TY - JOUR AU - Curran, J. W. AU - Jaffe, H. W. AU - Hardy, A. M. AU - Morgan, W. M. AU - Selik, R. M. AU - Dondero, T. J. PY - 1988 DA - 1988// TI - Epidemiology of HIV infection and AIDS in the United States JO - Science VL - 239 UR - https://doi.org/10.1126/science.3340847 DO - 10.1126/science.3340847 ID - Curran1988 ER - TY - JOUR AU - Karon, J. M. AU - Fleming, P. L. AU - Steketee, R. W. AU - De Cock, K. M. PY - 2001 DA - 2001// TI - HIV in the United States at the turn of the century: an epidemic in transition JO - Am J Public Health VL - 91 UR - https://doi.org/10.2105/AJPH.91.7.1060 DO - 10.2105/AJPH.91.7.1060 ID - Karon2001 ER - TY - JOUR AU - Hall, H. I. AU - Song, R. AU - Rhodes, P. AU - Prejean, J. AU - An, Q. AU - Lee, L. M. AU - Karon, J. AU - Brookmeyer, R. AU - Kaplan, E. H. AU - McKenna, M. T. AU - Janssen, R. S. PY - 2008 DA - 2008// TI - Estimation of HIV incidence in the United States JO - JAMA VL - 300 UR - https://doi.org/10.1001/jama.300.5.520 DO - 10.1001/jama.300.5.520 ID - Hall2008 ER - TY - JOUR AU - Orroth, K. K. AU - Freeman, E. AU - Bakker, R. AU - Buvé, A. AU - Glynn, J. R. AU - Boily, M. C. AU - White, R. G. AU - Habbema, J. D. AU - Hayes, R. J. PY - 2007 DA - 2007// TI - Understanding differences between contrasting HIV epidemics in East and West Africa: results from a simulation model of the Four Cities Study JO - Sex Transm Infect VL - 83 UR - https://doi.org/10.1136/sti.2006.023531 DO - 10.1136/sti.2006.023531 ID - Orroth2007 ER - TY - JOUR AU - Gisselquist, D. AU - Rothenberg, R. AU - Potterat, J. AU - Drucker, E. PY - 2002 DA - 2002// TI - HIV infections in sub-Saharan Africa not explained by sexual or vertical transmission JO - Int J STD AIDS VL - 13 UR - https://doi.org/10.1258/095646202760326390 DO - 10.1258/095646202760326390 ID - Gisselquist2002 ER - TY - JOUR AU - Vernazza, P. L. AU - Eron, J. AU - Fiscus, S. A. AU - Cohen, M. S. PY - 1999 DA - 1999// TI - Sexual transmission of HIV: infectiousness and prevention JO - AIDS VL - 13 UR - https://doi.org/10.1097/00002030-199902040-00003 DO - 10.1097/00002030-199902040-00003 ID - Vernazza1999 ER - TY - JOUR AU - Waver, M. J. AU - Gray, R. AU - Sewankambo, N. AU - Serwadda, D. AU - Li, X. AU - Laeyendecker, O. AU - Kiwanuka, N. AU - Kigozi, G. AU - Kiddugavu, M. AU - Lutalo, T. AU - Nalugoda, F. AU - Wabwire-Mangen, F. AU - Meehan, M. P. AU - Quinn, T. C. PY - 2005 DA - 2005// TI - Rates of HIV-1 transmission per coital act, by stage of HIV-1 infection, in Rakai, Uganda JO - J Infect Dis VL - 191 UR - https://doi.org/10.1086/429411 DO - 10.1086/429411 ID - Waver2005 ER - TY - JOUR AU - Brewer, D. D. AU - Rothenberg, R. B. AU - Potterat, J. J. AU - Muth, S. Q. PY - 2007 DA - 2007// TI - Data-free modeling of HIV transmission in sub-Saharan Africa JO - Sex Transm Dis VL - 34 UR - https://doi.org/10.1097/01.olq.0000249725.60291.ce DO - 10.1097/01.olq.0000249725.60291.ce ID - Brewer2007 ER - TY - JOUR AU - Deuchert, S. B. PY - 2007 DA - 2007// TI - Plausible and implausible parameters for mathematical modeling of nominal heterosexual HIV transmission JO - Ann Epidemiol VL - 17 UR - https://doi.org/10.1016/j.annepidem.2006.10.011 DO - 10.1016/j.annepidem.2006.10.011 ID - Deuchert2007 ER - TY - JOUR AU - Doherty, I. A. AU - Padian, N. S. AU - Marlow, C. AU - Aral, S. O. PY - 2005 DA - 2005// TI - Determinants and consequences of sexual networks as they affect the spread of sexually transmitted infections JO - J Infect Dis VL - 191 UR - https://doi.org/10.1086/425277 DO - 10.1086/425277 ID - Doherty2005 ER - TY - JOUR AU - May, R. AU - Lloyd, L. PY - 2001 DA - 2001// TI - Infection dynamics on scale-free networks JO - Phys Rev VL - 64 ID - May2001 ER - TY - JOUR AU - Hamilton, D. AU - Handcock, M. AU - Morris, M. PY - 2008 DA - 2008// TI - Degree distributions in sexual networks: a framework for evaluating evidence JO - Sex Transm Dis VL - 35 UR - https://doi.org/10.1097/OLQ.0b013e3181453a84 DO - 10.1097/OLQ.0b013e3181453a84 ID - Hamilton2008 ER - TY - JOUR AU - Handcock, M. AU - Holland, J. PY - 2004 DA - 2004// TI - Likelihood-based inference for stochastic models of sexual network formation JO - Theor Popul Biol VL - 65 UR - https://doi.org/10.1016/j.tpb.2003.09.006 DO - 10.1016/j.tpb.2003.09.006 ID - Handcock2004 ER - TY - JOUR AU - Proulx, S. R. AU - Promislow, D. E. L. AU - Phillips, P. C. PY - 2005 DA - 2005// TI - Network thinking in ecology and evolution JO - Trends Ecol Evol VL - 20 UR - https://doi.org/10.1016/j.tree.2005.04.004 DO - 10.1016/j.tree.2005.04.004 ID - Proulx2005 ER - TY - JOUR AU - Witten, G. AU - Poulter, G. PY - 2007 DA - 2007// TI - Simulations of infectious diseases on networks JO - Comput Biol Med VL - 37 UR - https://doi.org/10.1016/j.compbiomed.2005.12.002 DO - 10.1016/j.compbiomed.2005.12.002 ID - Witten2007 ER - TY - JOUR AU - Lilijeros, F. AU - Edling, C. AU - Amaral, L. A. AU - Stanley, H. E. AU - Aberg, Y. PY - 2001 DA - 2001// TI - The web of human sexual contacts JO - Nature VL - 421 UR - https://doi.org/10.1038/35082140 DO - 10.1038/35082140 ID - Lilijeros2001 ER - TY - JOUR AU - Ravasz, E. AU - Babarasi, A. PY - 2003 DA - 2003// TI - Hierarchical organization in complex networks JO - Phys Rev VL - 67 ID - Ravasz2003 ER - TY - BOOK AU - Anderson, R. M. AU - May, R. M. PY - 1991 DA - 1991// TI - Infectious diseases of humans: dynamics and control PB - Oxford University Press CY - Oxford ID - Anderson1991 ER - TY - JOUR AU - Gisselquist, D. AU - Potterat, J. PY - 2003 DA - 2003// TI - Heterosexual transmission of HIV in Africa: an empiric estimate JO - Int J STD AIDS VL - 14 UR - https://doi.org/10.1258/095646203762869160 DO - 10.1258/095646203762869160 ID - Gisselquist2003 ER - TY - JOUR AU - Boily, M. AU - Baggaley, R. AU - Wang, L. AU - Masse, B. AU - White, R. G. AU - Hayes, R. J. AU - Alary, M. PY - 2009 DA - 2009// TI - Heterosexual risk of HIV-1 infection per sexual act: systematic review and meta-analysis of observational studies JO - Lancet Infec Dis VL - 9 UR - https://doi.org/10.1016/S1473-3099(09)70021-0 DO - 10.1016/S1473-3099(09)70021-0 ID - Boily2009 ER - TY - JOUR AU - Padian, N. AU - Shiboski, C. AU - Jewell, N. PY - 1990 DA - 1990// TI - The effect of number of exposures on the risk of heterosexual HIV transmission JO - J Infect Dis VL - 161 UR - https://doi.org/10.1093/infdis/161.5.883 DO - 10.1093/infdis/161.5.883 ID - Padian1990 ER - TY - JOUR AU - Powers, K. AU - Poole, C. AU - Pettifor, A. AU - Cohen, M. PY - 2008 DA - 2008// TI - Rethinking the heterosexual infectivity of HIV-1: a systematic review and meta-analysis JO - Lancet VL - 8 UR - https://doi.org/10.1016/S1473-3099(08)70156-7 DO - 10.1016/S1473-3099(08)70156-7 ID - Powers2008 ER - TY - JOUR AU - Kaplan, E. PY - 1990 DA - 1990// TI - Modeling HIV infectivity: must sex acts be counted? JO - JAIDS VL - 3 ID - Kaplan1990 ER - TY - JOUR AU - Attia, S. AU - Egger, M. AU - Müller, M. AU - Zwahlen, M. AU - Low, N. PY - 2009 DA - 2009// TI - Sexual transmission of HIV according to viral load and antiretroviral therapy: systematic review and meta-analysis JO - AIDS VL - 23 UR - https://doi.org/10.1097/QAD.0b013e32832b7dca DO - 10.1097/QAD.0b013e32832b7dca ID - Attia2009 ER - TY - JOUR AU - Cohen, M. AU - Pilcher, C. PY - 2007 DA - 2007// TI - Amplified HIV transmission and new approaches to HIV prevention JO - J Infect Dis VL - 191 UR - https://doi.org/10.1086/429414 DO - 10.1086/429414 ID - Cohen2007 ER - TY - JOUR AU - Pilcher, C. AU - Joaki, G. AU - Hoffman, I. AU - Martinson, F. E. AU - Mapanje, C. AU - Stewart, P. W. AU - Powers, K. A. AU - Galvin, S. AU - Chilongozi, D. AU - Gama, S. AU - Price, M. A. AU - Fiscus, S. A. AU - Cohen, M. S. PY - 2007 DA - 2007// TI - Amplified transmission of HIV-1: comparison of HIV-1 concentrations in semen and blood during acute and chronic infection JO - AIDS VL - 21 UR - https://doi.org/10.1097/QAD.0b013e3281532c82 DO - 10.1097/QAD.0b013e3281532c82 ID - Pilcher2007 ER - TY - JOUR AU - Quinn, T. AU - Wawer, M. AU - Sewankambo, N. AU - Serwadda, D. AU - Li, C. AU - Wabwire-Mangen, F. AU - Meehan, M. O. AU - Lutalo, T. AU - Gray, R. H. PY - 2000 DA - 2000// TI - Viral load and immune heterosexual transmission of human immunodeficiency virus type 1 JO - N Engl J Med VL - 342 UR - https://doi.org/10.1056/NEJM200003303421303 DO - 10.1056/NEJM200003303421303 ID - Quinn2000 ER - TY - JOUR AU - Wilson, D. AU - Law, M. AU - Grulich, A. AU - Cooper, D. A. AU - Kaldor, J. M. PY - 2008 DA - 2008// TI - Relation between HIV viral load and infectiousness: a model based analysis JO - Lancet VL - 372 UR - https://doi.org/10.1016/S0140-6736(08)61115-0 DO - 10.1016/S0140-6736(08)61115-0 ID - Wilson2008 ER - TY - JOUR AU - Bentwich, Z. AU - Kalinkovich, A. AU - Weisman, Z. PY - 1995 DA - 1995// TI - Immune activation is a dominant factor in the pathogenesis of African AIDS JO - Imm Today VL - 16 UR - https://doi.org/10.1016/0167-5699(95)80119-7 DO - 10.1016/0167-5699(95)80119-7 ID - Bentwich1995 ER - TY - JOUR AU - Glynn, J. AU - Crampin, A. AU - Ngwira, B. AU - Ndhlovu, R. AU - Mwanyongo, O. AU - Fine, P. E. PY - 2008 DA - 2008// TI - Herpes simplex type 2 (HSV-2) trends in relation to the HIV epidemic in northern Malawi JO - Sex Transm Infect VL - 84 UR - https://doi.org/10.1136/sti.2008.030056 DO - 10.1136/sti.2008.030056 ID - Glynn2008 ER - TY - JOUR AU - Weiss, H. A. AU - Buvé, A. AU - Robinson, N. J. AU - Van Dyck, E. AU - Kahindo, M. AU - Anagonou, S. AU - Musonda, R. AU - Zekeng, L. AU - Morison, L. AU - Caraël, M. AU - Laga, M. AU - Hayes, R. J. PY - 2001 DA - 2001// TI - The epidemiology of HSV-2 infection and its association with HIV infection in four urban African populations JO - AIDS VL - 15 UR - https://doi.org/10.1097/00002030-200108004-00011 DO - 10.1097/00002030-200108004-00011 ID - Weiss2001 ER - TY - JOUR AU - O'Farrell, N. PY - 1999 DA - 1999// TI - Increasing prevalence of genital herpex in developing countries: implications for heterosexual HIV transmisison and STI control programmes JO - Sex Transm Infect VL - 75 UR - https://doi.org/10.1136/sti.75.6.377 DO - 10.1136/sti.75.6.377 ID - O'Farrell1999 ER - TY - CHAP PY - 2001 DA - 2001// TI - Herpes simplex virus type 2 programmatic and research priorities in developing countries; 2001 BT - Annual Report PB - World Health Organization CY - Geneva ID - ref33 ER - TY - JOUR AU - John-Arne, R. AU - Cameron, W. AU - Geoffrey, G. PY - 2001 DA - 2001// TI - A Systematic review of the epidemiologic interactions between classic sexually transmitted diseases and HIV: how much really is known? JO - Sex Transm Dis VL - 28 UR - https://doi.org/10.1097/00007435-200110000-00005 DO - 10.1097/00007435-200110000-00005 ID - John-Arne2001 ER - TY - JOUR AU - Brunham, R. AU - Plummer, F. PY - 1990 DA - 1990// TI - A general model of sexually transmitted disease epidemiology and its implications for control JO - Med Clin N Am VL - 74 UR - https://doi.org/10.1016/S0025-7125(16)30484-9 DO - 10.1016/S0025-7125(16)30484-9 ID - Brunham1990 ER - TY - JOUR AU - Corey, L. AU - Wald, A. AU - Celum, C. AU - Quinn, T. PY - 2004 DA - 2004// TI - The effects of herpes simplex virus-2 on HIV-1 acquisition and transmission: a review of two overlapping epidemics JO - JAIDS VL - 35 ID - Corey2004 ER - TY - JOUR AU - Celum, C. AU - Levine, R. AU - Weaver, M. AU - Wald, A. PY - 2004 DA - 2004// TI - Genital herpes and human immunodeficiency virus: double trouble JO - B World Health Organ VL - 82 ID - Celum2004 ER - TY - JOUR AU - Schacker, T. AU - Zeh, J. AU - Hu, H. AU - Shaughnessy, M. AU - Corey, L. PY - 2002 DA - 2002// TI - Changes in plasma human immunodeficiency virus type 1 RNA associated with herpes simplex virus reaction and suppresion JO - J Infect Dis VL - 186 UR - https://doi.org/10.1086/345771 DO - 10.1086/345771 ID - Schacker2002 ER - TY - JOUR AU - Mole, L. AU - Ripich, S. AU - Margolis, D. PY - 1997 DA - 1997// TI - The impact of active herpes simplex virus infection on human immunodeficiency virus load JO - J Infect Dis VL - 176 UR - https://doi.org/10.1086/517297 DO - 10.1086/517297 ID - Mole1997 ER - TY - JOUR AU - Schacker, T. AU - Zeh, J. AU - Hu, H. AU - Shaughnessy, M. AU - Corey, L. PY - 2002 DA - 2002// TI - Changes in plasma human immunodeficiency virus type 1 RNA associated with herpes simplex virus reaction and suppresion JO - J Infect Dis VL - 186 UR - https://doi.org/10.1086/345771 DO - 10.1086/345771 ID - Schacker2002 ER - TY - JOUR AU - Gray, R. H. AU - Wawer, M. AU - Brookmeyer, R. AU - Sewankambo, N. K. AU - Serwadda, D. AU - Wabwire-Mangen, F. AU - Lutalo, T. AU - Li, X. AU - vanCott, T. AU - Quinn, T. C. PY - 2001 DA - 2001// TI - Probability of HIV-1 transmission per coital act in monogamous, heterosexual, HIV-1-discordant couples in Rakai, Uganda JO - Lancet VL - 357 UR - https://doi.org/10.1016/S0140-6736(00)04331-2 DO - 10.1016/S0140-6736(00)04331-2 ID - Gray2001 ER - TY - JOUR AU - Buve, A. AU - Carael, M. AU - Hayes, R. AU - Auvert, B. AU - Ferry, B. AU - Robinson, N. J. AU - Anagonou, S. AU - Kanhonou, L. AU - Laourou, M. AU - Abega, S. AU - Akam, E. AU - Zekeng, L. AU - Chege, J. AU - Kahindo, M. AU - Rutenberg, N. AU - Kaona, F. AU - Musonda, R. AU - Sukwa, T. AU - Morison, L. AU - Weiss, H. A. AU - Laga, M. PY - 2001 DA - 2001// TI - The multicentre study of factors determining the differential spread of HIV in four African cities: summary and conclusions JO - AIDS VL - 15 UR - https://doi.org/10.1097/00002030-200108004-00014 DO - 10.1097/00002030-200108004-00014 ID - Buve2001 ER - TY - JOUR AU - Abu-Raddad, L. J. AU - Margaret, A. AU - Celum, C. AU - Wald, A. AU - Longini, I. M. AU - Self, S. G. AU - Corey, L. PY - 2008 DA - 2008// TI - Genital herpes has played a more important role than any other sexually transmitted infection in driving HIV prevalence in Africa JO - PLoS ONE VL - 3 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0002230 DO - 10.1371/journal.pone.0002230 ID - Abu-Raddad2008 ER - TY - JOUR AU - Pisel, T. AU - Hoffman, I. AU - Jere, C. AU - Ballard, S. B. AU - Molyneux, M. E. AU - Butera, S. T. AU - Lawn, S. D. PY - 2005 DA - 2005// TI - Immune activation and induction of HIV-1 replication within CD14 macrophages during acute Plasmodium falciparum malaria coinfection JO - AIDS VL - 16 UR - https://doi.org/10.1097/00002030-200207260-00007 DO - 10.1097/00002030-200207260-00007 ID - Pisel2005 ER - TY - JOUR AU - Kublin, J. G. AU - Patnaik, P. AU - Jere, C. AU - Miller, W. C. AU - Hoffman, I. F. AU - Chimbiya, N. AU - Pendame, R. AU - Taylor, T. E. AU - Molyneux, M. E. PY - 2005 DA - 2005// TI - Effect of Plasmodium falciparum malaria on concentration of HIV-1-RNA in the blood of adults in rural Malawi: a prospective cohort study JO - Lancet VL - 365 ID - Kublin2005 ER - TY - JOUR AU - Reina, L. AU - Potter, S. PY - 2006 DA - 2006// TI - Co-infection of malaria with HIV: an immunological perspective JO - Immunology VL - 28 ID - Reina2006 ER - TY - JOUR AU - Korenromp, E. AU - Williams, B. AU - de Vlas, S. AU - Gouws, E. AU - Gilks, C. F. AU - Ghys, P. D. AU - Nahlen, B. L. PY - 2005 DA - 2005// TI - Malaria attributable to the HIV-1 epidemic, sub-Saharan Africa JO - Emerg Infect Dis VL - 11 UR - https://doi.org/10.3201/eid1109.050337 DO - 10.3201/eid1109.050337 ID - Korenromp2005 ER - TY - STD TI - CDC: Centers for Disease Control and Prevention (CDC) Malaria. (22 September 2010,date last accesed), [http://www.cdc.gov/malaria/index.html] UR - http://www.cdc.gov/malaria/index.html ID - ref48 ER - TY - JOUR AU - Xiao, L. AU - Owen, S. AU - Rudolph, D. AU - Lal, R. AU - Lal, A. PY - 1998 DA - 1998// TI - Plasmodium falciparum antigen induced human inmmunodeficiency virus type I replication is mediated through induction of tumor necrosis factor JO - J Infect Dis VL - 117 UR - https://doi.org/10.1086/514212 DO - 10.1086/514212 ID - Xiao1998 ER - TY - JOUR AU - Bell, D. C. AU - Montoya, I. D. AU - Atkinson, J. S. AU - Yang, S. PY - 2002 DA - 2002// TI - Social networks and forecasting the spread of HIV infection JO - JAIDS VL - 31 ID - Bell2002 ER - TY - CHAP PY - 2003 DA - 2003// BT - Social network project, The Malawi Diffusion and Ideational Change Project (MDICP) PB - University of Pennsilvania, PopulationStudies Center CY - Philadelphia, PA ID - ref51 ER - TY - JOUR AU - Helleringer, S. AU - Kohler, H. P. AU - Chimbiri, A. AU - Chatonda, P. AU - Mkandawire, J. PY - 2007 DA - 2007// TI - The Likoma network study: context, data collection and initial results JO - Demogr Res VL - 21 UR - https://doi.org/10.4054/DemRes.2009.21.15 DO - 10.4054/DemRes.2009.21.15 ID - Helleringer2007 ER - TY - JOUR AU - Helleringer, S. AU - Kohler, H. PY - 2007 DA - 2007// TI - Sexual network structure and the spread of HIV in Africa: evidence from Likoma Island, Malawi JO - AIDS VL - 21 UR - https://doi.org/10.1097/QAD.0b013e328285df98 DO - 10.1097/QAD.0b013e328285df98 ID - Helleringer2007 ER - TY - CHAP PY - 1994 DA - 1994// TI - MATLAB® - The Language of Technical Computing BT - Book MATLAB® - The Language of Technical Computing PB - The MathWorks, Inc. CY - City ID - ref54 ER - TY - CHAP PY - 2005 DA - 2005// BT - Malawi Demographic and Health Survey 2004 PB - NSO and ORC Macro CY - Calverton, MD ID - ref55 ER - TY - JOUR AU - Lule, G. AU - Behets, F. M. AU - Hoffman, I. F. AU - Dallabetta, G. AU - Hamilton, H. A. AU - Moeng, S. AU - Liomba, G. AU - Cohen, M. S. PY - 1994 DA - 1994// TI - STD/HIV control in Malawi and the search for affordable and effective urethritis therapy: a first field evaluation JO - Sex Transm Infect VL - 70 UR - https://doi.org/10.1136/sti.70.6.384 DO - 10.1136/sti.70.6.384 ID - Lule1994 ER - TY - CHAP AU - Mensch, B. AU - Paul, H. e. w. e. t. t. AU - Gregory, R. AU - Helleringer, S. PY - 2008 DA - 2008// TI - Sexual behavior and STI/HIV status among adolescents in rural Malawi: an evaluation of the effect of interview mode on reporting BT - Working paper PB - Population Council CY - New York ID - Mensch2008 ER - TY - JOUR AU - Golden, M. P. AU - Kim, S. AU - Hammer, S. M. AU - Ladd, E. A. AU - Schaffer, P. A. AU - DeLuca, N. AU - Albrecht, M. A. PY - 1992 DA - 1992// TI - Activation of human-immunodeficiency-virus by herpes-simplex virus JO - J Infect Dis VL - 166 UR - https://doi.org/10.1093/infdis/166.3.494 DO - 10.1093/infdis/166.3.494 ID - Golden1992 ER - TY - JOUR AU - Mole, L. AU - Ripich, S. AU - Margolis, D. AU - Holodniy, M. PY - 1997 DA - 1997// TI - The impact of active herpes simplex virus infection on human immunodeficiency virus load JO - J Infect Dis VL - 176 UR - https://doi.org/10.1086/517297 DO - 10.1086/517297 ID - Mole1997 ER - TY - JOUR AU - Crampin, A. C. AU - Floyd, S. AU - Glynn, J. R. AU - Sibande, F. AU - Mulawa, D. AU - Nyondo, A. AU - Broadbent, P. AU - Bliss, L. AU - Ngwira, B. AU - Fine, P. E. PY - 2002 DA - 2002// TI - Long-term follow-up of HIV-positive and HIV-negative individuals in rural Malawi JO - AIDS VL - 16 UR - https://doi.org/10.1097/00002030-200207260-00012 DO - 10.1097/00002030-200207260-00012 ID - Crampin2002 ER - TY - JOUR AU - McClelland, R. S. AU - Wang, C. C. AU - Overbaugh, J. AU - Richardson, B. A. AU - Corey, L. AU - Ashley, R. L. AU - Mandaliya, K. AU - Ndinya-Achola, J. AU - Bwayo, J. J. AU - Kreiss, J. K. PY - 2002 DA - 2002// TI - Association between cervical shedding of herpes simplex virus and HIV-1 JO - AIDS VL - 16 UR - https://doi.org/10.1097/00002030-200212060-00007 DO - 10.1097/00002030-200212060-00007 ID - McClelland2002 ER - TY - JOUR AU - Rockhill, B. AU - Newman, B. AU - Weinberg, C. PY - 1998 DA - 1998// TI - Use and misuse of population attributable fractions JO - A J Public Health VL - 88 UR - https://doi.org/10.2105/AJPH.88.1.15 DO - 10.2105/AJPH.88.1.15 ID - Rockhill1998 ER - TY - JOUR AU - Heller, R. F. AU - Buchan, I. AU - Edwards, R. AU - Lyratzopoulos, G. AU - McElduff, P. AU - St Leger, S. PY - 2003 DA - 2003// TI - Communicating risk at the population level: application of population impact numbers JO - BMJ VL - 327 UR - https://doi.org/10.1136/bmj.327.7424.1162 DO - 10.1136/bmj.327.7424.1162 ID - Heller2003 ER - TY - JOUR AU - Heller, R. AU - Dobson, A. AU - Attia, J. AU - Page, J. PY - 2002 DA - 2002// TI - Impact numbers: measures of risk factor impact on the whole population from case-control and cohort studies JO - J Epidemiol Commun H VL - 56 UR - https://doi.org/10.1136/jech.56.8.606 DO - 10.1136/jech.56.8.606 ID - Heller2002 ER - TY - JOUR AU - White, R. G. AU - Orroth, K. K. AU - Glynn, J. R. AU - Freeman, E. E. AU - Bakker, R. AU - Habbema, J. D. AU - Terris-Prestholt, F. AU - Kumaranayake, L. AU - Buvé, A. AU - Hayes, R. J. PY - 2008 DA - 2008// TI - Treating curable sexually transmitted infections to prevent HIV in Africa JO - JAIDS VL - 47 ID - White2008 ER - TY - JOUR AU - Marino, S. AU - Hogue, I. AU - Ray, C. AU - Kirschner, D. PY - 2008 DA - 2008// TI - A methodology for performing global uncertainly and sensitivity analysis in systems biology JO - J Theor Biol VL - 254 UR - https://doi.org/10.1016/j.jtbi.2008.04.011 DO - 10.1016/j.jtbi.2008.04.011 ID - Marino2008 ER - TY - JOUR AU - Blower, S. AU - Dowlatabadi, H. PY - 1994 DA - 1994// TI - Sensitivity and uncertanly analysis of complex models of disease transmission: an HIV model, as an example JO - Int Stat Rev VL - 62 UR - https://doi.org/10.2307/1403510 DO - 10.2307/1403510 ID - Blower1994 ER - TY - JOUR AU - Lagarde, E. AU - Auvert, B. AU - Caraël, M. AU - Laourou, M. AU - Ferry, B. AU - Akam, E. AU - Sukwa, T. AU - Morison, L. AU - Maury, B. AU - Chege, J. AU - N'Doye, I. AU - Buvé, A. PY - 2001 DA - 2001// TI - Concurrent sexual partnerships and HIV prevalence in five urban communities in sub-Saharan Africa JO - AIDS VL - 15 UR - https://doi.org/10.1097/00002030-200105040-00008 DO - 10.1097/00002030-200105040-00008 ID - Lagarde2001 ER - TY - JOUR AU - Helleringer, S. AU - Kohler, H. AU - Kalilani-Phiri, L. PY - 2009 DA - 2009// TI - The association of HIV serodiscordance and the partnership concurrency in Likoma Island (Malawi) JO - AIDS VL - 23 UR - https://doi.org/10.1097/QAD.0b013e32832aa85c DO - 10.1097/QAD.0b013e32832aa85c ID - Helleringer2009 ER - TY - JOUR AU - Kretzschmar, M. AU - White, R. AU - Carael, M. PY - 2010 DA - 2010// TI - Concurrency is more complex than it seems JO - AIDS VL - 24 UR - https://doi.org/10.1097/QAD.0b013e328333eb9d DO - 10.1097/QAD.0b013e328333eb9d ID - Kretzschmar2010 ER - TY - JOUR AU - Zetola, N. AU - Klausner, J. PY - 2007 DA - 2007// TI - Syphilis and HIV Infection: An Update JO - Sex Transm Infect VL - 44 ID - Zetola2007 ER - TY - JOUR AU - Salomon, J. A. AU - Murray, C. J. PY - 2001 DA - 2001// TI - Modelling HIV/AIDS epidemics in sub-Saharan Africa using seroprevalence data from antenatal clinics JO - B World Health Organ VL - 79 ID - Salomon2001 ER - TY - JOUR AU - Marion, S. A. AU - Schecter, M. T. PY - 1992 DA - 1992// TI - Use of backcalculation for estimation of the probability of progression from HIV infection to AIDS JO - Stat Med VL - 12 UR - https://doi.org/10.1002/sim.4780120702 DO - 10.1002/sim.4780120702 ID - Marion1992 ER - TY - JOUR AU - Buvé, A. AU - Weiss, H. A. AU - Laga, M. AU - Van Dyck, E. AU - Musonda, R. AU - Zekeng, L. AU - Kahindo, M. AU - Anagonou, S. AU - Morison, L. AU - Robinson, N. J. AU - Hayes, R. J. PY - 2001 DA - 2001// TI - The epidemiology of gonorrhoea, chlamydial infection and syphilis in four African cities JO - AIDS VL - 15 UR - https://doi.org/10.1097/00002030-200108004-00009 DO - 10.1097/00002030-200108004-00009 ID - Buvé2001 ER - TY - JOUR AU - Ghani, A. AU - Swinton, J. AU - Garnett, G. PY - 1998 DA - 1998// TI - The role of sexual partnership networks in the epidemiology of gonorrhea JO - Sex Transm Dis VL - 24 UR - https://doi.org/10.1097/00007435-199701000-00009 DO - 10.1097/00007435-199701000-00009 ID - Ghani1998 ER - TY - JOUR AU - Pinkerton, S. AU - Abramson, P. PY - 1997 DA - 1997// TI - Effectiveness of condoms in preventing HIV transmission JO - Soc Sci Med VL - 44 UR - https://doi.org/10.1016/S0277-9536(96)00258-4 DO - 10.1016/S0277-9536(96)00258-4 ID - Pinkerton1997 ER - TY - JOUR AU - Holmes, K. AU - Levine, R. AU - Weaver, M. PY - 2004 DA - 2004// TI - Effectiveness of condoms in preventing sexually transmitted infections JO - B World Health Organ VL - 82 ID - Holmes2004 ER - TY - JOUR AU - Abu-Raddad, L. J. AU - Patnaik, P. AU - Kublin, J. PY - 2006 DA - 2006// TI - Dual infection with HIV and malaria fuels the spread of both diseases in sub-Saharan Africa JO - Science VL - 314 UR - https://doi.org/10.1126/science.1132338 DO - 10.1126/science.1132338 ID - Abu-Raddad2006 ER - TY - JOUR AU - Freeman, E. E. AU - Orroth, K. K. AU - White, R. G. AU - Glynn, J. R. AU - Bakker, R. AU - Boily, M. C. AU - Habbema, D. AU - Buvé, A. AU - Hayes, R. PY - 2007 DA - 2007// TI - Proportion of new HIV infections attributable to herpes simplex 2 increases over time: simulations of the changing role of sexually transmitted infections in sub-Saharan African HIV epidemics JO - Sex Transm Infec VL - 83 UR - https://doi.org/10.1136/sti.2006.023549 DO - 10.1136/sti.2006.023549 ID - Freeman2007 ER - TY - CHAP AU - Cuadros, D. F. AU - Branscum, A. J. AU - Crowley, P. H. PY - 2011 DA - 2011// TI - HIV-malaria co-infection: effects of malaria on the prevalence of HIV in East sub-Saharan Africa BT - Int J Epidem ID - Cuadros2011 ER - TY - JOUR AU - Wawer, M. J. AU - Sewankambo, N. K. AU - Serwadda, D. AU - Quinn, T. C. AU - Paxton, L. A. AU - Kiwanuka, N. AU - Wabwire-Mangen, F. AU - Li, C. AU - Lutalo, T. AU - Nalugoda, F. AU - Gaydos, C. A. AU - Moulton, L. H. AU - Meehan, M. O. AU - Ahmed, S. AU - Gray, R. H. PY - 1999 DA - 1999// TI - Control of sexually transmitted diseases for AIDS prevention in Uganda: a randomized community trial JO - Lancet VL - 353 UR - https://doi.org/10.1016/S0140-6736(98)06439-3 DO - 10.1016/S0140-6736(98)06439-3 ID - Wawer1999 ER - TY - JOUR AU - Kamali, A. AU - Kinsman, J. AU - Nalweyiso, N. AU - Mitchell, K. AU - Kanyesigye, E. AU - Kengeya-Kayondo, J. F. AU - Carpenter, L. M. AU - Nunn, A. AU - Whitworth, J. A. PY - 2002 DA - 2002// TI - A community randomized controled trial to investigate impact of improved STD management and behavioral interventions on HIV incidence in rural Masaka, Uganda: trial design, methods and baseline findings JO - Trop Med Int Health VL - 7 UR - https://doi.org/10.1046/j.1365-3156.2002.00963.x DO - 10.1046/j.1365-3156.2002.00963.x ID - Kamali2002 ER - TY - JOUR AU - White, R. G. AU - Orroth, K. K. AU - Korenromp, E. L. AU - Bakker, R. AU - Wambura, M. AU - Sewankambo, N. K. AU - Gray, R. H. AU - Kamali, A. AU - Whitworth, J. A. AU - Grosskurth, H. AU - Habbema, J. D. AU - Hayes, R. J. PY - 2004 DA - 2004// TI - Can population differences explain the contrasting results of the Mwanza, Rakai, and Masaka HIV/sexually transmitted disease intervention trials? JO - JAIDS VL - 37 ID - White2004 ER - TY - JOUR AU - Modjarrad, K. AU - Chamot, E. AU - Vermund, S. PY - 2008 DA - 2008// TI - Impact of small reductions in plasma HIV RNA levels on the risk of heterosexual transmission and disease progression JO - AIDS VL - 22 UR - https://doi.org/10.1097/QAD.0b013e328312c756 DO - 10.1097/QAD.0b013e328312c756 ID - Modjarrad2008 ER - TY - JOUR AU - Baeten, J. M. AU - Strick, L. B. AU - Lucchetti, A. AU - Whittington, W. L. AU - Sanchez, J. AU - Coombs, R. W. AU - Magaret, A. AU - Wald, A. AU - Corey, L. AU - Celum, C. PY - 2008 DA - 2008// TI - Herpes simplex virus suppressive therapy decreases plasma and genital HIV-1 levels in HSV-2/HIV-1 co-infected women: a randomized, placebo-controlled, cross-over trial JO - J Infect Dis VL - 198 UR - https://doi.org/10.1086/593214 DO - 10.1086/593214 ID - Baeten2008 ER - TY - JOUR AU - Celum, C. AU - Wald, A. AU - Lingappa, J. R. AU - Magaret, A. S. AU - Wang, R. S. AU - Mugo, N. AU - Mujugira, A. AU - Baeten, J. M. AU - Mullins, J. I. AU - Hughes, J. P. AU - Bukusi, E. A. AU - Cohen, C. R. AU - Katabira, E. AU - Ronald, A. AU - Kiarie, J. AU - Farquhar, C. AU - Stewart, G. J. AU - Makhema, J. AU - Essex, M. AU - Were, E. AU - Fife, K. H. AU - de Bruyn, G. AU - Gray, G. E. AU - McIntyre, J. A. AU - Manongi, R. AU - Kapiga, S. AU - Coetzee, D. AU - Allen, S. AU - Inambao, M. AU - Kayitenkore, K. PY - 2010 DA - 2010// TI - Acyclovir and transmission of HIV-1 from person infected with HIV-1 and HSV-2 JO - N Engl J Med VL - 362 UR - https://doi.org/10.1056/NEJMoa0904849 DO - 10.1056/NEJMoa0904849 ID - Celum2010 ER - TY - JOUR AU - Lingappa, J. R. AU - Hughes, J. P. AU - Wang, R. S. AU - Baeten, J. M. AU - Celum, C. AU - Gray, G. E. AU - Stevens, W. S. AU - Donnell, D. AU - Campbell, M. S. AU - Farquhar, C. AU - Essex, M. AU - Mullins, J. I. AU - Coombs, R. W. AU - Rees, H. AU - Corey, L. AU - Wald, A. PY - 2010 DA - 2010// TI - Estimating the impact of plasma HIV-1 RNA reductions on heterosexual HIV-1 transmission risk JO - PLoS ONE VL - 4 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0012598 DO - 10.1371/journal.pone.0012598 ID - Lingappa2010 ER - TY - JOUR AU - Korenromp, E. AU - de Vlas, S. AU - Nagelkerke, N. AU - Habbema, J. PY - 2000 DA - 2000// TI - Estimating the magnitude of STD cofactor effects on HIV transmission: how can it be done? JO - Sex Transm Dis VL - 28 UR - https://doi.org/10.1097/00007435-200111000-00001 DO - 10.1097/00007435-200111000-00001 ID - Korenromp2000 ER - TY - JOUR AU - Boily, M. AU - Anderson, R. PY - 1996 DA - 1996// TI - Human immunodeficiency virus transmission and the role of other sexually transmitted diseases: measures of association and study design JO - Sex Transm Dis VL - 23 UR - https://doi.org/10.1097/00007435-199607000-00012 DO - 10.1097/00007435-199607000-00012 ID - Boily1996 ER - TY - JOUR AU - Smith, A. AU - Tapsoba, P. AU - Peshu, N. AU - Sanders, E. AU - Jaffe, H. PY - 2009 DA - 2009// TI - Men who have sex with men and HIV/AIDS in sub-Saharan Africa JO - Lancet VL - 374 UR - https://doi.org/10.1016/S0140-6736(09)61118-1 DO - 10.1016/S0140-6736(09)61118-1 ID - Smith2009 ER - TY - CHAP PY - 2006 DA - 2006// BT - HIV/AIDS surveillance database PB - U.S. Census Bureau, Population Division CY - Washington, DC ID - ref91 ER - TY - STD TI - The pre-publication history for this paper can be accessed here:http://www.biomedcentral.com/1471-2334/11/216/prepub UR - http://www.biomedcentral.com/1471-2334/11/216/prepub ID - ref92 ER -