SIT | Spoligotype description | Lineage | Total no. of strains (SITVIT2) | Geographical distribution a | |||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
GLP | MTQ | GUF | Caribbean | South and Central America | Other countries | ||||
2 | â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â– â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â– â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– | H2 | 393 | 18 | 5 | 24 | 21(CUB), 37(HTI) | 35(ARG), 21(BRA), 2(COL), 3(HND), 2(PAN), 1(PRY) | 224 |
3 | â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â–¡â– â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– | H3 | 105 | 4 | 0 | 0 | 3(CUB), 1(HTI) | 2(ARG), 7(BRA), 3(COL), 1(SUR), 1(VEN) | 83 |
5 | â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â–¡â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– | T1 | 30 | 3 | 2 | 4 | 7(HTI) | 0 | 14 |
7 | â–¡â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– | T1 | 77 | 4 | 0 | 4 | 1(BHS), 2(HTI) | 1(PER), 2(PRY) | 63 |
14 | â– â–¡â– â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â–¡â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– | X3 | 42 | 27 | 6 | 2 | 0 | 1(VEN) | 6 |
17 | â– â– â–¡â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– | LAM2 | 656 | 22 | 4 | 12 | 1(CUB), 9(DOM), 22(HTI), 1(TTO) | 2(ARG), 184(BRA), 13(COL), 1(PAN), 1(PER), 1(PRY), 179(VEN) | 204 |
20 | â– â– â–¡â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– | LAM1 | 811 | 8 | 1 | 20 | 5(CUB), 26(HTI), 3(JAM) | 2(ARG), 147(BRA), 14(COL), 5(PER), 1(PRY), 42(VEN) | 537 |
42 | â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– | LAM9 | 3282 | 24 | 8 | 31 | Ubiquitous | Ubiquitous | Ubiquitous |
44 | â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– | T5 | 210 | 4 | 0 | 6 | 0 | 3(ARG), 3(BRA), 1(SUR), 4(VEN) | 189 |
45 | â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â– â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â– â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– | H1 | 106 | 8 | 14 | 0 | 1(HTI), 3(LCA) | 9(BRA), 8(COL), 1(PAN) | 62 |
50 | â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â– â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– | H3 | 3330 | 23 | 16 | 88 | Ubiquitous | Ubiquitous | Ubiquitous |
51 | â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡ | T1 | 279 | 12 | 0 | 13 | 17(HTI), 3(JAM) | 4(ARG), 40(BRA), 1(PER), 10(VEN) | 179 |
53 | â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– | T1 | 6104 | 39 | 25 | 84 | Ubiquitous | Ubiquitous | Ubiquitous |
70 | â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â–¡â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â–¡â– â– â– â– | X3 | 116 | 3 | 0 | 6 | 8(BHS), 8(HTI), 1(TTO) | 0 | 90 |
93 | â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– | LAM5 | 359 | 19 | 0 | 9 | 7(DOM), 15(HTI), 1(TTO) | 2(ARG), 43(BRA), 2(COL), 17(PER), 6(PRY), 94(VEN) | 144 |
103 | â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â– â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â–¡â– â– â– | H1 | 3 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
122 | â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– | T1 | 27 | 2 | 0 | 0 | 0 | 1(COL), 1(PAN) | 24 |
1087 | â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– â–¡â–¡â–¡â–¡â– â– â– â– â– â– â– | T1 | 4 | 2 | 0 | 0 | 1(HTI) | 0 | 1 |