. AU - Liegler, T. AU - Vittinghoff, E. AU - Hartogensis, W. AU - Bacchetti, P. AU - Poole, L. AU - Loeb, L. AU - Pilcher, C. D. AU - Grant, R. M. AU - Deeks, S. G. AU - Hecht, F. M. PY - 2010 DA - 2010// TI - Transmitted drug resistance in persons with acute/early HIV-1 in San Francisco, 2002–2009 JO - PLoS ONE VL - 5 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0015510 DO - 10.1371/journal.pone.0015510 ID - Jain2010 ER - TY - JOUR AU - Lockman, S. AU - Hughes, M. D. AU - McIntyre, J. AU - Zheng, Y. AU - Chipato, T. AU - Conradie, F. AU - Sawe, F. AU - Asmelash, A. AU - Hosseinipour, M. C. AU - Mohapi, L. AU - Stringer, E. AU - Mngqibisa, R. AU - Siika, A. AU - Atwine, D. AU - Hakim, J. AU - Shaffer, D. AU - Kanyama, C. AU - Wools-Kaloustian, K. AU - Salata, R. A. AU - Hogg, E. AU - Alston-Smith, B. AU - Walawander, A. AU - Purcelle-Smith, E. AU - Eshleman, S. AU - Rooney, J. AU - Rahim, S. AU - Mellors, J. W. AU - Schooley, R. T. AU - Currier, J. S. PY - 2010 DA - 2010// TI - Antiretroviral therapies in women after single-dose nevirapine exposure JO - N Engl J Med VL - 363 UR - https://doi.org/10.1056/NEJMoa0906626 DO - 10.1056/NEJMoa0906626 ID - Lockman2010 ER - TY - JOUR AU - Pingen, M. AU - Nijhuis, M. AU - de Bruijn, J. A. AU - Boucher, C. A. AU - Wensing, A. M. PY - 2011 DA - 2011// TI - Evolutionary pathways of transmitted drug-resistant HIV-1 JO - J Antimicrob Chemother VL - 66 UR - https://doi.org/10.1093/jac/dkr157 DO - 10.1093/jac/dkr157 ID - Pingen2011 ER - TY - JOUR PY - 2007 DA - 2007// TI - Evidence of a decline in transmitted HIV-1 drug resistance in the United Kingdom JO - AIDS VL - 21 UR - https://doi.org/10.1097/QAD.0b013e3280b07761 DO - 10.1097/QAD.0b013e3280b07761 ID - ref30 ER - TY - JOUR AU - Bezemer, D. AU - van Sighem, A. AU - Lukashov, V. V. AU - van der Hoek, L. AU - Back, N. AU - Schuurman, R. AU - Boucher, C. A. AU - Claas, E. C. AU - Boerlijst, M. C. AU - Coutinho, R. A. AU - de Wolf, F. AU - Cohort, A. PY - 2010 DA - 2010// TI - Transmission networks of HIV-1 among men having sex with men in the Netherlands JO - AIDS VL - 24 UR - https://doi.org/10.1097/QAD.0b013e328333ddee DO - 10.1097/QAD.0b013e328333ddee ID - Bezemer2010 ER - TY - JOUR AU - Turner, D. AU - Amit, S. AU - Chalom, S. AU - Penn, O. AU - Pupko, T. AU - Katchman, E. AU - Matus, N. AU - Tellio, H. AU - Katzir, M. AU - Avidor, B. PY - 2012 DA - 2012// TI - Emergence of an HIV-1 cluster harbouring the major protease L90M mutation among treatment-naive patients in Tel Aviv, Israel JO - HIV Med VL - 13 ID - Turner2012 ER - TY - JOUR AU - Carpenter, C. C. AU - Cooper, D. A. AU - Fischl, M. A. AU - Gatell, J. M. AU - Gazzard, B. G. AU - Hammer, S. M. AU - Hirsch, M. S. AU - Jacobsen, D. M. AU - Katzenstein, D. A. AU - Montaner, J. S. AU - Richman, D. D. AU - Saag, M. S. AU - Schechter, M. AU - Schooley, R. T. AU - Thompson, M. A. AU - Vella, S. AU - Yeni, P. G. AU - Volberding, P. A. PY - 2000 DA - 2000// TI - Antiretroviral therapy in adults: updated recommendations of the International AIDS Society-USA panel JO - JAMA VL - 283 UR - https://doi.org/10.1001/jama.283.3.381 DO - 10.1001/jama.283.3.381 ID - Carpenter2000 ER - TY - JOUR AU - Staszewski, S. AU - Morales-Ramirez, J. AU - Tashima, K. T. AU - Rachlis, A. AU - Skiest, D. AU - Stanford, J. AU - Stryker, R. AU - Johnson, P. AU - Labriola, D. F. AU - Farina, D. AU - Manion, D. J. AU - Ruiz, N. M. PY - 1999 DA - 1999// TI - Efavirenz plus zidovudine and lamivudine, efavirenz plus indinavir, and indinavir plus zidovudine and lamivudine in the treatment of HIV-1 infection in adults. Study 006 team JO - N Engl J Med VL - 341 UR - https://doi.org/10.1056/NEJM199912163412501 DO - 10.1056/NEJM199912163412501 ID - Staszewski1999 ER - TY - JOUR AU - Riddler, S. A. AU - Haubrich, R. AU - DiRienzo, A. G. AU - Peeples, L. AU - Powderly, W. G. AU - Klingman, K. L. AU - Garren, K. W. AU - George, T. AU - Rooney, J. F. AU - Brizz, B. AU - Lalloo, U. G. AU - Murphy, R. L. AU - Swindells, S. AU - Havlir, D. AU - Mellors, J. W. PY - 2008 DA - 2008// TI - Class-sparing regimens for initial treatment of HIV-1 infection JO - N Engl J Med VL - 358 UR - https://doi.org/10.1056/NEJMoa074609 DO - 10.1056/NEJMoa074609 ID - Riddler2008 ER - TY - JOUR AU - Parienti, J. J. AU - Bangsberg, D. R. AU - Verdon, R. AU - Gardner, E. M. PY - 2009 DA - 2009// TI - Better adherence with once-daily antiretroviral regimens: a meta-analysis JO - Clin Infect Dis VL - 48 UR - https://doi.org/10.1086/596482 DO - 10.1086/596482 ID - Parienti2009 ER - TY - JOUR AU - Smit, M. AU - Smit, C. AU - Geerlings, S. AU - Gras, L. AU - Brinkman, K. AU - Hallett, T. B. AU - de Wolf, F. PY - 2013 DA - 2013// TI - Changes in first-line cART regimens and short-term clinical outcome between 1996 and 2010 in The Netherlands JO - PLoS ONE VL - 8 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0076071 DO - 10.1371/journal.pone.0076071 ID - Smit2013 ER - TY - JOUR AU - van de Vijver, D. A. AU - Wensing, A. M. AU - Angarano, G. AU - Asjo, B. AU - Balotta, C. AU - Boeri, E. AU - Camacho, R. AU - Chaix, M. L. AU - Costagliola, D. AU - De Luca, A. AU - Derdelinckx, I. AU - Grossman, Z. AU - Hamouda, O. AU - Hatzakis, A. AU - Hemmer, R. AU - Hoepelman, A. AU - Horban, A. AU - Korn, K. AU - Kucherer, C. AU - Leitner, T. AU - Loveday, C. AU - MacRae, E. AU - Maljkovic, I. AU - de Mendoza, C. AU - Meyer, L. AU - Nielsen, C. AU - Op de Coul, E. L. AU - Ormaasen, V. AU - Paraskevis, D. AU - Perrin, L. PY - 2006 DA - 2006// TI - The calculated genetic barrier for antiretroviral drug resistance substitutions is largely similar for different HIV-1 subtypes JO - J Acquir Immune Defic Syndr VL - 41 UR - https://doi.org/10.1097/01.qai.0000209899.05126.e4 DO - 10.1097/01.qai.0000209899.05126.e4 ID - van de Vijver2006 ER - TY - JOUR AU - Gallant, J. E. AU - DeJesus, E. AU - Arribas, J. R. AU - Pozniak, A. L. AU - Gazzard, B. AU - Campo, R. E. AU - Lu, B. AU - McColl, D. AU - Chuck, S. AU - Enejosa, J. AU - Toole, J. J. AU - Cheng, A. K. AU - Study, G. PY - 2006 DA - 2006// TI - Tenofovir DF, emtricitabine, and efavirenz vs. zidovudine, lamivudine, and efavirenz for HIV JO - N Engl J Med VL - 354 UR - https://doi.org/10.1056/NEJMoa051871 DO - 10.1056/NEJMoa051871 ID - Gallant2006 ER - TY - JOUR AU - Jain, V. AU - Sucupira, M. C. AU - Bacchetti, P. AU - Hartogensis, W. AU - Diaz, R. S. AU - Kallas, E. G. AU - Janini, L. M. AU - Liegler, T. AU - Pilcher, C. D. AU - Grant, R. M. AU - Cortes, R. AU - Deeks, S. G. AU - Hecht, F. M. PY - 2011 DA - 2011// TI - Differential persistence of transmitted HIV-1 drug resistance mutation classes JO - J Infect Dis VL - 203 UR - https://doi.org/10.1093/infdis/jiq167 DO - 10.1093/infdis/jiq167 ID - Jain2011 ER - TY - JOUR AU - Kikaire, B. AU - Khoo, S. AU - Walker, A. S. AU - Ssali, F. AU - Munderi, P. AU - Namale, L. AU - Reid, A. AU - Gibb, D. M. AU - Mugyenyi, P. AU - Grosskurth, H. AU - Team, D. T. PY - 2007 DA - 2007// TI - Nevirapine clearance from plasma in African adults stopping therapy: a pharmacokinetic substudy JO - AIDS VL - 21 UR - https://doi.org/10.1097/QAD.0b013e3280121801 DO - 10.1097/QAD.0b013e3280121801 ID - Kikaire2007 ER - TY - JOUR AU - Bartlett, J. A. AU - Buda, J. J. AU - von Scheele, B. AU - Mauskopf, J. A. AU - Davis, E. A. AU - Elston, R. AU - King, M. S. AU - Lanier, E. R. PY - 2006 DA - 2006// TI - Minimizing resistance consequences after virologic failure on initial combination therapy: a systematic overview JO - J Acquir Immune Defic Syndr VL - 41 ID - Bartlett2006 ER - TY - JOUR AU - Gupta, R. AU - Hill, A. AU - Sawyer, A. W. AU - Pillay, D. PY - 2008 DA - 2008// TI - Emergence of drug resistance in HIV type 1-infected patients after receipt of first-line highly active antiretroviral therapy: a systematic review of clinical trials JO - Clin Infect Dis VL - 47 UR - https://doi.org/10.1086/590943 DO - 10.1086/590943 ID - Gupta2008 ER - TY - JOUR AU - Lima, V. D. AU - Gill, V. S. AU - Yip, B. AU - Hogg, R. S. AU - Montaner, J. S. AU - Harrigan, P. R. PY - 2008 DA - 2008// TI - Increased resilience to the development of drug resistance with modern boosted protease inhibitor-based highly active antiretroviral therapy JO - J Infect Dis VL - 198 UR - https://doi.org/10.1086/588675 DO - 10.1086/588675 ID - Lima2008 ER - TY - JOUR AU - Elzi, L. AU - Erb, S. AU - Furrer, H. AU - Ledergerber, B. AU - Cavassini, M. AU - Hirschel, B. AU - Vernazza, P. AU - Bernasconi, E. AU - Weber, R. AU - Battegay, M. PY - 2012 DA - 2012// TI - Choice of initial combination antiretroviral therapy in individuals with HIV infection: determinants and outcomes JO - Arch Intern Med VL - 172 UR - https://doi.org/10.1001/archinternmed.2012.3216 DO - 10.1001/archinternmed.2012.3216 ID - Elzi2012 ER - TY - JOUR AU - Vo, T. T. AU - Ledergerber, B. AU - Keiser, O. AU - Hirschel, B. AU - Furrer, H. AU - Battegay, M. AU - Cavassini, M. AU - Bernasconi, E. AU - Vernazza, P. AU - Weber, R. PY - 2008 DA - 2008// TI - Durability and outcome of initial antiretroviral treatments received during 2000–2005 by patients in the Swiss HIV Cohort Study JO - J Infect Dis VL - 197 UR - https://doi.org/10.1086/588141 DO - 10.1086/588141 ID - Vo2008 ER - TY - JOUR AU - Schuurman, R. AU - Brambilla, D. AU - de Groot, T. AU - Huang, D. AU - Land, S. AU - Bremer, J. AU - Benders, I. AU - Boucher, C. A. AU - Group, E. W. PY - 2002 DA - 2002// TI - Underestimation of HIV type 1 drug resistance mutations: results from the ENVA-2 genotyping proficiency program JO - AIDS Res Hum Retroviruses VL - 18 UR - https://doi.org/10.1089/088922202753472801 DO - 10.1089/088922202753472801 ID - Schuurman2002 ER - TY - JOUR AU - Li, J. Z. AU - Paredes, R. AU - Ribaudo, H. J. AU - Svarovskaia, E. S. AU - Metzner, K. J. AU - Kozal, M. J. AU - Hullsiek, K. H. AU - Balduin, M. AU - Jakobsen, M. R. AU - Geretti, A. M. AU - Thiebaut, R. AU - Ostergaard, L. AU - Masquelier, B. AU - Johnson, J. A. AU - Miller, M. D. AU - Kuritzkes, D. R. PY - 2011 DA - 2011// TI - Low-frequency HIV-1 drug resistance mutations and risk of NNRTI-based antiretroviral treatment failure: a systematic review and pooled analysis JO - JAMA VL - 305 UR - https://doi.org/10.1001/jama.2011.375 DO - 10.1001/jama.2011.375 ID - Li2011 ER - TY - JOUR AU - Wensing, A. M. AU - van de Vijver, D. A. AU - Angarano, G. AU - Asjo, B. AU - Balotta, C. AU - Boeri, E. AU - Camacho, R. AU - Chaix, M. L. AU - Costagliola, D. AU - De Luca, A. AU - Derdelinckx, I. AU - Grossman, Z. AU - Hamouda, O. AU - Hatzakis, A. AU - Hemmer, R. AU - Hoepelman, A. AU - Horban, A. AU - Korn, K. AU - Kucherer, C. AU - Leitner, T. AU - Loveday, C. AU - MacRae, E. AU - Maljkovic, I. AU - de Mendoza, C. AU - Meyer, L. AU - Nielsen, C. AU - Op de Coul, E. L. AU - Ormaasen, V. AU - Paraskevis, D. AU - Perrin, L. PY - 2005 DA - 2005// TI - Prevalence of drug-resistant HIV-1 variants in untreated individuals in Europe: implications for clinical management JO - J Infect Dis VL - 192 UR - https://doi.org/10.1086/432916 DO - 10.1086/432916 ID - Wensing2005 ER - TY - STD TI - The pre-publication history for this paper can be accessed here:http://www.biomedcentral.com/1471-2334/14/407/prepub UR - http://www.biomedcentral.com/1471-2334/14/407/prepub ID - ref50 ER -